G101004


Basic Information

Item Value
gene id G101004
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000017
NCBI id null
chromosome length 2146858
location 1419677 ~ 1427727 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU114914
TCTGCAAATGGGTCATTGACAAATAAGGTTTTTAAAAGTGTAAAAAAAAACATAACGGAGATATAATTAATTTTGAAGTTTTATTAAGTGTTAACAACGAGATCATGTGGTTTTTATAATCAATTAACACTGCTTTTGTCATTTTTTACAAGATGGACAAAATTTGTCACCAAAAAAGTCATTCGGTTTAACCAAAATTTCGGTTATACCGAATGACAATATTTTCAAACAATGCTAACAGGCTGATATCTAGCTAGCTAGCAAAAGAACAATCAAACATTTTATATTTAGTACAAGTTTTTAAAATATTACAACATTTTCCATGTTTTGTAGTGGTTGAATGACCTGAAGTTTCGGGACATGCATTTTTCAAATAGTTAAGAGAGAGTTAGTTACTTTGCTTCATGACCATGTGGTCCTTTGCAGGTGTCTGAATGATGTCACATCCTGTCACATGATATTGACCGCATGACTTGATCCAAAATGGTCCCTTTATATTGGTTACTCCGGATGACATCAATGAAATTCATTTTTCAAGACATTCTTTCTCATAACAAAGCAACGACTTCTACACATAATTTTAATACCATTTTGCACTATGTTGATATATGATGTTATAAAATCATGCCAGAATAAAAATATATACATTTATTCCATTTTAAGATATTTTAATCACAAATGAAATGGCTGTATTTGCCTTTGGACGGTTAAACCAAATGACCTTTTGACACTTCAAAATCTTTAAAATACCTTTATATGTAGAAAAATATAATTAAAACCTTTTGGATTCGATAAAAGAGATCTAGTTGTACTACCTTACATACTTTGGATGGCATATCTTTTTTTTTATTATTATTAAGGCCTTTGGACAAAAAAAATGACCCGTCACGTCATTGACCCAAATACAGTTTTTTTATATTATTTTATGATTTAAAGTACAATTAAACATTCAATATAATTAAGCACGCTATAAGAGTTACCTTTTCTATACTGGATCCATCTGATGGTGTCTTTTGGCTAAGCTCACTAGGTTTTAAAACAGAGCAAACATGTCTCTCTTCATGTTAATCAACCCTTCATCTCCATTTCCAAAACCAGCTGGGCCTCAGCAAATGGTCTAGCTTGCTCATCTACTCCTGTCATCTTTCTGGAGAGCTCAGATGAGATATGCTTTATTTAGACAACTGCCAGAAAGTCTCTCTCACAGCAATCCAGAACATGAAAATATACAGTATAAAGTCCATTCAATAGCATTTAATAACAGAGGCCAAAAATAGCCTCTTCCAAACACACGCTCATCTAAACAGCCATAAAAACCAAGAGAGATATAGTCTAGCTGAGAATCTAATGAAGCTTTACAGCTGACCTTCAGCCACCGAACTCAAGGAGGAGCAGAAGAGCTATAGTGAAACAGTTGTGTTGGGAAACACCGTCCTGGAGATGCAGAAACGCCGTGTCTGCAGAAGAGAAAACAATGAAATCACTCAGGAAATGAAATCTTCACACCTTGTGATTTAGTGCGCATCTTTCAATCCGGTAAACCTCCGAGAGAAGAACTCAATCAGTCAAACGCTTTTCTGGTCTCAAAGGTGAAACGCACACCAGTGATTATTGTCTCGCTAATTAATAATTACAATTCATACTCCTTTGCACAGAAATGACCTTGATACTGTCTGGAAATTGAATTCGGTGATACCCCCAAAGTAGATCCATCTCCATTAGAGCGGAGTTTAAAAAATAATTGTAATTTATAATTCATGGGCCAAAACCCTGCTTTTTCGCAGCAATTCGGCCCAGAAAGATTGTGTGGCATCATTAAATTTCAAACCGGCCACCGTCGGATTCCAGTACGGAGAAACATGAGAGATTTAAGTGTGTGAGCGCTCATGCACGTCTGCGCTCAGGTACGGCCGTCTGACATTGGGCTGTGGAGAAGCCGTAATATATTGTTGCCGTATAATTACCGGGCACGACCGAAGAGCTGAATCCCATTTCTAATTTCCATCACTGTCACCCATTCCATTTGTGTGATAATACATCCTTCATAATTTATGAGGGCCCATTTCTCCAGCCGTGTTGCTGATAGTGGGTCTGATAAAGCCTGACAATTCCCTCCTCTGCTCGCTGACTTCTCTTCTCCCAGACCGATCCGTTCGCCCTGCACAGCCCAGTGGTTCTGTTATTGCCCGTGCCCATCATCTCAAATATCCCCTCTTCACCGGGCCGGGATGAGGCGGCTCTGCTCACTTTGTGAGAAATTATGCACCATTAGAGGGAGCCTCAGATGTGGCGGGGATTAAAAAAAGCGTAGCACACACTCCAGACATGAAGCCACAAATTGGTGTAATTCAAACGGGGAAAGGCACGGCTTTTCTTCAGCGGTGACAGGGCAATGCATCGCTTGTTTGACACAAATATTTACGCGGAGAAATCACATTTGATGAGTGCCAGAGCCCTGCGACAGGATGTGTTTTTCTGTAAGAGCGGTAATACACGGAGGCGGATCTGCTGGAAGAGGAGAAATACCCACTGGAATTTTCTTTTGATCCATAGGAATGACAAATGACATATATGATATAACACATCTTAATTACTATTTTCAAAAAGGTTTTTAAATATATTTTTTCATGGTAAAAAGTATTATAATTAAATTTCAATGTATAAAAGTCAAATTATCTGACATTTTAAGAGAGTTATCTATCTATCATCCATCATCCATCCATCCATTTATCCATCCATCATTCTATTGTTTAATCCATCCATCCATCCGTCCATCATCTGCCTCTCCATCCATCCATCCTCTGTCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCATTCCAGCATTTAATCCATCCATCCATCCATCCATCTTTCTATTGTTTAATCCATCCATCATCCATCCATCCATCCATCCATCATTCTAGTGTTTAATCCATCCATTCATCCATCTATCCTCTGTTTAATCCATCCATCCATCCATCCATCATTCTAGTGTTTAATCTATCCATCTATTCTCTGTCCGTCCATCCATACGTTCGTCCGTCTGTCTGTCATTCTAGCGTTTAATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCATTCTAGCGTTTAATCCATCCATCCATGCATCCATCCATCCATCCATCTGTCATTCTAGCGTTTAATCCATCCATCCATCCATCCATCATTCTATTGTTTAATCCATCCATTCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCGTCATTCTAGCATTTAATCCATCCATCCATGCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCTGTCATTCTAGCGTTTAATCCATCCATCCATCCATCCATCATTATATTGTTTAATCCATCCATCCATCCGTCATTCTAGCGTTTAATCCATCCATTCATCCATCCATCGATCCATCCATCCGTCATTCTAGCGTTTAATCCATCCACCCATCCATCCATCATTTTATTGTTTAATCCATCCATCCATGTTCCAACCACACAATTTTGCTATGCCGTTTTTTGTTGGAACTATAGTTTCGGGAAACACTGACTTGCGACCATAGTTGGCTAACGATGCTTTCGGGAAACACGCCCTTGTTTAGTTCCTGTCTCTATTAAGTCCCTCCTTTTGAAAAGCACAATGTGCTTACCATACCCCTTACCATAACCGCCAGTTTCAACACACTACTAACTAACTCAACCAGGCCCCGCCCCTTTATTCTGCATATTATTTAAATGAGGAATATTGTGAAGAAAACTCAACAATACAATGGAGGCGTTTCAGGGGGTTCAGAAACATTGACACTGATATAGAGAAGAACTCCTGCTGGAGGGACTGGAGCAACATTACACACTAAAGAAAGATGAAGATGGAAAAAAGCAGAATAGGACCCCTTTAATGTATTTTTGAGTAATAAATAGAATCGAGTTACTGAATGATCTTATTTTGTTTCTGTTCCTCTGTTATTTTACCAGAAACATCTGTGATACATTTGATACTAGAATGAAAGATAGCTGAGAAGTCCTGTAGGTCTCCTGAGATATGAAAGAGTAATACAAATCTTCTAGGACGTGTCTTCCTGGGTCAAAGATAAGCATGGCGTGTAACAGTGACTGTAAGACTGCAATGAAGAGTGACAGCCCGCAAATGCTTGGCTAATTGAAAGACAGAGGGCATAATTAGCCACCGAAGAGATGGGAGAGATATGCTTTCACTGGAGATGCTCAGCCGGTCAGGTGTTTGTTTGCAGGTAATTAATCTCCTGCCTAATGTCTGTGTGTGAAGGGTGCAATATTTAGGGCCTTTCAGACTGAGAATGATTACTTGTTGATAAGTTAATGACTTTGGATACTGCGCAGTTTAATTACATAATGAATCAGTTTTACGGGAACGCTGCTTTTGCATTGCTGAGCATTATTCATCAAGTAATATTACAGGGTTAGCAAAAGTTCATTCGACAACATTTGTGGCACAATGTTGATTACCACTAAAATTAATTTCAGCTTGTCCTTATTTTTTTTTTAAAGCAAAAATCTATATTAAACTGAGGCACTTATAACAGAAGTGAATGGAGCGGATCCACAAATGTAAAAACACTCTTGTTTTAAAAGTACAGCCACAAGACGTCAACTATATGCGTGTTAACATGATTAAAGGGCCATGAATTGAGAAATCAGATTTTCCTTGAGCTTTTGATATAAAAAGGTCATGCTACAAGAATATCCTGTAAGTTTCAGAACTCAAAATTTTCTTGTTATTGAAACCAAGCCCAGATTATGACTCGTTGTGGAATGTGCCTATTTATTACATCATAGAGAGGTAAAAGACCGCCTCTCAAAATCACCAGTGATTTCTGATATGCAATGATTCATGTACAGTCAGATGCTCTTTGTCTCAAAATCATATTGTCAGTAAATCAAACCAGTGACTGTTGACGGCCAACTTCATATTGTTTCTCTTAGTAGGATGAAAATAATCTATTATTTAA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU114914 True 7632 lncRNA 0.37 2 1419677 1427727

