G194721


Basic Information

Item Value
gene id G194721
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000046
NCBI id null
chromosome length 7063170
location 458008 ~ 460345 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU221151
GTTTGTCTGTTATTCTCTGTGATTATCCTCCTGTGGTTATTATTGAAAGTATTTCCCTTGGATTGCTTGCGTCATGCAGCTCCTTACAACATTTATATACCTGACAGGTGTGAAGATTAAACGTGTGACCAGTGCAAACAATAACCAGAACAAAAACTGTTTCTTTTCACAGAGCAGAATGTGATCTGTATAATTTGTCTTCCTCTCTATTGTCACGTGGCCTGTGCATTTACTTCATCTGCCCTGATGATTTAGTCTAAACCAGCTGCTCTTCAAATAATAATTCACAGTATCTTTGACTGGTGCTATTGCCTGTTTTTAAATGTGGAAGCAATAAAATGTGCAATGATTCATTTGATTTTGTCACATGGATTGGAGTCGTGATCTGAACTGGTACCTTGGCTTTAGGTGACTTTACATCTGTGTTTTAACCCAGCCTTTTTACAATATCAAAACTAAAAGCAAAAGTAAAGGCTGTTTATGAAGCCGGTATTTTTTCATTTCTCATCACTTGAGGTAGAAAATTCGAACCTAACAGAACGAGGATGGCGTTTCTCCAGGTCTATTTGAAGGTTAACAAAGACACAATTAAAACAATAAGTCTGTCAACATCAGATGAAGACATTGGGAAACCCACCGTCAAAGATCTAAAGAAAAAAGCCCTAAGTCATTTTCCTGGAGTGAATGATCATAACCATCTGAGGTTGATTTTCAATGGAAAAGATCTTGAAAATGAAAAAAAACTTGAAGATTACGGCATTCAAGAACTCTCTGTCATTCAAGCCATAATGAAAATGCGTGGTGGAAAAGACCCAGTTCCACTTGATGAAGAGTTTCCCAGGACTCAGTCTATGGCATGATTATATTTTAATATTTGTATATAACTACATATTATATGACAAATGTGTTAAGAAAATGTGTAAATGACAAAACAATTAAATAACAAAAAAAGAATAAACTGTAATAGTGTAAACCAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTCTCCCAAAAACTATTAAAATGTTTGTAGGAAAGATTATTTTTGTTGTTGTTGATCTTAAGTATTTGCTTCAGAAAAATCACCGGAATTAAACCTACATTAAAACAATGTAAAAAATTATATGCTGTAAAAAAACAAATACAAAAAGCAAATTTGTTTGTATACTTAATTGATGTAGACTTTTTAAAATCTTTTTACTTTTTCATAATGTTTATTGATTGTCACCATGATTTCAGTTTGCAGGTAAAGCACTGAGGACATAATATTTTGTACTTTAGTGTGAATAAAATATGCAATGATAAATGAGCAGGGCAAATTAGATTGACAAGACGAATAATAATTGAAAATTATTTTAATTGATTGATTGATTGATCATAATTAATTTAAGAAGCAGCCATTTGAGGTGGACAGCTGATTTTAAGTAAGTTGTAGTACTCAGTTACAGTACACTTGGATATAAACTTTAGTTATCTTACTGTATGGCACTGTGTAGAAGGTTAATTACTTTCTTTTGATTGAGTTAAATAATTGTTATTACAGAATTCTCTGAATGTGAAATTGTCCTGTTCTCTAGAAAGATAACCATTACTCAATTGTGGAGTAATTACTATAGTTTGCTTGTTTGTTTTTATTCTATCAGTATTATCATTTGGTTTTATTGTTGGATATGTCTTATTACTTCTTACTTTTCTTTATTATAAATGACTTTCTAACTGTATCCACTGTATTCATTACTGTATCCAATAAACTCTGAATTCAC
>TU221152
GTTTGTCTGTTATTCTCTGTGATTATCCTCCTGTGGTTATTATTGAAAGTATTTCCCTTGGATTGCTTGCGTCATGCAGCTCCTTACAACATTTATATACCTGACAGGTGTGAAGATTAAACGTGTGACCAGTGCAAACAATAACCAGAACAAAAACTGTTTCTTTTCACAGAGCAGAATGTGATCTGTATAATTTGTCTTCCTCTCTATTGTCACGTGGCCTGTGCATTTACTTCATCTGCCCTGATGATTTAGTCTAAACCAGCTGCTCTTCAAATAATAATTCACAGTATCTTTGACTGGTGCTATTGCCTGTTTTTAAATGTGGAAGCAATAAAATGTGCAATGATTCATTTGATTTTGTCACATGGATTGGAGTCGTGATCTGAACTGGTACCTTGGCTTTAGAAAATTCGAACCTAACAGAACGAGGATGGCGTTTCTCCAGGTCTATTTGAAGGTTAACAAAGACACAATTAAAACAATAAGTCTGTCAACATCAGATGAAGACATTGGGAAACCCACCGTCAAAGATCTAAAGAAAAAAGCCCTAAGTCATTTTCCTGGAGTGAATGATCATAACCATCTGAGGTTGATTTTCAATGGAAAAGATCTTGAAAATGAAAAAAAACTTGAAGATTACGGCATTCAAGAACTCTCTGTCATTCAAGCCATAATGAAAATGCGTGGTGGAAAAGACCCAGTTCCACTTGATGAAGAGTTTCCCAGGACTCAGTCTATGGCATGATTATATTTTAATATTTGTATATAACTACATATTATATGACAAATGTGTTAAGAAAATGTGTAAATGACAAAACAATTAAATAACAAAAAAAGAATAAACTGTAATAGTGTAAACCAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTCTCCCAAAAACTATTAAAATGTTTGTAGGAAAGATTATTTTTGTTGTTGTTGATCTTAAGTATTTGCTTCAGAAAAATCACCGGAATTAAACCTACATTAAAACAATGTAAAAAATTATATGCTGTAAAAAAACAAATACAAAAAGCAAATTTGTTTGTATACTTAATTGATGTAGACTTTTTAAAATCTTTTTACTTTTTCATAATGTTTATTGATTGTCACCATGATTTCAGTTTGCAGGTAAAGCACTGAGGACATAATATTTTGTACTTTAGTGTGAATAAAATATGCAATGATAAATGAGCAGGGCAAATTAGATTGACAAGACGAATAATAATTGAAAATTATTTTAATTGATTGATTGATTGATCATAATTAATTTAAGAAGCAGCCATTTGAGGTGGACAGCTGATTTTAAGTAAGTTGTAGTACTCAGTTACAGTACACTTGGATATAAACTTTAGTTATCTTACTGTATGGCACTGTGTAGAAGGTTAATTACTTTCTTTTGATTGAGTTAAATAATTGTTATTACAGAATTCTCTGAATGTGAAATTGTCCTGTTCTCTAGAAAGATAACCATTACTCAATTGTGGAGTAATTACTATAGTTTGCTTGTTTGTTTTTATTCTATCAGTATTATCATTTGGTTTTATTGTTGGATATGTCTTATTACTTCTTACTTTTCTTTATTATAAATGACTTTCTAACTGTATCCACTGTATTCATTACTGTATCCAATAAACTCTGAATTCAC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU221151 False 1756 lncRNA 0.31 3 458008 460345
TU221152 True 1644 TUCP 0.31 4 458008 460345

