G140118


Basic Information

Item Value
gene id G140118
gene name NA
gene type unknown
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000027
NCBI id null
chromosome length 10680226
location 3509352 ~ 3584679 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU159241
CATGTAGTCTCTTGTTCCATATGAATTATTCATGGGGGCTCAGTGCATCTCCTACACCAAGGGCGAGTTAAAATTCACCGCCTTCAGCATTTTTACCATTCATTTTTGCAGACACCTGGGTGGATGACAAGTTCGCTGCCTTTATCTTGCCTTAAGTTTCTTCTGTACTGCCTTAGACTGGATTTAACACCACTTCTTAACCTGTTCCAGAAGTAAAGTCATTGAACTAACTTCAAAGACTGTCAGGATCTGTCATATTAAAACTTGCTGACATTTGCCTCGAAAATCAAATAAGGCAATCCACTGGCTGCAAAGATTTCATCCATTCCAGGTGGGAGATCCCTCACTTTCAAATGGAAAAAAGGCATTTCAGGCCGCTACATCAATGTGTTCATACCTGGTCCTACTAAGGTTCTTACTCTCTGCGAGGTTGAGGTTTACGGTTATCCAGCTCCTAATGGTGAAAATGTGGCTTTAGGAGGAGTAGCTACACAGAGTTCCGTCTATGGAAATGCCTTTGCATTCAATGCTATTGATGGGAACAAAGATGGTGTTTACAGTCATGGATCCTGTTCCCACAATATGGATGACCTCAATGCCTGGTGGAGACTGGACTTACTGAAAAGGCACATAGTGTTTTCAGTGGTAATTACAAACAGAATAGATGCTGTTACTGAAAGACTAAATGGTGCAGAAATCAGAATTGGAAACAGTCTGGACAACAATGGCAATAATAATCCCAGGTGTGCTACGGTCTCTTCCATTCCTGCTGGTTCTTCCTCTTTTGTATGTAATGGGATGGAAGGACGTTACATTAATATTGTTGTTCCAGAACGGAAAGAGTATCTTACACTGTGTGAGGTTGAAGTGTACGGATCACCACTGGATTGAGAAGCACTTAAACAACAGGATGTAAATGAAAAAATGAAAAATAAAAATATTGGTGGCTGTAGGGCTTTACTTTAACCAGACATCAAATCATAAATATTTATATTACAACTGTGGTAAAGCATATTTATTTCAGATGACCTGTTTAGATAAAACATCCAGGCCTTTAAAAGTTGCCGTGTGTTTATAGCTGGTCCATTAATGTTTTTGCTATTTAAAGGGTGAACTCGTTTTGCCCAGAGTAAACTTCATCTTGTCTATGACGAAATTTTTTTGTTGTACATTATGAAATACAGGATAATGGAAATGCACATGTTTTTCCTACTTTGGATTTTTGCGATGACTTATTTTACAGACACAACAACAGCTAAAGCCAAAAATCTCGCTTTATATGGCAAGGCCACACAGTCGGACCTGGTTGGAAATCCTTGGTCAGCAAATGGTCATGCCAGTAATGCTATTGATGGAAATCGTGACTCACATTATGAACATGGATCCTGTACTGCTACTGAAGTGCAAGATGACCCATAACTATCACCAACAGAAAAGACTGCTGTCCTGAAAGACTTGATGGAGCCGAGATACACATTGGAAACTCTCTGCTGAACAACGGCAACAGCAATCCATTGGCTGCAAAGATTTCATCCATTCCAGGTGGAAGATCCCTCACTTTCAAATGGAAAAAAGGCATTTCAGGCTGTTACATCAATGTGTTCATACCTGGTCGTAATCGGCTTCTTACTCTCTGCGAGGTTGAGGTTTACGGTTATCCAGCTCCTGATGGTCAAAATGTGGCTTTAGGAGGAGTAGCTGCACAGAGTTCCCTCCATGGAAATGGCTTTGCATCCAGTGCCATTGATGGGAACAAAGATGGTGTTTTCGGTCATGGATCCTGTACACACACTCAAGATGACCTCAATCCCTGGTGGAGACTGGACTTACTGAAAAGGCACAAAGTGTTTTCAGTGGTAATTACAAACAGATTAGACGGTAGTCCTTCAAGACTAAATGGGGCAGAAATCAGAATAGGAAACAGTCTGGACAACAATGGCAATAATAATCCCAGGTGTGCTACGATCTCTTCCATTCCTGCTGGTTTTTCCACCTCTTTTGAATGTGATGGGATGGAAGGACGTTACATTAATGTTGTTATTCCAGGACGGAAAGATGCTGTTATACTGTGTGAGGTTGAAGTGTACGGATCACCACTGGATTGAGAAGCACTTAAACAACAGGATGTAAATGAAAAAAAAAAACCTTAATATTGGTGGCTGTAGGGCTTTACTTTAACCAGACATTTACTGCACCAGAGTTTGCAAAACAGCGCATGTATTATTTTAAGCCTCTGTACTTTAATGCAGTGCATGCTGCAGAAAGTATTAGACAGATTTGGGTGGCTATTGATCAAA
