G138508


Basic Information

Item Value
gene id G138508
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000027
NCBI id null
chromosome length 10680226
location 1632824 ~ 1647449 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU157359
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RNA

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TU157359 False 14347 lncRNA 0.38 4 1632824 1647449
TU157360 False 14495 lncRNA 0.38 3 1632824 1647449
TU157361 False 14331 lncRNA 0.38 5 1632824 1647449
TU157363 True 14371 lncRNA 0.38 4 1632824 1647449

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000027_01572250_01574108 NA coding upstream 58414 1571893 ~ 1574410 (+)
CI01000027_01546280_01571152 NTRK1 coding upstream 61604 1545743 ~ 1571220 (+)
CI01000027_01543335_01543974 NA coding upstream 88595 1543335 ~ 1544229 (+)
CI01000027_01519267_01519711 AFP4, APOA2 coding upstream 113048 1519267 ~ 1519776 (+)
CI01000027_01413155_01416305 NA coding upstream 215166 1413101 ~ 1417658 (+)
CI01000027_01767031_01767683 NA coding downstream 119158 1766607 ~ 1767863 (+)
CI01000027_01811625_01827803 RGL2 coding downstream 162308 1804199 ~ 1828182 (+)
CI01000027_01843365_01850501 FCGR2A coding downstream 195916 1843365 ~ 1850501 (+)
CI01000027_01850735_01853042 NA coding downstream 203286 1850735 ~ 1853513 (+)
CI01000027_01865502_01875022 HPN coding downstream 218053 1865502 ~ 1877374 (+)
G138494 NA non-coding upstream 36356 1593275 ~ 1596468 (+)
G138491 NA non-coding upstream 50491 1582033 ~ 1582333 (+)
G138475 NA non-coding upstream 99402 1532970 ~ 1533422 (+)
G138474 NA non-coding upstream 102898 1529721 ~ 1529926 (+)
G138430 NA non-coding upstream 170005 1461181 ~ 1462819 (+)
G138514 NA non-coding downstream 14436 1661885 ~ 1663849 (+)
G138515 NA non-coding downstream 17842 1664408 ~ 1676860 (+)
G138519 NA non-coding downstream 26187 1673636 ~ 1704490 (+)
G138541 NA non-coding downstream 92706 1740155 ~ 1749656 (+)
G138545 NA non-coding downstream 95607 1743056 ~ 1743838 (+)
G138436 NA other upstream 125008 1506961 ~ 1507816 (+)
G138290 NA other upstream 633643 995970 ~ 999181 (+)
G138247 NA other upstream 763249 855388 ~ 893121 (+)
G138238 NA other upstream 801141 829774 ~ 831683 (+)
CI01000027_00391159_00499309 CSMD3 other upstream 1204148 390683 ~ 499760 (+)
G138915 NA other downstream 1836938 3484387 ~ 3486647 (+)
G138953 NA other downstream 1854623 3502072 ~ 3520065 (+)
G140436 NA other downstream 3089949 4737398 ~ 4774262 (+)
G140440 NA other downstream 3132968 4780417 ~ 4785660 (+)

Expression


Co-expression Network