G101000


Basic Information

Item Value
gene id G101000
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000017
NCBI id null
chromosome length 2146858
location 1354231 ~ 1401351 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU114909
GACAAACCCAGCGACTGAGTTGTTTTAACCCAGTGGTTGGGTTAAATGTTTGCCCAATCTGCTGGGCAGTTTTATTTAACTCAACTATTGTTTAAAAATGAGTATATGGCTTGTATATGGAAATTAAAAAGAATTACTAGAGGCAACAATAATAATCAAAAGGTGAACATTTATTAATAAGCATTAATGTGTATTGTTTAATTATTATTCATTAAACGTATTCATAAATGTTTAATTATTAAATATATTAATAAATGTTAATTTCCAACATACTTTGGGTTCATTTTAAGCAAGCAGTACAGTAATTTTTAAACAATAGTTGATTTAAATAAAACTGCCCAGAAGGTTGGGCAAACATTTAACCCAACTATTGAGTTTGAGACAGTCTTTTTGAGCAAGATGTGCATTTTCAGCGGTGTTACCGCGAGGCAAGCGCTTTTCACAGAGCATGCATGAAAACATGCATGTGAGCGTTCAAAAGGAGCTGCATGTCAGTCAGACAGAGACTGATGCTGCACAAAGAAGGAGACTGTTGCATTTTGTAATTTAGCATTGAAGAAATAGTACTTTTGGCATCCCCGCTGTCATATAAAAGGTTAATGGCTGTATACTGAAGCGTGCATCATCCATCCATTCATTCATTCCTCCCTCTCTTGTTTTAATGTCCTGTTCTTATTCCACAGTGTTCCTCTCTTCTTACATTACTCTGCCTGGGGGAGGCTTCCCTCCCGTCCCCGCTCTCTTTCTTCTGCTGATCATTTGTTCATGCATCTGCAGTGTAAACACCGCTCTCTTACTCAGCACTCTGCACGAGGGTCTGGAATGGTGAACAGTAATAGCTAATGCCTGTGGGTGGAACACATACTGTGTGTAATGCCAGTGCAGCGCGAGGCATGGCAGAGGGAAGGGTGCTTGTCTTTATATGTCTACTCAGCTAAACACCAACCAATTATCTCAATCACTGTTGTGTGAACAGGGTGTTGGCAAGAAGTTAAAAATAGACCCGTCTCAAACTTTTAACAGTCAAGCATGTGCAAACGGTTTAATGTTGGATGCCTCTAACTTCTGTGCATTTGAACTCTAAAGGAGACAAGAACAATGGGGAAAACATTTAACGATGGGGAGAGCATTTATTATAGCTTGTCAAATTTGCCCCTATTTCTGTGTGTCTTTTTAAATGCAAATGAGCTGCTGCTCCCGGCCCCCTTTCCAGAAGAGGGCGGAGCTTTAACAGCTCGTGCTTCGGTCGCTCAACAACAACAAAGCTGGAGAATCTCACGCAGCCAAAATGAGGATTGTCAGTAACGGTGTTCAGCCTTACATTGTTCAAACCGGAGTCGACACTGATGGAGAGACTCAGGAAGAAGTTACAACTTTTAGAATGAAACTGGACGTTTCTGAATAGTTAGTCGATAAATTTATGTAGTTGCTGTGGAGTTGATTCAACTCATCCACTAGCATGTGCCGTCATGTTAATCTTTTTTTGTTGAATTAACTCTCGTTTGTGAAGCAGTCCGGTGTAAAATGACGGCATGACAACAACACTCTACTACAACAACTCTTCCTCTTCTCTAAAGCAGCCCAACATGGCCTCACCCCCTTTGTTGTGTGTTCCCGGGGCCGGGTTTATGTAAATTTTAGGGTTAGTGATGTCACCAACCCGGGAAGAAGCTCGTTGTAGTCCCTACCAGCTGTTTGTTGTAGTCCTTAAACAGAGATTTTTGTAAAAGAAAATATCTCCCTTTACATTGAACTTTGATCGTTGTAACTTTGCAGATGTTGTTTATGATCAAACAGCAACATTACACACTAACTAAAGTTAAAAAAAGTGAAATCATAATCAACCACCCCAAGGCATTATGGCAGTATAATAATGTTAATATATCAACATGTAAACTACTACAATCTGATTTGAATCTCAAATTATAATGAATATCACAATGTACTGAAAACAATTTGGATTTACTTCGCTAGAAAATCTTACAAAAAATTACAAAGAAACTATAAGTAATACATTGGATTAAACAGGAAATTTTAAAGTAGAAAGACTGAAATTGTATTTTCTTGCAAAATGTAGTAAAAGGCTACATGATGAATTAAAGTTTAGCAAATTTAGCTAATTGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATGAAAACATCACTTTAACCTTACTATACTTTAACATTTACTATAAAATTGTATGTATTCTATAAAAAATGTATTCTCCAATTAAATCTAATGTAATTTCCCACCATATGGCAAGGTAACTTTTTGCTTGACCTTTCCAGTGCTAAATGGACAAACATATATATTTACAGTGCAGAGAAAGTGATTTTTGCATTTCTTTGGTTACAGTACGTCTTCTCCCTGTTTTCACTGATTTCAATGATTTATTTATCATTCTCTGTTCGCCTCTGTGATCTGAACACATAAAGCGAAGGCATGCAAGATAAATATCCTCAAAATATCCTCATTTAGCTCTTTTATTAAAATATAATAACGTGTTTGAAGTTGATGTTCTGAAATCTTCATATAGAGAATATAATAAGTATCTTTATTCATGATTGGTTCTTCGACGGAAATATTTACTTACATCACAGTTTGCTCCACATATGAAATGTATTAAATAATGCAGAGAATTTTTCACAATATCTGTATTATTCATACATCATATTGAGTTATTACAGAAAGCAATACATTTGTGGGATGATAGTAGTAAACAAGAAGATGAAGGGTCAAACTTTCCATGCAATGCAAAACAAAAGCGACACAAGCCTAATGGAATAAATCAGTTCTCATCTCTTGTTGGTTGTATCTGCTTGTATACATGATTTCTGCACCTCCCGTTGATATGTATCATAGTTGAAAAATAATGATGTGCTTGGACTGATTGTTGGCGACAGAGAGATGTTTATTAATGCATCGTGCTACAGTAAGTGTGGTTATGATAGACAGCTCTATTTGCAGTGACTGTATGAATCCATCCTCTCATGTAGCTGTGTAGTCGATCAACACGCCGTTTGCTATAAGCTGCTTTAGAGTGTTGGATTAAAGGCAATTAATAAGGATCAGGTTACATACTTACAGCTACAATAAAGAATGTATTAAGTTAACAATCATAAAATGAACTCAAAGTAAACCCTACTTTAAAGGGGACATATTTTGCTTTTTTTACATTTTATCTTTCTTTAGTGTGTAATGTTGCTGTTTGAGCATCAAAAAGCTCTGCAAAGTTCCACTTATTCTCTACATCAGTGTCAGTGTTTCTGAACTCCCTGAAATGCCTTCCAGGAACAAACACGTCATAATATTCCTCATTTAAATACTTAATACGCAGAATAAAGGGGCGAGGCCTGGTTGAGTTAGTTAGTATTGTGTTGAAACTGGCGGTTATGGTAAGGGGCGGGGGACATTTCCCAAACACTAATCACAACACACCGCTCCAGCCGACCAATCAGAGCACATTGTGCTTTTCAGAAGGAGGGGCTTCATAGAGACAGGAACTAAACAGAGCGTTACTGACAGACTGGGAAGAGAGGAGCTGAACAATGGAGAATATGAGGAAAATAATCAACTTTCAAGCAGGAAAACCTGCTCTAGTAGAGCACAAAAACCAAAGACTTTGTAAAATGGCAAATGGCCCCTTTAATTTATGGACTACATACTTTATTCGAACTGTCCAATCTATTTGAACAAGGACTCTTTTACATGTAAAGTAAGATCATAACTGAAGCTTAATGGCTAGTAATTATATTCTGCATGAATGCACAATGCTTTGAAACTTCATTGTGTTTGCAACATTTGTCTCGCTTCTTCAAAGTCAAAGATCTGCAGCTCGTGTTTGCGAGGGACTGAGATTTCGACCGAACACAATGTGCCACAAAAGCCTCTTGCCAAAAATAGCCGATCAATCTTCTTCTCAGCATTTGATTACCTCACTTCCTGCGTCAGTGTGGGAAAACGTCCAGAGTCTAATGGTTTAAGTGCTGACTTTCTTTACCTGTGACCCAAACACTCTTCTCTTTATGATTTCTCTCTCTTCCAAAAGGCATAAGGCAGTTTATTTCATCGAGTCTATCAGATGTGACTCATATTTACAAATTCATAATCATTAAGCAAGGAAGGCTGTCGGGAAATGAGCAGAAAACATGAGCTTTATATGACTGATGATGCCAAATGGATTGTATGATGATGTGGTGATTATGACAACAGCCATGATCGTCATGTTTTCAAATAGTTGATTTCAATCTGAAGTTTATTCTCCAATACTATTACAGAATCCTCCGTTCATTAAATGTTACTAACGAGCCCTAAAGTCACCATGAAATAAAAATGGACAGTTCTTATTTTTTTGTGGAATATTGCAGTGTTTATTTTAAATAATTTATCTGTGCATATCATTATTGTTTTAAATTCATGTTCCTCGTAATCCCCTCCCTCTTGCAGCATCTCTTCTCTTCTCTGATGACGAGGGCGGGGCAACCTGTCACTCACATGAGATCCACCAATAGCAAACCACCACCATCCAATCAATTCCCCACAGACAAAATCAAGCCCCGCCCTACATTTGTTCTTGTTCCAGAAGCGTTTCTCTCAGATATACGGCACAAACTGTGGCTTTTTGTGTCAAACATGAAGTTGGTTTGTAAAATAAAGAGAGATCACACAAAGTACGTCAAGTATTGAAAACAGATGCACATAAGAATGAGACAGGGTTGATTTGTCTGGCTGCTTTACAACCATTTGACTATTAAAGCCATTAGGCAACCCAGATGGTTATTAGGCAAGAAGATCATTTGTATGTGGACGTGCAGTTAAGTATTAATATTTTATGTCTAATTAAAAATGCATCGATGAGGGCTTTCATTTATAGATTTTTTTCTTTATTGTTTGTGTGCATCAGATGTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU114909 True 4906 lncRNA 0.37 3 1354231 1401351

