G97188


Basic Information

Item Value
gene id G97188
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000016
NCBI id null
chromosome length 12175457
location 5887681 ~ 5923379 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU110601
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>TU110602
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>TU110606
TTAATTTTAAGATTTTATTTATATATAAAAATCTACATGTAAAAACTGACAACACATGTACACCAAAAACAGACAGATTGTTAAATTCATTTGAGTAAAACATTGTAGTAGTAACCTTCTCTAAGACAAAACAACAAAACTTGTAAACATGATTTGTGTAACCCTTTTGCAAATGACTTTTCTTTTTCTGAAAGTAGCAGGTGCTGTGGTTCCTATTCTACAGTTGTGTTTAAAATGGCTTGAATTTACTGTAGTACATGAGTGTTGTTGTTTCCTCTTGAACACTGGCCGAAAAGCGGAGACTTTTGGCTTCATGTATTCTTTACTTTTTCACTACATTCAATGTTAAAACATTCAGTCAACAGGTTTTACCTGAATTATCATAGATGACACATAATTCACTGTATAAGATGATAGAAACACTGGATAAGTGATAGAAACAATCAGTGCAAAGACATGGTGCAGAAAAAACATCATACATAAAAAAGAGAACATCATATTAGCCATGTGTGTGTTTCCAAAACATTTCTTTTCTCCAACAGCAGCTTATCCATAACTGCATCCAGAAATCATGAGCCACTTTATCCAGAGAGCAACTTCTTTGAAACCTCATGCAAATGCCAAGCTTTTTTATCTGTGTAAAACAAAATTAGCATCCAAACTGATCAAAATTAGCATCCAAACTGACTTAAAGTCAAGGCAACACAGTGTAGCAGTCCTTTCCAAGTGGAGCCTTCTTTTGGCCAAGTTTTGTGGCATATTTAAAACAGATTTCTTGACTTTCACCAGATCAGACTGGATGTTATCCATAGAAAAGATAAGCTCCAGTGAGTGAAGCCAGTGCAACATGTCTTAGTATAGCTGTTGGTCGGACCAGGGTCAAGCTGTTTTTCTGTCTTTATCTCTCCTTCTATCACAGGATGTTGATCATCCACCGGTTCACGTTTCTCCACATTCTCTTCCTCCTTTGGATTTTCTTGATCCTCTTCATTTGGTGTGGGGAAGTTGCAGTGATGCTCTCCAAAAGCACAATTCAAATTGAGCCATTGTGTGAAGAAGGATGAAGTTAAGGAGAGAAGTCCTTCAGGCGATGACTGAACAGATGGGAAGTCATAAAGATCTGGCCGATCCGGGAATTTCTGTTTCCAAAAAAATAAAAAAATAAACACTGACTTCAATATGTAATACAGATCTACAATCTGTCATGCCTATGACCAAGAATGAAAAACTTACTGATACAACCTCTGATAAAACAGTATAGCAGCAAGAAGTATTGTATGATCAAAGCGTGTTACAAATAAATAATTGTATATGATGATATACCACTTTTGCTATGTTGTCCAGCGTGTAAATCAGCTCACTGATGAACCTGTACTTGAGGTGAACTCTACTGAGGTGCTGGAGGAGCTGACTCCAGGAATTAGACAGGAACACAGCAGCACTGAACACACAGCACTAAACTCACACACACACACACAAAACAGATGTAATTTTGAGCAAAATTAGGATGGCTGAGATGATAAACCAGGAGAAATTCTAGTTTTAAAAACACATGATAGGTTCTTAGAAATGTGATCTATCTATTCTTGTTATTTTCATACATTTGGGGCAAAGATATACCATATTCAACAGATCATTTTGATTTAATGACTCAAAATGACTAAAAATGTCATATGGTGTAACCATCAAGCATAGGATACATAAATAGCCTACTTTCCTTTCACCTTAATTTTCAAGAGTGTACACAATTTAATCATTATTGTCAAACAATTTGTCAAACATGTTTCAAAGTACTTTTTTTTGTCATGAATATAATGGTGTCTTATAGGGTTAGTTCACCCAAAATGAAAATTCTGTCATTAATTACTCACCCTCATGTCGTTCTACACCTGTAAGACCTTCGTTCATCTTCAGAACACAAATTAAGATAATTTTGATAAAATCCGATGGCTCAGTGAGGCAGTGTTGCCAAGTCTGTGGTTTTCCCACGGAATTGGGCTACTTTTACACTGTTGCCGTGGGTTGTTTTTCATGTCCGCGGGTTGAAGCGACCTGAGGAGCCCCGCCAAAAACGTAGATTTTCCCCCCGGAACGTGATTTTTACTGTGGGACCCCCGTGAAACGTGATTGGGCTAGTTTTGAGTTGCAATTGGGTGGGTTTTGTTGTGAAAACTTGGCAACCCTGCAGTGAGGCCTCCATTGCCAGCAAGTTGATTAACACTTTCAGATGCCCAGAAAGGTGCTAAAAACATATTTAAAACAGTTCATGTAAGTACAGTGCATGGTTCAACCTTAATATTATAAAGCGACGAGAATACTTTTTGTGCGGCAAAAAAACAAAATAACTTTTTAACAATATAGTAATGGACGATTTTAAAACACAGTGGTTCGGAGCACGTATCAAACTGCCAAAGTCACGCGAACCATTGAAATTTTGAAACACTTATGACGTTACAAAGCCTTATTTACTGAAATCACGTGACTTTGGCGATAAATGACTTTTGTCATAAAGTCATTATTTAGATTTTTTTTGGGCGCACAAAAAGTATTCTCGTCACTTTATAATATTAAGGTTGAACCACTGTAGTCACATTAACTGTTTTAAATATGTCTTTAGTAGCTTTCTGGGCATCTGAAAGTGTTAATTATCTTGCTGGCAATGGAGGCCTCACTGAGCCATCGGATTTCATCAAAAATATCTTCATTTGTGTTTCGAAGATGAACGAAGGTCTTACGGGTGTGGAACGACATGAGGGTAAATAATAGATGACATTATTTTCATTTTTGGGTGAACTAACCCTTTATGGTTACTCAATCTGGCCTAGGGCTGGGCCAAAAAGTCTTATCTCTGTATTTTTTGGCTAAATGGTGATATACGGTATATATCTCGGTATTTTCTACATTTTTCTATTTGGATTTAGAAAAAAAAAATCTGTATTTACTTTTTGAAAATCTTAATTTAACATCCTGCCTAATGTTGTCCTACAAACAGTGTTTATATTGAAAGCTATAAATACAAATATAGTGAATGTAACAATGTAGTCTGGCACACTAATAGGCCTACAGTATGTGTAAAAAAGATAAAGTTACTTTACATTCTAACATTGTAACATTACAATCTAAAGATAAAAATAATGCTTTTTAAAGCAGAAGTTGAATTCGCTAGACCAGTGGTTCCCAACCACAGTCCTGGAGGCCCTCCAACACTGCATGTTTTCCATGTCTCATTTATCAAACACACTTGATACAGATCATCAGCTCATTAGTAGAGACTCCAAAACCTGAAATGGGTGTGTCAGACAAAGGAGAGATTCAAAAGATGCAGTGTTGGGGGGCCTCCAGGAATGTGGTTGGGAACCACTGCACTAGACTAAAAATTAAAATAAAAACAAAAGCACAGACTAATTTGCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGCTAAATAATAATTATCAAAATGTATATTTCAGTCAGAATTATGGCGATCCCATTCTATTGCGTTCCGTCTGTTTGGCGCGGATGCGCGCGGCGGCGCTCGTTCACGGAAGTCTATGAAGTTTAGAGGAGAATGAGATTCGCTATCACAAGGCTCGTCCAATCCTGACAGCAAAATGGAAATATTTGTATGACTTTCTGACATTTACAGATGGAGAATATACCTGTGAAATGTAAGTTATGCGCTTAGGAAAACACGACATCACAAAAGCATTAAACAGCGCAAATGTCAGCACATGAATCTGTCAGAGCATCTGACGGGGCAAGCCGCTTTAAACGATAGGCCTACGTGTTAACTATATCTTAATCTTACGAGTTATTTTTAAAGCCCTTAATATTAAGCATGTCTCATGTTTAAGCCAAATTGTAATATGCATTTCCCCCGCAGTAGCACTCTGCGACGTCCACCGCTGTTTTTCAGATGCTCTTGTTTAAAATCTATCGATATAAACGGTATCGCCTCATTCCGTATCGTATATTAAAAATATATCGGTATATCGCAAAAACTCGATATACCGCCCAGCCCTAATCTGGCCTAAACAAAAAGTGTTTTTATAAAAACAATATTTCAATATTAAAATATTTTAAACAATATTACTTCACTGCTTTTTAAAAAGAAATTATAATAAAAAATAATGGCATTCTACTTGTCAACATTTTTTTTAAGATTTATTTATTTATTTATTTGCAATCTCCCACAATTACAACATCTGGATATTTTTAATAGTAGGCCCCATTAAGCTACCAAAAATTAATAAATTTAAATTAGATCACACAAAAAATGAGCGTCACTGACCCGTATTGAACTGTCATTCTTACCGGCTCATTGCACAGCGCGCTGTCGTTGAAATAGTGTGACACGACGTAGTTCTTCGGAAACACTTGTGGCTGCAACACATAAAATGTCAAATTGTGCATCCTTTGATCTTTACTTTAAGTTGCACAGGCTTCTCACACGTTACCAAAACCGCAGAACAACAATGAGGTTAGTAGCCTACAAAATGACACGGGACAGATAAATGAGATTGCGAACTTTCTAATAGACAATGAGCAGTTTTTTAAAGGCAAAACTCACGAATCCGTTCGTTCTTTCAATGTTTATAGTGTCCTGCAGATTTCTGATCGTCGTCTTCATAAAATCATTGCACCCACTTCCTTGAACAGTCAATATTGATAGAAGTAACAGCACTGAAAGGCAAACAATATGGGTTCAGAGTATTAAAATCCGTAAGATATTTAAAACTACGCATTATGTACTCTTGGTATCGCAAACACCATACACACTGTCTGTCTGAAAATACAACCATTTTAATACGCGCATCAATTGATGGACCTTCGTCAGTGCTGCACGCGAATCACATTACCTGTTGGTGACATGCTTCTACCGGCCAATGTGGCCCATATTCCCCATGTTCTTCTTAACCAAGTCCTTGTGCACGACAGATTGTTGCAGAAAAGTTGTGTAAGAATCTCAGTCTCA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU110601 False 2853 lncRNA 0.37 3 5887681 5923379
TU110602 False 5387 lncRNA 0.37 2 5887681 5893310
TU110606 True 5401 lncRNA 0.37 2 5887681 5893310

