XLOC_008603


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_008603
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 30861762 ~ 30874490 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00018987
TAATAACAGGGTTGAGGGAAACTTTTATTACGAACACTGGTATAATTAAATTGCCATGTTATACATGTACAGCAACTAACCGCTTTACAAAAAAGCAAGTAATACAATATCACATATATTTACACTTGTATTTATATACCTTCCAATTTTACACAAACATATTTACAGGTGACAGATACATTGTATACAGATGACCAATGCAATTAAAAATGTGGCAAATGCATCCGACGAACACGCATcttcaattatataaaataaaccacTTTTTAGTCTGTTTATGATGAATACATGAGACGGTTTAATTACATATGTGATTTAAAAGGCTTTAGGGACATGTCGTGTCAAACCACAGCTGTGGCAGTCAAGACTGTGCCTTCGTTATTGTTGTCTATCAATATAAGGTCAGTTTTAGATTGGTAGCAATGCAATTCCTAAGATTCAAAAGTAATATTCTGGTTATTCAGAGCAAtggatgcaaaacaaaaccacacAATTGGGTCATTTATGTTCCTTCATATTTTAAATTCgttattaaaaactcaatttaacACAGATTGATGCCAGTACGACATGTAAAGCAGGAATAAACATTTCAAGTTTCATTTTTGATCGTAACAAAACACTGAGATCTGAAATCTTCTGTTGGGACGATGTTTCACTGTATGGACGAATGTTTATGAATAGTTTAATGGTAAAACAAatctacaaatgaaaaaaaaaaacaatgacattgATTTGGTCCCAATTTTAAGTATGAAACATGATCCTTGTGTATTTGGatgaaaacatcaaattaaaataatgcataaatactTCATCCTCAAACATTTGGCCTGTACCCTTCTTTACAAGTTTCCCTTTAATAAGCATTTCAAAGAGAGTCGATAAGTCATGTCATTTGTGTTTGTTGCAAGGTACACTACCATTTCCTCCTCTACGATTTGTGGATCGACATAATAATGAGAACGATAATGCAGGAAACATATTGCACACAAAAATCGCCCACTTCAATTTTGACAGCCACTGTGTTTAATACACAACAGCATCTTAAAagtacagttcacccaaaaatgaagattagCTTTTTATTTAATCACCCTCAGGTTATCAAGGATGTAGGAAATGTTGTTTTCCCATTCAGTAGAACAGTAAAGAGGATTTTTAGCTTtgttgattcataaaatgcatgtCAACAGCAATTTATGagtcaaaacaaaaacacatacaggcATCAATACATTGAGGTCTTAATAATGTTATACAGTTTCCAGGTTCTTGCCTTAATATGAGACCTCAATGTATCATTAGGAGCCTTGGGTATTAATCGAACTTAATTTCACCTTTTAGCTATTGACTTGCATACTTTAAATCACAAAAGACGACAATTTCAACTAAAACTTCTATAATGTTTTAATGGAGAACACAAAGGTGTCACCTACACCTTAGGTGACtggagagtgaataaatgaacatcatattttaatttctgggtgaactatcccttttaaatgGCACAACTGTCTTCAATTCTACAATATACTGATTAGGTGAGAACGCCAAAGCTAATGAGAACTGTATGGAAGAAATAATTACTTTAAGGCATACAGCACTGACAAGAcagatacaaaaacaaaaaaacatacaaaatggaGTTTACAACAGTTTCCCCTCTTAATATTGCAAACTAGTCTTTGGTGCAATGTTACTATGTCAGCGCGTGGTTGGATTGGGATTTCTGTGCCATATGTGAGCTGTTGATGAGACGGAAACAGGGGAAAGTTAAAGTGTGCGCGGACATTTCCTGATCGCACACTTTAATCGTGTGCAATTTGTACACGCACATAGTGTtcgatttaaaaaacaaaaacatattgcaCCACAGTTATACATGAATATTAATGCCAATTTGTTGTTGATTTGTGCATTTTGGGAAAATACTATGTGGGTATCTACTCATGCGCTGCTCTTCCAGAATCGTTTTTTTATTTAACGACTGATGATAAACAACGATCGCAAAGCAAACCTTCATGTGATGTCTGAAAGGATAActtacatttacagaataaatACTTGGATGCCGCAATATGATATTCTCATATCTGATGTTTACGTTGTACTGTTTACACTGCAGCAGACAATATGGTAAATGTTAAAGCCGCGACACGTTTGTTTTTCATAATTAGTACCTGTTTTCCCTTCCTTAGCAAGGTCTTGCCTATTTTACAAACTATACACAGCTGAAAACCCTGACAAAGGCACACAATGGATAAAGTAAGAACCCAAAACATGTGATCGTTATTATCATCAACATTATAGTACACACATAATCTTTCCTGGATCCAGATTTCAAGCCTGTGGAtatcaggaaaaaacaaaacaaaggacaGGCCTGGACGAAATGGAAAACGGCCGAGTCATCTCCACACGGTTGGTCATCTGTTTTTACTGTAGTGGTTGATTAGATCTTGTGTTTCTTTCAGACAGAATCTCAAgtttgtgcaaaaaaacaaagAGTGGACGCCTCAACTGGACAGATTTgagcatttcaatgtggtcagtCCCCAAGTTGAGTGCAACACGGAGAGGAACCTTGTTAAACTGGACGGTGGAAAGCAGAACGAGCCATGGCCACGGAGTAGATCTTCTCAGACGATCTTTTTGATGCTTGGCCGTTTGAAGCTGCCTGCGCTGCGCTGCTTCTGCACCTGGCTTGCTGAGCCGTGCCGCATTCGCCCACTGGTGGACAGACTCGAGagatgTGAGCACTGACCTGGGGAGTGCTGTGATGTGGCAAGTGATGTCATGGAGTTGGACAGGTTGAGATTGGCTGTGATGCTCAGCTGGCTCTGGACGGTTGGTGGATATGGCGAGGTCGGGGTCCGCAGTGACTCTTCTCCTCCTTCCTCCTCAATGCCCGGGAGATACGTGTCAATCAAAGCATCCAAAAATTTAACCACCAGCTCGGCGTAGTCTGGAATTTGGGTTTGCTGTTAGAGAGAGTAAAAGCAGATGTGATTAATATTATGGTAATTGAGCGTATTTAAGCCTCTACAAGTGGGCACATTTATTTCTG

