XLOC_008120


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_008120
gene name NA
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007125.7
NCBI id CM002898.2
chromosome length 52660232
location 46074311 ~ 46113404 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00015841
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>TCONS_00015842
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>TCONS_00015843
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000071353

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00015841 False 6345 mRNA 0.40 8 46074311 46113404
TCONS_00015842 False 3428 mRNA 0.41 5 46088542 46113321
TCONS_00015843 True 700 mRNA 0.49 5 46094881 46113351

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_008119 elf2a coding downstream 3509 46047761 ~ 46070802 (-)
XLOC_008118 NA coding downstream 28407 46043869 ~ 46045904 (-)
XLOC_008117 macrod1 coding downstream 106330 45789454 ~ 45967981 (-)
XLOC_008116 si:dkey-226n24.1 coding downstream 371590 45698879 ~ 45702721 (-)
XLOC_008115 NA coding downstream 434505 45630531 ~ 45639806 (-)
XLOC_008121 NA coding upstream 1256 46114660 ~ 46117359 (-)
XLOC_008122 mlsl coding upstream 43975 46157379 ~ 46173265 (-)
XLOC_008123 zgc:113425 coding upstream 77403 46190807 ~ 46198373 (-)
XLOC_008124 setd7 coding upstream 86537 46199941 ~ 46213571 (-)
XLOC_008125 si:ch211-113d11.5 coding upstream 107600 46221004 ~ 46228094 (-)
XLOC_007641 CU855896.1 misc downstream 43666471 2407736 ~ 2407840 (-)
XLOC_007640 CU855896.2 misc downstream 43666880 2407328 ~ 2407431 (-)
XLOC_007639 CU855896.3 misc downstream 43667239 2406945 ~ 2407072 (-)
XLOC_008109 dre-mir-194b non-coding downstream 605280 45468955 ~ 45469031 (-)
XLOC_008104 NA non-coding downstream 1097237 44975416 ~ 44977074 (-)
XLOC_008100 CABZ01078505.1 non-coding downstream 1557163 44517029 ~ 44517148 (-)
XLOC_008131 NA non-coding upstream 320078 46433482 ~ 46437896 (-)
XLOC_008135 NA non-coding upstream 388475 46501879 ~ 46502192 (-)
XLOC_008136 NA non-coding upstream 417515 46530919 ~ 46533561 (-)
XLOC_008137 NA non-coding upstream 516497 46629901 ~ 46675850 (-)

Expression


Co-expression Network