XLOC_008379


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_008379
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 15347642 ~ 15351457 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00018912
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>TCONS_00018911
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00018912 False 3562 lncRNA 0.39 2 15347642 15351457
TCONS_00018911 True 3695 lncRNA 0.39 2 15347642 15351457

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_008378 camkk1b coding upstream 16141 15314189 ~ 15331501 (+)
XLOC_008377 c2cd3 coding upstream 35874 15258758 ~ 15311768 (+)
XLOC_008376 med29 coding upstream 110431 15232855 ~ 15237211 (+)
XLOC_008375 si:ch211-149e23.4 coding upstream 128686 15173611 ~ 15218956 (+)
XLOC_008374 CR936977.2 coding upstream 383401 14861335 ~ 14964241 (+)
XLOC_008380 si:ch211-105f12.2 coding downstream 24150 15375607 ~ 15381879 (+)
XLOC_008381 ca4b coding downstream 39425 15390882 ~ 15401917 (+)
XLOC_008382 dhrs11b coding downstream 52103 15403560 ~ 15408113 (+)
XLOC_008383 zgc:92630 coding downstream 64166 15415623 ~ 15437530 (+)
XLOC_008384 NA coding downstream 99346 15450803 ~ 15452516 (+)
XLOC_008463 BX663520.1 misc downstream 5900734 21252191 ~ 21252282 (+)
XLOC_008368 NA non-coding upstream 1097713 14249389 ~ 14249929 (+)
XLOC_008363 BX927244.2 non-coding upstream 1294176 14045121 ~ 14053466 (+)
XLOC_008361 CABZ01056919.1 non-coding upstream 1389792 13957722 ~ 13957850 (+)
XLOC_008360 CABZ01009247.1 non-coding upstream 1822654 13524874 ~ 13524988 (+)
XLOC_008359 CABZ01009248.1 non-coding upstream 1838274 13421514 ~ 13509368 (+)
XLOC_008388 NA non-coding downstream 278049 15629506 ~ 15665686 (+)
XLOC_008390 NA non-coding downstream 427531 15778988 ~ 15782552 (+)
XLOC_008393 NA non-coding downstream 635597 15987054 ~ 16018789 (+)
XLOC_008394 BX511308.1 non-coding downstream 684412 16035869 ~ 16045504 (+)

Expression


Co-expression Network