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000017_01104045_01131388 NA coding upstream 288212 1104045 ~ 1131465 (+)
CI01000017_01067189_01070509 NA coding upstream 349083 1067052 ~ 1070594 (+)
CI01000017_01057310_01063843 NA coding upstream 355351 1056229 ~ 1064326 (+)
CI01000017_00969981_00977045 NA coding upstream 442449 969930 ~ 977228 (+)
CI01000017_00722020_00762518 NA coding upstream 656304 722020 ~ 763373 (+)
CI01000017_01534818_01538322 NA coding downstream 106549 1534276 ~ 1538593 (+)
CI01000017_01605157_01612590 NA coding downstream 177430 1605157 ~ 1613008 (+)
CI01000017_01654491_01655975 NA coding downstream 226683 1654410 ~ 1656182 (+)
CI01000017_01737674_01834279 GNAL, GNAL.S, GNAL2 coding downstream 308838 1736565 ~ 1834374 (+)
CI01000017_01910759_01910947 NA coding downstream 483032 1910759 ~ 1911056 (+)
G101003 NA non-coding upstream 485 1417169 ~ 1419192 (+)
G101000 NA non-coding upstream 18326 1354231 ~ 1401351 (+)
G101005 NA non-coding upstream 23833 1394016 ~ 1395844 (+)
G101143 NA non-coding upstream 61978 1312727 ~ 1357699 (+)
G101091 NA non-coding upstream 209828 1176156 ~ 1209849 (+)
G101181 NA non-coding downstream 157582 1585309 ~ 1585564 (+)
G101187 NA non-coding downstream 168668 1596395 ~ 1596614 (+)
G101007 NA non-coding downstream 196842 1624569 ~ 1625221 (+)
G101199 NA non-coding downstream 234833 1662560 ~ 1666903 (+)
G101830 NA non-coding downstream 275772 1703499 ~ 1703994 (+)
G100957 NA other upstream 450358 927083 ~ 969319 (+)

Expression


Co-expression Network