G142147


Basic Information

Item Value
gene id G142147
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000027
NCBI id null
chromosome length 10680226
location 7036013 ~ 7041067 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU161529
CATAACACCAAAATTTAAGTTGTTAGTCACGGACAATCTTCCCCTCCGTTAAGCTGTAAACATATATGTATTGGTGCTTTAAAGAACCTAGAAACCAAAACACTAAGAACCTATAATGGAAAATCAGGAACATTTTAAATCTCCAGAGAACCACATGATTCAGCTGCTTGCAACTGAGTGAGTAAGAACTCAAGAACTAGATCAGTCAGATTTATGAAAGAATCATCGACACCAGTTTTGTGAACTGATCAACAAATTCAACAAAAAACGTTTAACATCCCCAGCCTTTATTCACTTTCTTTATGCACACAAGAATGGCCAGGACATTTTTCAAAAATTTGTTACACAGAAGAAAAAGTCATACAAGTTTGGAACACCATGAGGTCAAGTAAAAGACAAAATGTTAATTTTAGGGTGAATTGTCCCTTTAAATGTCTCCCTTTACCTGTATTCACCCTATCTTGTGCTAAAATCATGATATATCCATTTCATGGTGATTTGTAATAGGATAATCCAGATTTCTCCTCTTCCAAAATGAGGTGTATTTGCTCTATCTTTCTCTCTGTGCCGGGTGCAACGTATTACCAAATCATTACTGGAGGAAAAAAAACATCTGAATTTTTGTACCAAGAAATAAGTACATTTTCTACCATGAATTGCTCGCCTAACACAGAGGGCCAAGTAGGCAAATCCCCTCAGGGCTGCTATCATGATTATGAGAATTCTGGGACTCGAGAGAGATTGAAGTGGACGCATTTCAGCTGTCCATTAGGAATTTCCCATCTGGACACAAACCTAGCACAGCTGCAAAGTCTCAGTCTGCAGAGTAGTAAGCAGGGGGTAGATGAGGTGAATTTAGTGGGGATGCTGTGATTAATTGTATTTTGAATGACAAGAAAGAAAGGTAACATAAAAAAAGGATACAATGTGTCTTGCTTACAAATGCCACTATTAATCACTAAAGTTATATGAAGGAGCTTGTTCATCCAGTCCTGTCAAGGACATGTAAGTGGCTGCTTCTTCAACTACATTTCAATTCAGAAAAAAATAATTCTCTATCCATCTATCTTCCTCTAAACAAGTAGTCAATGAGAGATCTAAAGTAAAGTTTGATAGAGCCCCTCCGTAATGGACAGAACATCAAATCATATCACACTCAACAATTATATGAACTTGTGAAACAGTTGAATAATAGCACAAATAATGAACTAAACTGACTACTTTCCATTCTAGTTATGAGAAACAGACACTTCTGGGTTTGAAAAAGAGGGAGAGCCTTGATTAAACTATTAAAAGGGCTCATTAACCAGCGCAAATGTAGAAGTGACATTTTGGATAAGTACATTGTGCATAAGACCAATATATTGTCAGGCTTTCATTATTTAATAATGCACAACAATGTGTCAAGTAAAAACAAATGGATTTAGTTCTGTAATAGATAGTAAAAGCAAGTGTTTGCACAGAACACGATTAACGTGACACATGGTAACAAAGGTTTTGAATAATGCATCCAATACAATCTCAAGGATTTCTGAAATGATGCACACACACACACACACACACACACACACACGCTCATCTTTTCTTTAGAGTAATACAGGCCTATCAGAGCTAAAGATATAGTACTTTCAAAGCAAAAACATCTCGTGACCATTTAAACAACAACAGAAATTTGTAACTTTACAATAAGGTTCTGTTTGTTAACATTAGTTAAAGGCACAGTATGTTTTTTCGCCGCTAGGGGTCGCTAAACTCTTCAAAACAATAACAAAGGCGTAGATTGATAACGCAGTGAATGAGCGTGGGCTCAAGGAACTTGTCGTCATTCCGATGGATCTAATAATGTTTATGGAGAAATAATGTTTATGGATGAGTGAATGCATTCATGTTTTTAACATGACTGTGGTATAAAGCAGGGCGTGGCCGAGAATCGCGGGCGCCATTGCTAATAAGAGATAGATATCAGTGCCACACGCGAGTCCCAGTGGATATAAAGGAATAAGGACATTTCATTCTACCGAACTACTCACAAATCTGAAATACTACTAATACAGGTCAGTTTATTTGACGAATTAAAATTGTGAGGTAAAGCAGCGCTGTTTCACTTGGTCTCACGTTACACTATCATACTAAACTGCATTGAAAGTTGTAATGTTATTCTGTGTATTAGTTTTTTGGCTGTATGAGACTAACAGTAAGTTAAATAAACATTAAAATATCATACTGATGATATTCTAACATTTCGTCGTGTTGAGCTATATAACATTGATTCGTCTTTTGTAGCCTACATTTGTTTACCTTGTCTAATAACGTGCAAGAGCGGCGTCGAGCTCTGTCAAGTCAAAGTTGTCGCAAAGCTCTCACAATCTCGGAAAGGCCATGCCGATATTGTTCCTCCTTTTATTTCTCCGTTTGTCCCAAAGTTTGCTTGCCATGTCCATAATGTTTAAACGAAACAACAACAGCGTGCTGCTAGACGTTAGGCAGCTGTCCGCGTCTGTTGCCATGGTTACTGTGCAAGGAAACAAGGGATAATGCAGATATTACGTCAATGACAGGTGACAAGTGACAAGGGAGGGACGGACACTATTAAAAATTGTGGATTTCTCTGAATTTACAAATTCTTGGAAACATTTAGGATAATGTAAGTACACAGATGAACAAAATATATAACACTGTGCAAGTGGTTTTTGGATATTTTAATATAACAATCTTACATATTGTGCCTTTAATTACATTAGTAAACATTAGCTATCAATGAAAATTATTTAATGTTAATTTAAACATTTACTGATACATTATTAAAATTAATAGTTGTAACATGAACTAACAATGAACTTTTATTAACTAACATTAACAAACATTAATAAATACTGTAACAATTGTATGATCCTTGTTAGTTAATTACAGTTAATGCGTTAAGTAATGATAACTAATGGGATCTTATTGTAAAGTGTCATATATTTTCCAAAATAAGTCAAAGCAATAACAAACCACAAATATTCTTCAGAAGTCTAAAAGTTAACAGCTGGCCATTCATAATCTTTTACTGAAAAGCACAGCAGGAAGTGATTGATCCACCATGAAAGCAGCCTTATGTGTGTATGGACCGTGAGAGGTTCACGTCTGCCTGACATTAATGTTAACATTTGTGCATGACATGATAATCTAATTATGTGTGATGTATTCGATAAGCATAACAAGACATCCTTGAAGATGGACATGGTAGAATTGACCAATCAAAGTACAGATGAGAACAGTCTGTGAATGTCAAGCAGAACAGATTGCATAAAGGTAGCTCACCTAAAAACACTGAGCTACTGTTCAAACTACTGTGTTGTGTGTATGTGTGGATTTAATCCCTCACAAGGACAGAAAAACCTGAAATCGCCTATATTGTGGGGGGACCACAGTCTCAATTACCAAAATGCTCAATTAATAACATAATATTAAAGGGTTAGTTCACCCAAAAATGAAAATTCTTTCATTAATTACTCACCCTCATGTCGTTCCAAACTCGTAAGAGCTTCGTTCATCTTCGGAACACAAATTAATTATTCTGGGCCTTGAAAGTGGTAATTAAATGGCTGTCTATGAAGGAGTCAGATAGCTCTCGGATTTCATGAGGGTGAGTAATTTTTGGGTGAACTAACCCTTTAACAGATATTAAAAAACATATGCAAAAACAATGCAAAGTTGATAGTTCTGCTGAATCTAACGCACATAGCAATATTTGCATGACCAATTAAGCTGCCAGTTTTCTGCAAAGGTCAGTCCCAACAAGGTCACTGGAAGGGGTCACAGGGTTAAAACACTTGAAGTGCGCAATTAACCTTGTGCGGGGAGAAAGGAAGAGTGATACACACAGAGAGTGAGTGAGAGAGAGAGGGATGTAAAAAGAGGGAAATAATTACACTAATGGAGAGGAATTAGATCAGTAGCATTTAGTGGAGAAAGCTGAGTAATTAAATTAACCGGGTTTTGAATAATTCCTCTTGCATTCTACCTATTTGCTCATTAAATGGATTTGCCATGGATAATTTAACCTTCTTCTCCCAAATTAATCAATGTGGTTGAAACTTCACTTCCGCTGTTGTAGTGCATCTCTTTTCCTAGAAAAAAACTGAAATCTTTGTCTTATTTCATCAATTACACAGTAACAGAAAACAATCAAATAGAGCCAATGGTGTTATAAATATACTCTCTTCCTTTCCTCCTTACTTTCTTGCCTTCCTTTGGGTTTTGTATAACTTGTAGCCAAATTCCACCCACAACCCAATGAAACATTATTGCCAGAATAAATATAGAAATAGTTTGTAATTTTGTGTATTTAATAGTGTGAGCTGGGGACGTATTTTAGGTGGCTGTGAGTGTAGGTTGCTGTATTTTACAATGGCATTGCTCCGTACTGGCTGGTTTCCGTCACCCTCATTCTTGTCTGCTATTGTTTGTCTTATACATTGTTCTATTGTTTCTTTCCTCTGCCACACACATATGCACACACACACACACACACACACACACACACCACACACCACACATCTAGTCCCAACAGGAACATTCAGATGTTTTTCTTGCCCACATCTGTGATACCTTGTAAACATGAATATTCTGTGTACACCTGAAATGCTTTTGACTCCCTTTCTTTCAATCCAATTCAACTCAATTAAGATTTACTGGCATGCATGATAATTGGAGAAAAGCACTTACATGGCTTCTTCAAAAAGAATTGGCATACAAAATCAAATAAACTAAATGAACCTATTGTCGGTACACCTACTGTGACGAGCAGGGCGGGACGAGAGCCGTGAGGGAACGGCGCAAGGCCGGTGACGCGAGTGATAATAAGCGTCAGCTGTGCGTTGCACCAGTCTCGTATCTCTCACGGAGGAGCAGCGACATTGAAGGATGAGAGAGGACCAGGCCTGGATTTTATGTTATGTTTTATTATGTTTGTGTGGCCAGCAGACGTCCGTGAGGGTCTGGCGGCATTTACTTTCGTTTTGTATTTGTTTATTTTATATACAGTGGGTACGAAAAGTATTCAGACCCCCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU161529 True 5055 lncRNA 0.37 1 7036013 7041067

