XLOC_009330


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_009330
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 30911402 ~ 30915261 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00019203
gatttatttacaatactgttTGTAAAGTAGGATTTTctatattttagtagatatatcaTATAAGAGAATTGTTTTATTTACCAgttaagtgaatctaattggatttgctttgtaaagattaaataagttaaaaaggtttttttttcttttactttttatttatgacACTCCCAAAATtgttccacataaatctgcagatttttaaaaaaattctgtccagaaatagcaaaaaatgtctgcagtttCTGTCTGGCTCTGCATATAACCCAGGACTAGTACAGTCTTAAAGCAGTTTAACGTATAACTAACTCTTGTTTTTCTATAAATGAAGCCTTATTAACATTCTAAGcagaaaataatactaataataataatgtatttatagtGCATTTTTCTCAGACCCTAAGCGCAAAATGTAATGACAAGCTGGTTTATGATTATGATATGCTAGCTAATGAGACCCGGTTAAAATATGGATGCTTTTAAggtattaaaatgataaaaacattgacattttaaaaacttcatgAAATCCAAGCGAGAGATTTTGGTTACACTTTAGTTTAATGTCCAATTCTCTCTATTGATTAATGGTACCTGtttattacctgtctattataaagatattgtctgtttatttgtacatgtaaaatacattttctgcTTGATCTTATTGTATCCCCTAAatctacccaatacctaaacctaactactaccttaataactaataataagcaCCAATTTAGGAGTTTGCTGAGGCAAATGTGGTAGTCAATGGCTTATTAATATCGAGAAATGtacctttaaataaagtgtgaccgagatGATTTCTGACATTTTACTTATTAGCGTTGTTGGAGTGGCTATATTGTGGTGTACTTAGACTAAACTTtaacaaatacacacatttaaaatatacaatttttgtCTTCTGGACAAAAAGGACAAAGCACATTGATGATTCATCATGTACTAAATCATATTCTTCTCAGATTGAGTCCCCATTGACTATCAAGTACAAAAATCATAGTAAATGATcatattataactaaaacctaaTGATTAGTCAAGACATAGACtcttaaatgtgttgaaaacaccAGTGCTGGGAAGAAAACAACACCTATTATTTAGATACTATTATAGCAATTTCATAAAGTCTTCAAAGGTCTTTAACCATTACAGTACATTTTAAGTCCTCTGCCAGAAATCATCTTGGTGTAATTGGTTCTGGAAGAGAGAATTGATATTCACACAATACTAGGGCTGTGGTGGTGCAGGTGCATCAACACTATCTGATGTTTGAAAAGGAGCTGCTTCTTCTGAAAGGGAGTCCAGGGGAGCTTGACCATCCTGGATTTTGTTTTCCTCTGCCTGAATTGGATCTTGAACAGCTGTTGAGTTCCCATTGGTGGCGTTGGTCTCATCTGGATTCTGTACTCCAAATGTGCTGCCTTGCGGGATATCTTCCATAAAAACGTCCTCACTTGTGTTCCTACCAAACGCCAAGTGGTTGGAAATGGACATTTGGTTGAAGCTATGTCTGTTGATGGCTTCGGACTCATCCATAGTTGGCAAGTTTGGATGAACGTCACCATCTAAAAATGGAGAGGGTCCTGCCCACACAGGATTTTCTAGCTGTCTTTTCTGCATTTTGCGTTTTCTCACCAAAATAATGATGATTGCTATGAACATCAGCAAAAATGTGGTGACAATCACTCCTGCCACAGCAGGACCTGGGTTCGCTTTTTGGCTGTCTTTTTTGATTGATAGAGTGGTACTTTGTTTAGGAGTGGTCTTTTTAGTGGTTGATGATTTCTTTGTTTTAGTCACAGGTTGAGTCTTAACCTCTGGTCCTTGAGTCCATTTGATTGTAACTTTTCCCTCTGTGGTTTTCAAACCAACGGTTGCAGCCCCACTGACATTTGTTTCAGCTATTATTGCGGAAGTGTGGGCGTGAGTCATTGGGCTTGGTTCTTTTGAAGTCCCCATTGTAGTATGGCTTGTatgaacatctttatatgtattgtttttgttgGCGTCTGTTTCATTTTTTTCCACTCCGTAGAGTCCAGAGAAATCAGTAGTAGAAAGTGTTTCCAGAGTGGTTTCTTGTGTCTCTGAATGATCCCTCTTAGTTGTTCCTATCTGTGAAAAATTTGTCGTTGTGGCAATGGGTGGTTGGGTTGAGATGTTAAATTCTGTAGCATTCTCAATCTGCAAAGATGAGTTATGTAGCCTGTGGTGGATTTCTGTTGGTTTTCGTTTTTTATTTGGAGTGGTTGTGACCTCTTGTGTTATTAGCTTAATAGGCTGCGTGAGTGTAGGAGTCAAGTTTTGCTGGCTATCATCTGCATTCCTCTTCGTCCTCCAATTTGATGTTTCATCTTCATTTCTGAACGTCTGCAACAAGTCGGGCTGCTTTGAATGGCTTGTGAAGTCCTGCGTCTGCACACTTCTTGACTGTGAAACCTGAATGACTTCTCGTGTCTCTGAAGGTCCCATGCTTGTTCTTAAAGTATCCACCTTTGTAATGTAGGGGATTTTAATCGATTCTGCAGCATTTTCAGTCCTTGTTAAAAATGTTGAATCTGGTATGTTGGATGTTTCAGACATATTTGCTTGTTCTTTTTGTGCAGTTGTTGCTGCTCTTTGCGTTAAATGGTTTTCAGTTGGTCCGAATGTGTACTCACCATCACCTTCATTCCTCTTTGTTCTCCGATTAGGTGTCTCACCGTTCAGTGTCCTAGGATGGACAATTCGCTGGCCTGAGTGACTTGTGAGCTTTTGCATCTGTTTGCTTCTTGAAACTAAAACATACTTGGCTTTCTCTGGCAAAACATCTGTCCTTGTGGTATTGGGTGTTTTAGTGGATGCAAACAATTCTGTAGTATTTTCTATCTGCAAAGGAAATGTAGTATGTGGTCTGTGGGAGCTGTTGGTTTGTTTATCTTCCTTTTGTACAGTTGTTTTaacattttgcagtattttgttATTTGGTTGTGCCAGCATAGTAGTCAAGCCTTGATCATCATGCGTTTTCCTGCTACGATATGATGTCTCTTCTTCACCTTTTAACGTAAACCGTGAGTGGACTCCTTGCTGGTCTGAGTGACTTGTGAAGTCTTTCGTCTGCACGCTTCTTGAAACTGAAATCTGAGTGGCTTCCAGTGTGTCTAAAGGTCCCATGCTTCTTGGTTCCTTTGGCGAAACATTGGCATTTGTGGTATTGGGCCTTTTAGTTAAGGCATGGTGTGTAAGCACTTTCTGCAAAGGAGATGTAGATTTCTCTCTGTACCAGCTTTCTGTCATCTTTCGTTGTTCCTTTTGTGGTGTGCTTGCTACTTCCTGTGATAATTTGGTTTTAGGTTGTGCCAGCAAAGTAGTCAAGTTGTATTGGTCATTCTCTGCATTTTTACTCGTCCTCTGGTTTGATAGCTTATCATCAGCGTAGGGTGTCTTCGAGCGGATGCCTTGCTGTTCTGAGTGGCTTCTGAGGTGAAGCATCTGAATGCTTTTTGAAACTGAAACCACGTTGTCTATTCCAGAATCAATAGTGTACTCCCTTTGCCCTGATGCTTTATCTGCTGTGTTTGGTACCACGGTGTTCTTATGGCTGGTAGTTAAATGGCCATTTAGACTCCATGGAAGAAAGTAGAGGAAAGCGATTGTGCAAAGAGTAGCCCTCATGGTGTCCTTAGAGAACCTTG