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000017_01104045_01131388 NA coding upstream 222766 1104045 ~ 1131465 (+)
CI01000017_01067189_01070509 NA coding upstream 283637 1067052 ~ 1070594 (+)
CI01000017_01057310_01063843 NA coding upstream 289905 1056229 ~ 1064326 (+)
CI01000017_00969981_00977045 NA coding upstream 377003 969930 ~ 977228 (+)
CI01000017_00722020_00762518 NA coding upstream 590858 722020 ~ 763373 (+)
CI01000017_01534818_01538322 NA coding downstream 132925 1534276 ~ 1538593 (+)
CI01000017_01605157_01612590 NA coding downstream 203806 1605157 ~ 1613008 (+)
CI01000017_01654491_01655975 NA coding downstream 253059 1654410 ~ 1656182 (+)
CI01000017_01737674_01834279 GNAL, GNAL.S, GNAL2 coding downstream 335214 1736565 ~ 1834374 (+)
CI01000017_01910759_01910947 NA coding downstream 509408 1910759 ~ 1911056 (+)
G101091 NA non-coding upstream 144382 1176156 ~ 1209849 (+)
G101059 NA non-coding upstream 159623 1191273 ~ 1194608 (+)
G101067 NA non-coding upstream 206004 1147926 ~ 1148227 (+)
G101039 NA non-coding upstream 263655 1088388 ~ 1090576 (+)
G101035 NA non-coding upstream 277557 1022029 ~ 1076674 (+)
G101002 NA non-coding downstream 2109 1403460 ~ 1450896 (+)
G101003 NA non-coding downstream 15818 1417169 ~ 1419192 (+)
G101004 NA non-coding downstream 18326 1419677 ~ 1427727 (+)
G101181 NA non-coding downstream 183958 1585309 ~ 1585564 (+)
G101187 NA non-coding downstream 195044 1596395 ~ 1596614 (+)
G100957 NA other upstream 384912 927083 ~ 969319 (+)

Expression


Co-expression Network