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00018987 True 3073 lncRNA 0.38 3 30861762 30874490

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_008602 NA coding upstream 280935 30580518 ~ 30580827 (+)
XLOC_008601 BX649247.1 coding upstream 407196 30454452 ~ 30454566 (+)
XLOC_008600 NA coding upstream 481443 30358431 ~ 30380319 (+)
XLOC_008599 mrps23 coding upstream 506976 30350061 ~ 30354786 (+)
XLOC_008598 nos2b coding upstream 513085 30323491 ~ 30348677 (+)
XLOC_008604 BX000438.3 coding downstream 18747 30893237 ~ 30893355 (+)
XLOC_008605 BX000438.1 coding downstream 22232 30896722 ~ 30910178 (+)
XLOC_008606 omgb coding downstream 42792 30917282 ~ 30921559 (+)
XLOC_008607 BX000438.2 coding downstream 48436 30922926 ~ 30924032 (+)
XLOC_008608 pimr135 coding downstream 139088 31013578 ~ 31018413 (+)
XLOC_008463 BX663520.1 misc upstream 9609480 21252191 ~ 21252282 (+)
XLOC_008594 NA non-coding upstream 907667 29947508 ~ 29954095 (+)
XLOC_008593 dre-mir-125c non-coding upstream 1060710 29800968 ~ 29801052 (+)
XLOC_008609 NA non-coding downstream 308250 31182740 ~ 31187391 (+)
XLOC_008620 NA non-coding downstream 573095 31447585 ~ 31457948 (+)

Expression


Co-expression Network