XLOC_009376 (CR855379.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_009376
gene name CR855379.2
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 33868661 ~ 33887667 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00018425
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>TCONS_00018426
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>TCONS_00019210
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>TCONS_00018427
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000100511

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00018426 False 857 lncRNA 0.46 5 33875205 33887363
TCONS_00019210 False 7998 lncRNA 0.36 1 33879353 33887350
TCONS_00018427 True 1905 lncRNA 0.39 4 33879353 33887667

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_009375 mmp13b coding downstream 34084 33825750 ~ 33834577 (-)
XLOC_009374 n4bp2l2 coding downstream 49789 33809864 ~ 33818872 (-)
XLOC_009373 pds5b coding downstream 60903 33744549 ~ 33807758 (-)
XLOC_009372 trmt9b coding downstream 134549 33702918 ~ 33734112 (-)
XLOC_009371 NA coding downstream 186983 33665924 ~ 33681678 (-)
XLOC_009378 mag coding upstream 4141 33891808 ~ 33933820 (-)
XLOC_009379 lsr coding upstream 50089 33937756 ~ 33965440 (-)
XLOC_009380 si:dkey-30e9.7 coding upstream 106908 33994575 ~ 34056879 (-)
XLOC_009381 etv1 coding upstream 284704 34172371 ~ 34214440 (-)
XLOC_009382 dgkb coding upstream 328129 34215796 ~ 34326461 (-)
XLOC_009370 CT027778.1 non-coding downstream 205489 33663055 ~ 33663172 (-)
XLOC_009367 NA non-coding downstream 1050666 32813736 ~ 32817995 (-)
XLOC_009366 CR855389.2 non-coding downstream 1232884 32633290 ~ 32635777 (-)
XLOC_009364 NA non-coding downstream 1434988 32413314 ~ 32433673 (-)
XLOC_009383 FP017158.1 non-coding upstream 391754 34279421 ~ 34279535 (-)
XLOC_009389 NA non-coding upstream 714855 34602522 ~ 34607406 (-)
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XLOC_009406 NA non-coding upstream 1726567 35614234 ~ 35675985 (-)

Expression


Co-expression Network