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000016_05871353_05874812 NA coding downstream 12869 5871184 ~ 5874812 (-)
CI01000016_05843077_05863364 TTYH1 coding downstream 24317 5842120 ~ 5863364 (-)
CI01000016_05824628_05826424 UBE2S coding downstream 61257 5823123 ~ 5826424 (-)
CI01000016_05804456_05811231 SHISA7 coding downstream 76450 5803128 ~ 5811231 (-)
CI01000016_05793987_05797545 NA coding downstream 90136 5793973 ~ 5797545 (-)
CI01000016_05930860_05934507 RCVRN2 coding upstream 7474 5930853 ~ 5934507 (-)
CI01000016_05945614_05946695 NA coding upstream 22180 5945559 ~ 5948309 (-)
CI01000016_05986400_05994821 TRIM109 coding upstream 63021 5986400 ~ 5994821 (-)
CI01000016_06018338_06023791 NA coding upstream 94951 6018330 ~ 6023791 (-)
CI01000016_06048748_06054049 RNF115 coding upstream 125361 6048740 ~ 6054049 (-)
G97185 NA non-coding downstream 584 5881377 ~ 5887097 (-)
G97255 NA non-coding downstream 52770 5834570 ~ 5834911 (-)
G97252 NA non-coding downstream 110013 5777404 ~ 5777668 (-)
G97215 NA non-coding downstream 314112 5566293 ~ 5573569 (-)
G97203 NA non-coding downstream 321528 5565197 ~ 5566153 (-)
G97282 NA non-coding upstream 29579 5952958 ~ 5959473 (-)
G97193 NA non-coding upstream 36962 5960341 ~ 5964341 (-)
G97201 NA non-coding upstream 60690 5984069 ~ 5984824 (-)
G97303 NA non-coding upstream 156895 6080274 ~ 6080496 (-)
G97310 NA non-coding upstream 171501 6094880 ~ 6095235 (-)
CI01000016_05412782_05415867 NA other downstream 469464 5412248 ~ 5415906 (-)
CI01000016_05325805_05330265 COX6B2 other downstream 556835 5325519 ~ 5332874 (-)
CI01000016_04921091_04922518 NA other downstream 964277 4918975 ~ 4922518 (-)
CI01000016_03921124_03930996 NA other downstream 1956630 3920055 ~ 3931162 (-)
CI01000016_03647744_03675574 NA other downstream 2222368 3647653 ~ 3675585 (-)
G97341 NA other upstream 235607 6158986 ~ 6159721 (-)
CI01000016_08893013_08893496 NPPCL, ANFC1 other upstream 2965454 8888833 ~ 8894737 (-)
CI01000016_08926089_08945071 NA other upstream 3013410 8925960 ~ 8945229 (-)
G98679 NA other upstream 3311617 9234996 ~ 9239929 (-)
G98691 NA other upstream 3332723 9256102 ~ 9257611 (-)

Expression


Co-expression Network