G111288


Basic Information

Item Value
gene id G111288
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000020
NCBI id null
chromosome length 7209782
location 3003380 ~ 3014892 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU126459
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU126459 True 11477 lncRNA 0.40 2 3003380 3014892

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000020_02865197_02919405 CHCHD3, CHCHD3A coding upstream 83975 2865197 ~ 2919405 (+)
CI01000020_02633932_02637797 MEST coding upstream 365374 2633932 ~ 2638006 (+)
CI01000020_02627995_02631513 NA coding upstream 371510 2627995 ~ 2631870 (+)
CI01000020_02569281_02578301 ATP2B3, ATP2B4, ATP2B1B coding upstream 424539 2568613 ~ 2578841 (+)
CI01000020_02514166_02557008 NA coding upstream 445841 2514105 ~ 2557539 (+)
CI01000020_03189213_03235363 NA coding downstream 173213 3188105 ~ 3235432 (+)
CI01000020_03264878_03271412 NRF1 coding downstream 249225 3264117 ~ 3272069 (+)
CI01000020_03343617_03348546 KLHDC10 coding downstream 328725 3343617 ~ 3348555 (+)
CI01000020_03379393_03391963 SLC26A5 coding downstream 364501 3379393 ~ 3393102 (+)
CI01000020_03397866_03404516 PRDM4 coding downstream 382974 3397866 ~ 3404710 (+)
G111331 NA non-coding upstream 42313 2960859 ~ 2961067 (+)
G111326 NA non-coding upstream 66003 2937171 ~ 2937377 (+)
G111324 NA non-coding upstream 71690 2931301 ~ 2931690 (+)
G111245 NA non-coding upstream 173180 2796035 ~ 2830200 (+)
G111293 NA non-coding upstream 187760 2815236 ~ 2815620 (+)
G111287 NA non-coding downstream 15035 3029927 ~ 3067810 (+)
G112659 NA non-coding downstream 194548 3209440 ~ 3209712 (+)
G112699 NA non-coding downstream 247570 3262462 ~ 3262672 (+)
G112702 NA non-coding downstream 269809 3284701 ~ 3284907 (+)
G111183 NA other upstream 344467 2647511 ~ 2658913 (+)
CI01000020_02444149_02444833 NA other upstream 553573 2443278 ~ 2444944 (+)
CI01000020_01375811_01378288 AVPR2L other upstream 1625031 1373164 ~ 1379068 (+)
CI01000020_01083614_01106789 PLXNC1 other upstream 1916607 1083230 ~ 1107257 (+)
CI01000020_00810993_00815495 CDPF1 other upstream 2186870 810899 ~ 816510 (+)
G112679 NA other downstream 286279 3301171 ~ 3303730 (+)
G112753 NA other downstream 699489 3714381 ~ 3733586 (+)
G113050 NA other downstream 1411766 4426658 ~ 4439762 (+)
CI01000020_04760482_04774849 NA other downstream 1745120 4760012 ~ 4776083 (+)
CI01000020_04807118_04808453 NA other downstream 1792135 4806765 ~ 4809414 (+)

Expression


Co-expression Network