G143469


Basic Information

Item Value
gene id G143469
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000027
NCBI id null
chromosome length 10680226
location 8363672 ~ 8371459 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU163000
CACAATACAAGATTACTAAAATGAAAACTAAAATATAAAAATAAAAGCTAATTTAAAATATTATTAAAAACTATGGTAGTATATAAATGGAACCACATTAACATGGAAAACACCATTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTTATTTTGCCTTTCACCAAAGAAAGAACACTATACAGATTTGTAATGATGTGAGGGTGAGTAAATGATGATCAAATTTTCATTTTTGGATGAACCATTCCTTTAAATAGTTTAGTAAAAAATTTCAGAAGTTATAAAATTTATATGAAGGGTGCTATAGAAATCACAGTACAAATCACGTAAAACATGAAAAAACAAAACACATCTTCTTGCAGCAAAATCAATATTACATTTTCTTTGTTTTGTTGTGGTATCACATGAATTTCTAACCCCAGAGCTGGCAGAATCGAAACTTGGAGGCATTTGATCTGAACTGAGCTAATCTCACAGAAGCCTCTTTTTGAACAGTTTCCCCTCCCTTCTCCATCCATCCCCCACAATGCGCTGATCCTAAACATACTTGCGGACCATATACTTTGAGGATATCCTCATGAGTCCGATTCTGAGATTTAGCTCTCCTCATTCCTGGGCGACTTAAAGTACCGGCGACCTTGCGGAGTTCTCTTTCTGAAAGACTCGTTGTCCTTGGGCTCAGGCTGCTGTGAGGAGCTCCATCACCGGACTAATGCTTAATGTAGCGGCACACAGTACTCATCATCAGCAGCAGCAGCCGGTTGACCAGGGCCAAGCGCGGAGCCCATCCTCTGCCTGCCCACCTCTAAATAAAGCCTGTCATCTTGCCATCTGTGCCACACAGTGGCCGCTCATCAGGGGAGCTCGGGGCTGGCACATGGGATGCTTTTATTATCATTCCGTTTCCATTCTATTTAAAGGGTGCCGGAAGAAAAGAGCTGTCGGAAAACAGTGGTGCATTATGGGAATTTTTGTCCACCTTTCACAATGGGATGGCTTTATCACACAGTGGGAAGACGGCGAGAGTTCTGAGGATGTAATAACTCCTCTTGAATGCAGGTAGAGCTCTAATTACCATGCCAAGGTGCCGTGGGAGGCTTTGTCTCAGCGTGAGGTGAGAAGCTGCACTGCCATGTCATTTCCAGTGGCTGGAAGAGGAGCTCTGGTGGCTGAATGAAGCAGTGGGAATGCTCATTGAATGTGTGCACCCACTGTGTGCTCTTTCACACCACACAGATAGAGAGGAGCACAGGGACACGCCATCCAGCGTCCCACACATCCATGACAGTACAGCCCAATGCCATGATGCCATCCTCCATCTCTCTTTCTTTTTTCCATGATCTCTCTCAACCCTTGCTTTCTACCTTCCTTATTTCCTCTTTGATCTCTTACATCCTTCATTCATCCCTTCTTTAAACTTTCTCTGTCCTTTCTTCCTTCTCTTCATGTCTTCCTTCCATTCTTTTTCTTAATTTCTCATACTTTCCTTCTCGTAATTTCCTTCCTTCCTGTCCTTCATTTGTTCTCGTAATCTCTCCTTCCTTCCTCTCCTTCATGTTCTCGCAATCTCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCGTACTCGTAATCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCATTTGTTCTCATAATCTCTCCTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATCCTTCCTTCCCTTTCATTTGTTCTCGTAATCCTTCCTTCCTTCCTTCATTTGTTCTCATAATCCTTCCTTCCTTCCTTCATTTGTTCTCGTAATCCTTCCTTCCTTCTCGTAATCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCATTTGTTCTTGTAATCCTTATTTCCTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCATAATCATTTCTTCCTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATCCTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATCCTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATCCTTCTTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATCCTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATTCTTCCTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTGTTCTCGTAATCCTTCCTTCCTTCCTTCGTTCTCGTAATCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCATTTGTTCTTGTAATCCTTCTTTCCTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATTCTTCCTTCCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATTCTTCCTTTCTTCCTCTCCTTCATTTGTTCTCGTAATTCTTCCTTCCTTCCTATTGTATCAAGTACAAAATACTGCTTGTCCCCTTTATCCCGACTCGATCACTTCAGTCTTCTGAATCTGGCCTTCTCTTTGTCCCTAGGTATCACGTCTCTTCTATGGAGGGTAGATCATTTAGAGCTTTCGCACCTAAACTCTAGAATTCTCTCTCCCAGCCACTGTTGCTTTAATAATGTTTCTGAATTCAAATCGCAACTCTAAGCCCATTTATTTTCTTAAGTAGTGTTCTGTATTTTTATGCATGAATCTATGTTGCTGTGTGCTACCTCTTTGTAATGCCACTTTTATTGTCTTTGTATTATCTGTGCTTTAATCTACTGTTTTGTAATATTCTTCTCTTCTGTGTGTTCTATTTTCTGTTATTATTGTCTTCCCTATTGCAGTTATCTTTTTCTTAATGTAGAATGTCCTTGAGCTATGGAAAGGCACTATATAAATAAAAATTATTATTATTAAAGGCACAATAAGTAAGATTAAAATATCCAAAAACCACTAGAACAATGTTATATATTTTGTTGACTTGTGTACTTACATTATCCCAAATGTTTCCAAGATTGTTTAAATCCAGAGAAATAAGCAATTTTAACTGTCGCCTATCAATGACCCGCGTTACCCTCGATTTCTGGTTTTATTTTGTAGAAACCATGGAAACATCAAAGACGTTTTAATATATTATGTGTTTTATTAGACAGGTGAGCAACTGTTTGGATACATTCATCAAAAGAAAACTAATTATTGTTATATAGCTAAACACAGTAAGTCTTATTGTTTAAATCTCGTTTTCTTGATTGAGTACCATGTTTTACCATGCCTAATATCGATCTAGCTTACTGCAGCGTCCAACAAGTGTCTCATAGTAGCGAATGTACAGAGTAGAATTATAACACTTTCAAAACAGAATTGTATCTAATATGATAAAACAGCTCCACGTTACCCCACATACGCATGACCGGAAGAAGCGGAAGCGGTCCACTGCTCTCGAGCCGTGTGTCGTGCTGGTCTCTCATTAGCAATCGCTCCAGCGGCCTTGTTACGCTTCAACGTCTTTTAGCCACACCCTGATTCATATTACATTAATGTTAATAAATCTTTAATACATAAGCTCATCCAATAATATGATTTCTGCCAAATCCGGTCGGATTCTTTTCCACTGGCTGTAGACAACACCTCCCATGATTCCACAAAATCAAGGCGTCATCAAGCTACGCCTTTGTTTTGAATAAGTGACCTCTAGCGGTGAAATTTACATATTGTGCCTTTAAAATTATTAATAACAAACAAAAAAAATTTTTTAGGTTGTCACCAGGGAGTTATTTACCTCTCTCTAATTGGCTGATGGACAGATTGAAGGCCATCTTAGAAATATATTAGCACTATAATCAGCTCAAAAAACAGTGGCACTGATTCATAAGCTGGAGATTAGAAAAGAACAAAGCAGGTGACTTGGAAATGTTAATATTTACTAAAACTCATCTATATTAATAACCTCATGTGACTAATCCAGATGGTAATACAAGGATTTTGAGAAATATACTGGATATTTCTCCATGATCCACAAAGGATGGGGAGCTGTGATGTGTGTGTGAGAGAGAGGCAGAGTGTATTGTGTGTGGTACAATAGCTGTATGCTCTGACCCTGATCACACTGCATCCACTGGCACGCTTTAGAAGCAAAATCAGACACCACCACCCAGGGATGTTAACACACACTTTCACACACACGGGCCAGCTGTCAGCTAGTATTAGCTCATGACTGTCTGAAATATAATACTGCACATTTCTATTTCTCTCTTCAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCTTCCCCTCTCTCCTTCCAAAACACACACATATGCTCTCTCTCTCTCAATATCTCTCATACACATGCACCGTCTATCACAACATACACACATTTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACACATACCGTCACACATCCACTCAGTGAGAAAATTAATTTGTCAGATCGTGATTTTCAGTTGTTCCTCCAAAGCTCTTGCTCAGAGCTCTCTGATACGTCCCACAGCCCTGCAGGACATTTCTGTCTGCCGTCCAGATCTGCAGCCTGCAGCCTCACTGCGGGTCATTTGTGTAACGGACTCTATTGATCTGGGAAACTAACGCCTCTCTGAGAGTTGTTGTAAGAGCTGCTCAGAGGTCAGAATGGGACAGATTGAAGATTTATGCATGTGTGCGTGAAAGGCAAACTGTCGGTATAAAAAAGACATGATGTAATATTCACACCAAGACACTAGTGACACAGTGTAGAAAAAATAATAGCAATCTGTGCCTATTGTTGAATGCAAGGCCCAACTTAAGCTGGCCATATAATTTCTGCTGGCCATATAATTTCTGATTTAAAATGGTCAATGGATATGAACATGACTGTGAATATGGCTGGACAAAGGGTAATCATTTACTAAAGCAATTTTAATGTCTGAATTTAAAGCTTGTGAGATTGAATTAGTGCACTGACCGTACGCAGAGTCCACCGCAGGGTTCTGCTTGCGAGTTGTGGCCAACACATCTACAGAAAGAATAAAAGAAGAATAAGATCAAGTAGGCCTACGTTCAGCCTAATGAACTATAATACTTGGCAGAAGATTAT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU163000 True 7434 lncRNA 0.39 3 8363672 8371459