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000027_07022724_07029894 STEAP4 coding downstream 5985 7022108 ~ 7030028 (-)
CI01000027_06975907_06983141 NA coding downstream 52330 6975907 ~ 6983683 (-)
CI01000027_06958001_06967286 NACAD coding downstream 68727 6958001 ~ 6967286 (-)
CI01000027_06913276_06914858 NA coding downstream 121155 6913044 ~ 6914858 (-)
CI01000027_06882644_06900902 TEX10 coding downstream 134696 6882555 ~ 6901317 (-)
CI01000027_07190301_07196617 NA coding upstream 149004 7190071 ~ 7197002 (-)
CI01000027_07280569_07290167 NA coding upstream 239148 7280215 ~ 7290490 (-)
CI01000027_07291684_07291971 NA coding upstream 249686 7290753 ~ 7291971 (-)
CI01000027_07462193_07463023 NA coding upstream 420863 7461930 ~ 7463215 (-)
CI01000027_07473568_07489464 ABCB1, ABCB4 coding upstream 431832 7472899 ~ 7489775 (-)
G142146 NA non-coding downstream 239 7035108 ~ 7035774 (-)
G142145 NA non-coding downstream 1165 7034042 ~ 7034848 (-)
G142144 NA non-coding downstream 2058 7033073 ~ 7033955 (-)
G142133 NA non-coding downstream 116995 6917768 ~ 6919018 (-)
G142119 NA non-coding downstream 207373 6828332 ~ 6828640 (-)
G142148 NA non-coding upstream 365 7041432 ~ 7041646 (-)
G142153 NA non-coding upstream 13927 7054994 ~ 7130141 (-)
G142202 NA non-coding upstream 98714 7139781 ~ 7140136 (-)
G142205 NA non-coding upstream 105261 7146328 ~ 7146604 (-)
G142218 NA non-coding upstream 138129 7179196 ~ 7179474 (-)
G141638 NA other downstream 239306 6788627 ~ 6796707 (-)
CI01000027_05447458_05450346 PON2, PON3.2, PON3.1 other downstream 1585650 5447424 ~ 5450461 (-)
G141588 NA other downstream 1834858 5108335 ~ 5201155 (-)
G141728 NA other downstream 2158247 4877067 ~ 4877766 (-)
G141488 NA other downstream 2527042 4507475 ~ 4508971 (-)
G142203 NA other upstream 100027 7141094 ~ 7143063 (-)
G142209 NA other upstream 112556 7153623 ~ 7157998 (-)
G142299 NA other upstream 398111 7439178 ~ 7440191 (-)
G143267 NA other upstream 628262 7669329 ~ 7673769 (-)
G143325 NA other upstream 843468 7884535 ~ 7886049 (-)

Expression


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