>TU159249
CATGTAGTCTCTTGTTCCATATGAATTATTCATGGGGGCTCAGTGCATCTCCTACACCAAGGGCGAGTTAAAATTCACCGCCTTCAGCATTTTTACCATTCATTTTTGCAGACACCTGGGTGGATGACAAGTTCGCTGCCTTTATCTTGCCTTAAGTTTCTTCTGTACTGCCTTAGACTGGATTTAACACCACTTCTTAACCTGTTCCAGAAGTAAAGTCATTGAACTAACTTCAAAGACTGTCAGGATCTGTCATATTAAAACTTGCTGACATTTGCCTCGAAAATCAAATAAGGCAATCCACTGGCTGCAAAGATTTCATCCATTCCAGGTGGGAGATCCCTCACTTTCAAATGGAAAAAAGGCATTTCAGGCCGCTACATCAATGTGTTCATACCTGGTCCTACTAAGGTTCTTACTCTCTGCGAGGTTGAGGTTTACGGTTATCCAGCTCCTAATGGTGAAAATGTGGCTTTAGGAGGAGTAGCTACACAGAGTTCCGTCTATGGAAATGCCTTTGCATTCAATGCTATTGATGGGAACAAAGATGGTGTTTACAGTCATGGATCCTGTTCCCACAATATGGATGACCTCAATGCCTGGTGGAGACTGGACTTACTGAAAAGGCACATAGTGTTTTCAGTGGTAATTACAAACAGAATAGATGCTGTTACTGAAAGACTAAATGGTGCAGAAATCAGAATTGGAAACAGTCTGGACAACAATGGCAATAATAATCCCAGGTGTGCTACGGTCTCTTCCATTCCTGCTGGTTCTTCCTCTTTTGTATGTAATGGGATGGAAGGACGTTACATTAATATTGTTGTTCCAGAACGGAAAGAGTATCTTACACTGTGTGAGGTTGAAGTGTACGGATCACCACTGGATTGAGAAGCACTTAAACAACAGGATGTAAATGAAAAAATGAAAAATAAAAATATTGGTGGCTGTAGGGCTTTACTTTAACCAGACATTTACTGCACCAGAGTTTGCAAAACAGCGCATGTAATATTTTAACCCCCTGTACTTTAATGCAGTGCATGCTGCAGAAAGTATTAGACAGATTTGGGTGGCTATTGATCAAAGAGCACTTTTGTAATGTAATGCAGCTGTGAAAATTGTATGTTGTAAAATGAATGATCCTTTTGTTATTACGACTGTAATGTCTTGCAAATGTGTTTGTAAAATACAAAATAAAAAATCATTAAAATTATGTTTTTATGGAAAAATCAAAATAACAGCAAAAGTCACAGGAAAAAACATACAAACTCATACATCCCAAATATAATTGAATAAATAATATACTGCTTTGCAGGGAAATATAAAAGTCTACAGAACTAAGGCGTTTTGCAGCAATACTAGACCTGCTATTGTGCAGAAGACACTTTTCTTTATCATGGTGACTTTGAATAAAACACTATCATTGAGCACAACATAGAACAGATGACACTACACAGCACTGTAAATACAATTATAATATAAACTGTATATCACATTAAAGTAGACTTCATGGTTTCAACATTGTTTGTAATTTGACGCTTTGATGGGCTTTGTGAATCTGTTGGTTTGCTCTGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCATATATTTTTACAGATTGCTTAAAGGTCACGTGTAATAAATAGCTCAAAACAAGATCCAGAGTGTGACACACAGAGTCAGAAGTTGCATATACTGTATGGAAGGGAAAGGAGGTGAATTTGTGCACTGCAATAAAATGCACAGCACCTTTATGACTTAAATTAGCTGAAATGACCAAAAAAAGAGATGAAAAACATAGTCTCTTTCTGTAAAGTTACTGCAATCTCAACAAACAAACCATAAATAATTTATCACAATTGTGGTAAAGCACATTTATCTCAGATAAGCTGTTTAGATAAAACATCCGGGCCTTTAAAAGTTGCCGCGTATTTATTGCTGGTCCACTGATGTTTTTGATATTTAAAGGGTGATGAACTCTTTTTGCCCAGAGTAAACTTCATCTTGTCTATGAGAAAAACTTTTTATTTTTTGTACATTATAAAATACAGGATAATGGAAATGCACATGTTTTTCCTACTTTGGATTTTTGTGATGCCTTATTTTACAGACACAACAACAGCTAAAGAAAAGACTGCTGTCCTGAAAGACTTGATGGAGCCGAGATACACATTGGAAACTCTCTGCTGAACAACGGCAACAGCAATCCATTGGCTGCAAAGATTTCATCCATTCCAGGTGGAAGATCCCTCACTTTCAAATGGAAAAAAGGCATTTCAGGCTGTTACATCAATGTGTTCATACCTGGTCGTAATCGGCTTCTTACTCTCTGCGAGGTTGAGGTTTACGGTTATCCAGCTCCTGATGGTCAAAATGTGGCTTTAGGAGGAGTAGCTGCACAGAGTTCCCTCCATGGAAATGGCTTTGCATCCAGTGCCATTGATGGGAACAAAGATGGTGTTTTCGGTCATGGATCCTGTACACACACTCAAGATGACCTCAATCCCTGGTGGAGACTGGACTTACTGAAAAGGCACAAAGTGTTTTCAGTGGTAATTACAAACAGATTAGACGGTAGTCCTTCAAGACTAAATGGGGCAGAAATCAGAATAGGAAACAGTCTGGACAACAATGGCAATAATAATCCCAGGTGTGCTACGATCTCTTCCATTCCTGCTGGTTTTTCCACCTCTTTTGAATGTGATGGGATGGAAGGACGTTACATTAATGTTGTTATTCCAGGACGGAAAGATGCTGTTATACTGTGTGAGGTTGAAGTGTACGGATCACCACTGGATTGAGAAGCACTTAAACAACAGGATGTAAATGAAAAAAAAAAACCTTAATATTGGTGGCTGTAGGGCTTTACTTTAACCAGACATTTACTGCACCAGAGTTTGCAAAACAGCGCATGTATTATTTTAAGCCTCTGTACTTTAATGCAGTGCATGCTGCAGAAAGTATTAGACAGATTTGGGTGGCTATTGATCAAA
>TU159244
CATGTAGTCTCTTGTTCCATATGAATTATTCATGGGGGCTCAGTGCATCTCCTACACCAAGGGCGAGTTAAAATTCACCGCCTTCAGCATTTTTACCATTCATTTTTGCAGACACCTGGGTGGATGACAAGTTCGCTGCCTTTATCTTGCCTTAAGTTTCTTCTGTACTGCCTTAGACTGGATTTAACACCACTTCTTAACCTGTTCCAGAAGTAAAGTCATTGAACTAACTTCAAAGACTGTCAGGATCTGTCATATTAAAACTTGCTGACATTTGCCTCGAAAATCAAATAAGGCAATCCACTGGCTGCAAAGATTTCATCCATTCCAGGTGGGAGATCCCTCACTTTCAAATGGAAAAAAGGCATTTCAGGCCGCTACATCAATGTGTTCATACCTGGTCCTACTAAGGTTCTTACTCTCTGCGAGGTTGAGGTTTACGGTTATCCAGCTCCTAATGGTGAAAATGTGGCTTTAGGAGGAGTAGCTACACAGAGTTCCGTCTATGGAAATGCCTTTGCATTCAATGCTATTGATGGGAACAAAGATGGTGTTTACAGTCATGGATCCTGTTCCCACAATATGGATGACCTCAATGCCTGGTGGAGACTGGACTTACTGAAAAGGCACATAGTGTTTTCAGTGGTAATTACAAACAGAATAGATGCTGTTACTGAAAGACTAAATGGTGCAGAAATCAGAATTGGAAACAGTCTGGACAACAATGGCAATAATAATCCCAGGTGTGCTACGGTCTCTTCCATTCCTGCTGGTTTTTCCACCTCTTTTGAATGTGATGGGATGGAAGGACGTTACATTAATATTGTTCTTCCAGGACGGAAAGAGTATCTTACACTGTGTGAGGTTGAAGTGTACGGATCACCACTGGATTGAGAAGCACTTAAACAACAGGATGTAAATGAAAAAAAAAAAAAAAACCTTAATATTGGTGGCTGTAGGGCTTTACTTTAACCAGACATTTACTGAACCAGAGTTTGCAAAACAGCGCATGTAATATTTTAAGCCTCTGTACTTTAATGCAGTGCATGCTGCAGAAAGTATTAGACAGATTTGGGTGGCTATTGATCAATGGACACTGGGAAATGGACAATATGGTCACCACTTTGTTTTGTGTAATGTAATGCAGCTGTGAAAATTGTATGTTGTAAAATGAATGATCCTTTTGTTATTACGTCTGTAGTGTCTTGCAAATGTGTTTGTAAAATAAAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU159241 False 515 TUCP 0.41 2 3510282 3584679