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000027_08285855_08291534 NA coding downstream 70849 8285769 ~ 8292823 (-)
CI01000027_08134523_08134951 NA coding downstream 228363 8134487 ~ 8135309 (-)
CI01000027_08091338_08097220 NA coding downstream 266452 8091293 ~ 8097220 (-)
CI01000027_08081583_08083496 TNFAIP8L2B, TNFAIP8L2 coding downstream 280176 8081269 ~ 8083496 (-)
CI01000027_08073979_08077754 SCNM1 coding downstream 285918 8073661 ~ 8077754 (-)
CI01000027_08422679_08426771 CCT3, TCPG, CCT3.L coding upstream 51220 8422679 ~ 8426771 (-)
CI01000027_08429132_08434558 NA coding upstream 56853 8428312 ~ 8436258 (-)
CI01000027_08443968_08446252 NA coding upstream 71718 8443177 ~ 8446436 (-)
CI01000027_08483034_08503082 LMNA coding upstream 111480 8482939 ~ 8503082 (-)
CI01000027_08514843_08515829 MC5RB, MC5R, MC5RA coding upstream 143029 8514488 ~ 8518341 (-)
G143557 NA non-coding downstream 4570 8358822 ~ 8359102 (-)
G143476 NA non-coding downstream 44204 8277268 ~ 8319468 (-)
G143504 NA non-coding downstream 130284 8233185 ~ 8233388 (-)
G143502 NA non-coding downstream 135300 8228151 ~ 8228372 (-)
G143422 NA non-coding downstream 192860 8170586 ~ 8170812 (-)
G143459 NA non-coding upstream 14502 8385961 ~ 8388109 (-)
G143560 NA non-coding upstream 19999 8391458 ~ 8391661 (-)
G143570 NA non-coding upstream 70050 8441509 ~ 8442365 (-)
G143585 NA non-coding upstream 136273 8507732 ~ 8507964 (-)
G143463 NA non-coding upstream 157186 8528645 ~ 8533178 (-)
G143325 NA other downstream 477623 7884535 ~ 7886049 (-)
G143267 NA other downstream 689903 7669329 ~ 7673769 (-)
G142299 NA other downstream 923481 7439178 ~ 7440191 (-)
G142209 NA other downstream 1205674 7153623 ~ 7157998 (-)
G142203 NA other downstream 1220609 7141094 ~ 7143063 (-)
G144365 NA other upstream 2167321 10538780 ~ 10542148 (-)

Expression


Co-expression Network