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000046_00436111_00443677 NUDT6 coding upstream 12510 436111 ~ 446757 (+)
CI01000046_00107578_00163060 NA coding upstream 294873 104109 ~ 163135 (+)
CI01000046_00100813_00103411 LERL1, LEPROTL1.L, LEPROTL1 coding upstream 353924 100568 ~ 104084 (+)
CI01000046_00477221_00481241 NA coding downstream 16876 477221 ~ 481243 (+)
CI01000046_00492034_00493262 KIAA0141 coding downstream 31689 492034 ~ 493338 (+)
CI01000046_00494421_00496860 KIAA0141 coding downstream 34076 494421 ~ 496958 (+)
CI01000046_00499754_00526138 NA coding downstream 39409 499754 ~ 528550 (+)
CI01000046_00670755_00673139 NA coding downstream 210410 670755 ~ 673447 (+)
G194750 NA non-coding upstream 32584 407504 ~ 425424 (+)
G194710 NA non-coding upstream 72968 384837 ~ 385040 (+)
G194706 NA non-coding upstream 81253 376552 ~ 376755 (+)
G194684 NA non-coding upstream 130463 327232 ~ 327545 (+)
G194727 NA non-coding downstream 4269 464614 ~ 467283 (+)
G194762 NA non-coding downstream 26588 486933 ~ 487340 (+)
G194779 NA non-coding downstream 127780 588125 ~ 588490 (+)
G194780 NA non-coding downstream 129225 589570 ~ 619405 (+)
G195003 NA other downstream 700812 1161157 ~ 1161690 (+)
CI01000046_01540075_01668012 HS3ST4 other downstream 1079149 1539494 ~ 1668012 (+)
CI01000046_01865451_01881353 NA other downstream 1412450 1865451 ~ 1881369 (+)
CI01000046_02451052_02454565 MAFK other downstream 1979572 2442395 ~ 2457280 (+)
G196936 NA other downstream 2726650 3186995 ~ 3194271 (+)

Expression


Co-expression Network