TU159249 True 382 TUCP 0.38 2 3512060 3584679
TU159244 True 761 TUCP 0.40 2 3509352 3584679

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000027_03492624_03493292 NA coding downstream 8242 3492500 ~ 3493292 (-)
CI01000027_03484797_03490716 HERPUD2 coding downstream 10581 3484742 ~ 3490953 (-)
CI01000027_03468269_03469904 NA coding downstream 31319 3467864 ~ 3470215 (-)
CI01000027_03371533_03388330 DPY19L1L coding downstream 112399 3371249 ~ 3389135 (-)
CI01000027_03301041_03302954 NA coding downstream 198028 3300900 ~ 3303506 (-)
CI01000027_03689861_03690969 NA coding upstream 104760 3689439 ~ 3691211 (-)
CI01000027_03694455_03710634 NA coding upstream 109548 3694227 ~ 3711039 (-)
CI01000027_03750919_03761043 FLI1, FLI1B coding upstream 166151 3750830 ~ 3761063 (-)
CI01000027_03787377_03788902 NA coding upstream 202698 3787377 ~ 3790279 (-)
CI01000027_03832200_03836030 NA coding upstream 246526 3831205 ~ 3836530 (-)
G140105 NA non-coding downstream 69580 3431632 ~ 3431954 (-)
G140101 NA non-coding downstream 83475 3417758 ~ 3418059 (-)
G140079 NA non-coding downstream 107893 3393310 ~ 3393641 (-)
G140078 NA non-coding downstream 108335 3392854 ~ 3393199 (-)
G140035 NA non-coding downstream 148821 3351440 ~ 3352713 (-)
G140134 NA non-coding upstream 1754 3586433 ~ 3591440 (-)
G140176 NA non-coding upstream 37743 3622422 ~ 3622647 (-)
G140183 NA non-coding upstream 58267 3642946 ~ 3643225 (-)
G140197 NA non-coding upstream 85540 3670219 ~ 3671509 (-)
G140199 NA non-coding upstream 87262 3671941 ~ 3672243 (-)
CI01000027_02226447_02227499 NA other downstream 1273509 2225781 ~ 2227499 (-)
CI01000027_02119227_02124423 NA other downstream 1375506 2119131 ~ 2125142 (-)
CI01000027_01303308_01319462 NR2F5, NR2F1, NR2F1.L, NR2F2 other downstream 2181373 1302034 ~ 1321178 (-)
CI01000027_01241417_01245177 NA other downstream 2254557 1240478 ~ 1246267 (-)
G139117 NA other downstream 3263955 234212 ~ 237579 (-)
CI01000027_03922380_03931033 NA other upstream 337717 3922242 ~ 3931033 (-)
G141481 NA other upstream 787568 4372247 ~ 4412810 (-)
G141488 NA other upstream 922796 4507475 ~ 4508971 (-)
G141728 NA other upstream 1292388 4877067 ~ 4877766 (-)

Expression


Co-expression Network