XLOC_008518 (LRRC75A)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_008518
gene name LRRC75A
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 24691088 ~ 24744920 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00017039
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>TCONS_00017040
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>TCONS_00017041
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Function

symbol description
lrrc75a Orthologous to human LRRC75A (leucine rich repeat containing 75A).

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040801-148 Predicted to enable receptor tyrosine kinase binding activity and signaling adaptor activity. Acts upstream of or within myoblast fusion. Orthologous to human CRK (CRK proto-oncogene, adaptor protein).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000055635 ENSDARG00000076834

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00017039 False 5175 mRNA 0.43 4 24691088 24736305
TCONS_00017040 False 5085 mRNA 0.42 3 24704798 24738121
TCONS_00017041 True 3346 mRNA 0.42 3 24737599 24744920

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_008517 poldip2 coding upstream 828 24676905 ~ 24690260 (+)
XLOC_008516 smtnl coding upstream 19669 24644016 ~ 24671419 (+)
XLOC_008515 NA coding upstream 72444 24616570 ~ 24618644 (+)
XLOC_008514 dhrs13b.1 coding upstream 89997 24572926 ~ 24601091 (+)
XLOC_008513 dhrs13b.1 coding upstream 122026 24563504 ~ 24569062 (+)
XLOC_008519 ywhae1 coding downstream 1524 24746444 ~ 24754895 (+)
XLOC_008520 cpda coding downstream 11940 24756860 ~ 24794610 (+)
XLOC_008521 gosr1 coding downstream 50553 24795473 ~ 24837655 (+)
XLOC_008522 NA coding downstream 96371 24841291 ~ 24844913 (+)
XLOC_008523 CR942805.1 coding downstream 217216 24962136 ~ 24962252 (+)
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XLOC_008511 NA non-coding upstream 377966 24312556 ~ 24313122 (+)
XLOC_008508 NA non-coding upstream 485107 24179932 ~ 24205981 (+)
XLOC_008509 NA non-coding upstream 492591 24191710 ~ 24198497 (+)
XLOC_008507 NA non-coding upstream 528988 24149968 ~ 24162100 (+)
XLOC_008524 NA non-coding downstream 262635 25007555 ~ 25053314 (+)
XLOC_008525 BX908796.2 non-coding downstream 283562 25028482 ~ 25054730 (+)
XLOC_008526 BX908796.1 non-coding downstream 311041 25055961 ~ 25062073 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000072_02536049_02537741 CRK coding CI01000072 null 2535202 ~ 2537741 (-)
bowfin (Amia calva) AMCG00018832 crkl,LOC106566436,LOC106563168 coding CM030135.1 CM030135.1 22455239 ~ 22460417 (+)