XLOC_009632


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_009632
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 3458215 ~ 3461793 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00021871
attccttaagtaaataataaaaacaaaaataaataaatatttaatgtgtttatttacaatgacaaTTTGTTATAATCCACATTAAACAAATATGTTGTATAATGAACTGTCTAAAACTTGAGTTATTATtgatacaatttttttgtttattgtctaTCATAGATTAtggcagaaaaaaaaaggaagagtGATCCttgaaacaaattaagttttagtCTATTCCTCAAAAAACATCTTGCATGACTTGAAATATTCTgcacaaatgacaaaaaaaatattctcattttgtgtttctttttttactaAAGAAAAACACATTTCGAGCCAcaatgattttcattttcaagtgAACTACTCTTTAAAGCATCAACATTTGATTGAATCCTTCATTCCTCAATATTCCTAAAAATTCCCTTCATGTCCTTTAAGAGATTTGATTTGTTACATTGCATCAAAAAAAGAAATAGCAACTGCCCCATGACAAGATCTACTGagtacaacccaggctcattcagaTCATGTAcgcctatatacatttttgcagagcactaaatacgtcccaggagctagattttcttgcagtttttgttttcgcaaatccgccaAAGTctgtgtgtatgctttttaagatctcagatttctcttgcGTGTGCATTTATACCTGCTGTTCTAGCGTAAAACCACAAGAgGGCGctttgtatgctttttcagatctcaaatttccctgGCGAGTGCCATATGTGCTtactgttctcgcataaatccactagaggccgctgtgtatggtttttgagatctcaaatttctctcgccagtgccattcatgcctgcatttctcacATATATCCACTAGATGCCGCTGTATACGCtttttgagatgtcaaatttctctcacaagtgccattcatgcctgcatTTCTCACATATATCCACTAGAGGCCGCAGtatacgctttttgagatctcaaatttttctcgcgagttctcacgtaaatccaccagaggcttcCGTGTATTTTTTTGCGATCTCTAATGTCTCTCACAAGagtcattcgcacctgctgttctcacgtaaatccaccagaggccgccgtgtacgctttttgagatctcaaatttctctcgcaagtgccatttgtaCCTGCTGTTCTTGCAGAAATCatctagaggccgctgtgtacgtttttttagatctcaaatttcctctggctacataatttgcgatctccagaaatgtatacagggctacattttttagaatgagcctatgttgattgaGTAACATGTTTGAGAACCGAGCAGACATTTGACGGTGTAAAAGTCAATccttttgaaaaatgaaataaaataaacataaattaaaaatccACGATGAGTGTTCATGGAAAGCATGACACGGAACCGGTCATCATATTCTTCTCTGAATATTCAGTTATATGCCTTATTTATATACATCTGGAAATCTCACCACTCCGATAACTTCCAACAGAGGAAGTAAGTGTGCTGGAAATCGGGACTCTAAATGGTCATTTCAGTTCATTTGAATCGCTTTCTCGAGAGTAGATGCTATATTACAGTATGCGTGTACCGCCTCTCGATACAGCAAATTAtcgagaagaaaaaaatacaggtAAAAATCATCGGTATTTAGCAAAATACAGTAAATTTTCTCTTCATCTAATATATACCCTACTTTGCAAGAGAGTGTTAAAATTACACAGGATTCGAATAACACATATACAATGAGCTTTCACCAAAGAAACATCGAGTCACGTGAAGTTATTCTGATCGGTACATACTGTAATTCaccataaaaacacaaaaaaatgctttttttcttctgtttttgcgcttgtttttttttttcgtcagtGTCCTTTAGGTTGACCTCACGGAGGCCTGTGATTGGTCGAGCTGCCACAGAACGGGCAGCGGGTGAAGACTCGTAGCACCTACATGTCATCAGGAGAACGTTTAAGTAGCTTCCCACATGTAGACgacacatggaaaaaaaaaacatcacagatGATCGATGTATTTCATACTACCCATGAGAACTGCTCGTGTGAAAAATATCGGCCACATTCTGAGACGAGAGGCTTCGGTTTTGTACATCTGTATTGCAGTTTTGATGTCTGACAAGCTTGTATTGCAATTTCTGTACTGGTTCATTCAGCTTGTTGGATGAGAACTTGTGTAGCCAATTGTGAACGTTGCGTTAACGATGATTTGAAATCTTAATATCAACAGTCCTGGATAATGAGGATAGTGAGAATGATACTTGAATGATGGCGTTAAAATATCAAAGATAAAATCTGATGGACAATggtcaaatcaaaataaatacataaattaaatattgataaGCAAATACTTCAAATTTACTTTACATTAGACCAATTTGTAATTCCACTAGCACAGTTTtacttaaattgacatttttgttattgtttataaaacataattttgttattatacctaagatataattatatattattaataataacaaacaccccccccaaaaaaaaaaaaaaaacataaaatttttcAAAAGAGGCTCTAAAAAATTTGtctatataatttgtatatttagcctaatctcacgaggaaactaATGGTATTCAATCAACAATCAGgttttttttcatgcttttttttaaagaaaatcatcAAGGTgggatttattaaatgtaataaaattgtttagttgttaaatattaattacaatttaaaataaatgctttcttattgtatggaGTTTTAAATGAAACAGTTACTCCAGTCATTAGAGCTTTtattactaatacattattattattattattattattattattattattattattattatcatcatcattattattaatattattatcaataataataataataataataataataattaatattagagggaTTTCGGAAGGATCATGTGATTTTGAAGAcaggagtaatgaagctgaaagtcCATCAAGAAAatcaatataataaattattaaattaaattataaactacatttaaatagtttttattcattcatttatttttttttagggttagtcccattattaatctggggtcgacacagcggaatcatcaacttagcatatgttttacacagtggatgcccttcttgaatttaaatatatatatttaaattctagtATTTTTTCCTCACAGTTCCTTTTCTgggaaaaaaatgttatttatgaaaataattcagagatataaagtcagaaatcAGAATTTATATCTtgcattttcttcttctttttttgaatGGCCAATGCATATTTTACTTGCAATTCTGACATTTCAC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00021871 True 3331 lncRNA 0.32 3 3458215 3461793

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_009631 CABZ01052320.1 coding upstream 104598 3353501 ~ 3353617 (+)
XLOC_009629 NA coding upstream 266065 3182749 ~ 3192150 (+)
XLOC_009630 wdr21 coding upstream 268416 3185541 ~ 3189799 (+)
XLOC_009628 NA coding upstream 308398 3147262 ~ 3149817 (+)
XLOC_009627 NA coding upstream 320972 3136158 ~ 3137243 (+)
XLOC_009633 NA coding downstream 129618 3591411 ~ 3593405 (+)
XLOC_009634 NA coding downstream 196534 3658327 ~ 3659417 (+)
XLOC_009635 NA coding downstream 347801 3809594 ~ 3815081 (+)
XLOC_009636 NA coding downstream 466273 3928066 ~ 3948317 (+)
XLOC_009637 zc3h12a coding downstream 520797 3982590 ~ 4001743 (+)
XLOC_009625 NA non-coding upstream 399124 3053424 ~ 3059091 (+)
XLOC_009640 NA non-coding downstream 670744 4132537 ~ 4175024 (+)

Expression


Co-expression Network