G143479


Basic Information

Item Value
gene id G143479
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000027
NCBI id null
chromosome length 10680226
location 8578428 ~ 8590320 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU163010
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU163010 True 11777 lncRNA 0.37 2 8578428 8590320

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000027_08568349_08570750 NA coding downstream 7678 8567985 ~ 8570750 (-)
CI01000027_08537911_08550747 LDLRAD4B coding downstream 26970 8536827 ~ 8551458 (-)
CI01000027_08514843_08515829 MC5RB, MC5R, MC5RA coding downstream 60087 8514488 ~ 8518341 (-)
CI01000027_08483034_08503082 LMNA coding downstream 75346 8482939 ~ 8503082 (-)
CI01000027_08443968_08446252 NA coding downstream 131992 8443177 ~ 8446436 (-)
CI01000027_08595524_08646502 NA coding upstream 4618 8594938 ~ 8646502 (-)
CI01000027_08671118_08685781 NA coding upstream 80775 8671095 ~ 8685781 (-)
CI01000027_08688706_08696073 SLC45A4 coding upstream 98371 8688691 ~ 8697369 (-)
CI01000027_08701843_08702938 NA coding upstream 110462 8700782 ~ 8702938 (-)
CI01000027_08713799_08734144 DGAT1B coding upstream 123234 8713554 ~ 8734144 (-)
G143463 NA non-coding downstream 45250 8528645 ~ 8533178 (-)
G143585 NA non-coding downstream 70464 8507732 ~ 8507964 (-)
G143570 NA non-coding downstream 136063 8441509 ~ 8442365 (-)
G143560 NA non-coding downstream 186767 8391458 ~ 8391661 (-)
G143459 NA non-coding downstream 190319 8385961 ~ 8388109 (-)
G143597 NA non-coding upstream 64860 8655180 ~ 8655488 (-)
G143598 NA non-coding upstream 66989 8657309 ~ 8657680 (-)
G143601 NA non-coding upstream 69740 8660060 ~ 8660513 (-)
G143602 NA non-coding upstream 70638 8660958 ~ 8661221 (-)
G143603 NA non-coding upstream 71267 8661587 ~ 8661806 (-)
G143325 NA other downstream 692379 7884535 ~ 7886049 (-)
G143267 NA other downstream 904659 7669329 ~ 7673769 (-)
G142299 NA other downstream 1138237 7439178 ~ 7440191 (-)
G142209 NA other downstream 1420430 7153623 ~ 7157998 (-)
G142203 NA other downstream 1435365 7141094 ~ 7143063 (-)
G144365 NA other upstream 1948460 10538780 ~ 10542148 (-)

Expression


Co-expression Network