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00019203 True 3710 lncRNA 0.38 2 30911402 30915261

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_009328 akap1b coding downstream 54052 30836981 ~ 30857350 (-)
XLOC_009327 msi2b coding downstream 78505 30424645 ~ 30832897 (-)
XLOC_009326 NA coding downstream 549988 30359330 ~ 30361414 (-)
XLOC_009325 NA coding downstream 589188 30316728 ~ 30322214 (-)
XLOC_009324 NA coding downstream 605602 30300780 ~ 30305800 (-)
XLOC_009331 NA coding upstream 7889 30923150 ~ 30924089 (-)
XLOC_009332 lgals9l6 coding upstream 72153 30987414 ~ 31000306 (-)
XLOC_009333 AL928870.1 coding upstream 90720 31005981 ~ 31012712 (-)
XLOC_009334 lgals9l4 coding upstream 106753 31022014 ~ 31027112 (-)
XLOC_009335 lgals9l1 coding upstream 116994 31032255 ~ 31043183 (-)
XLOC_009323 NA non-coding downstream 752727 30156924 ~ 30158675 (-)
XLOC_009322 BX322555.5 non-coding downstream 781637 29886423 ~ 30129765 (-)
XLOC_009342 AL928851.2 non-coding upstream 384302 31299563 ~ 31299678 (-)
XLOC_009344 AL928851.1 non-coding upstream 399948 31315209 ~ 31315548 (-)
XLOC_009348 AL845428.2 non-coding upstream 446526 31361787 ~ 31362141 (-)

Expression


Co-expression Network