G190256


Basic Information

Item Value
gene id G190256
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000043
NCBI id null
chromosome length 7746009
location 1692620 ~ 1702330 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU216126
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>TU216127
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Function

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KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU216127 True 9384 lncRNA 0.36 3 1692620 1702330

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000043_01626021_01650266 ADGRA3 coding upstream 40807 1626021 ~ 1651813 (+)
CI01000043_01423076_01424727 NA coding upstream 267890 1422804 ~ 1424730 (+)
CI01000043_01383746_01406582 PPARGC1A coding upstream 286027 1382179 ~ 1406593 (+)
CI01000043_01366462_01369312 NA coding upstream 322733 1366462 ~ 1379702 (+)
CI01000043_00930835_00959810 BRAFLDRAFT_59675, DHX15 coding upstream 732409 930329 ~ 960211 (+)
CI01000043_01704935_01732125 NA coding downstream 2503 1704833 ~ 1732221 (+)
CI01000043_01842605_01846888 NA coding downstream 137753 1833978 ~ 1846921 (+)
CI01000043_01896926_01915626 KCNIP4 coding downstream 194596 1896926 ~ 1915626 (+)
CI01000043_01970557_01977108 NA coding downstream 268227 1970557 ~ 1977689 (+)
CI01000043_01992845_02000632 NA coding downstream 290515 1992845 ~ 2001617 (+)
G190292 NA non-coding upstream 53299 1638856 ~ 1639321 (+)
G190290 NA non-coding upstream 59418 1632833 ~ 1633202 (+)
G190249 NA non-coding upstream 98600 1587546 ~ 1594020 (+)
G190221 NA non-coding upstream 117895 1574506 ~ 1574725 (+)
G190220 NA non-coding upstream 125669 1566645 ~ 1566951 (+)
G190270 NA non-coding downstream 84735 1787065 ~ 1797398 (+)
G190262 NA non-coding downstream 146133 1848463 ~ 1895241 (+)
G190230 NA non-coding downstream 218702 1921032 ~ 1927918 (+)
G190306 NA non-coding downstream 251164 1953494 ~ 1953807 (+)
G190241 NA other upstream 141 1683556 ~ 1692479 (+)
G190272 NA other downstream 739532 2441862 ~ 2443710 (+)
G191670 NA other downstream 2200903 3903233 ~ 3909966 (+)
G191644 NA other downstream 2605618 4307948 ~ 4350614 (+)
G192454 NA other downstream 3290683 4993013 ~ 4993356 (+)
CI01000043_05114193_05114497 BOLA3 other downstream 3411556 5114193 ~ 5114497 (+)

Expression


Co-expression Network