G225467



Basic Information


Item Value
gene id G225467
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000053
NCBI id null
chromosome length 7014373
location 272956 ~ 280959 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU255771
ATGAACAGACATGAATTAGCACTAATCAATAGAAGATTTCTAATTTGGCATTAACGTAGATTAATAAAAGCTATAAAAATGTTATTCATAATATTAGGTATCATGAATTATCTATGATACATTTTTTTTATCTTTATTATGTTAACTAATGTTAACAAATTAGACCATATTGTTAAGTGTTACCAGAATTTCCATTGTAAATGTTTGGCTCGCAATTTGTTACAGTTAGTCAAACATAGTTAATAAAGTGACAAAAAATGACAAATAATCATAATGTTATGACAGTAATGGATATTAGATAAGCGCTCACGCTGAATGAATACAATTTCTGTTTGTGATTTACCCATAGGTGAGTCCTGACTAACTTGCAACTTTTGAGATTACTGAAACAGGGTATATTTAGGTAAGTTTTATAGCTGTTTTTATGCTACATAAAACGTACAAACCACAGACTGTAAAAAAAATATGGACGTAGTGTCCGTGACGTCACCCGTAGATTTCTGAAGAGCATTTTTGAAGCGAAAATGAGGCCGCTGCCATCTTAGCAGTGCGTCACTCCCGGATAACTGAAAATGGGCAAAGAGGCGGGACGTGGTTGCTGAAACCACATCCGCCTAGCGCGACGTGATCATGTTAGCAGGCAAAGGAGCTATCTATATATCTTAGATACTATCTAAAATATTAATATTCTAATTATATAACTTGTTATCTTTATTAGTTAATAAATATAAGTTATATCATTAGAAAGTTCTAAAGGTTTACTGTCAATCTACGGTGTCTTTTTTACGATATAGATGCTCCAGCAGCACCGGTAATTCCAATTTGTGTCGGGTGTGCACATGACAACACGAAAAATCAAACGGGACTTCATACCTTTATAATGAAATAGTGATCGCGAGATGAATCCAATCCGTGGCACTGGGTAAATGATGAGTATCCATTGAAAAACAAAAAACAGTACTTTTTGTCCACAAAAGCGTTAAATCCATGAAATATTGATATATTATCCATTGTTTGCATCACATTTCTTCTGAATGATCTGCTCTCCATCATCGTTCTTCAAGAAATTATGCAACCTGAGCAGTGTTTGTGTTGTAAAACTGTATATGATTGTATAAATGAGCCCGCGTCCAAAGTATCATTTTTCAAAATGCAGCAGTTTTAGTTATAATATCCAAGCAGTGCTGTCAGTTTTATATCCTCCCGCCATTGTCATTGTAGTAAATCTCACGAACAAAACTTTTAGCCAATGCCACGATCCAACGCGTGTTCTGTATATCTTCCGTATTTGAGCACATGTACACAGACGCACATCTGCCTCGAGTCTCGACCATTAACGCAGCAAGCCATATTATTTTTTTAATTGTATAAAATAATCCCGAAAAAAAAGCACAAACACGGCAGAAATGCCAAATTCAGTGGCTGGAATTAGCTGAGGTAAAGTGATGGCTCACAGACAGCAGCGCAATTCACCTGTCACTCAAGTGACCACGCCCTTAATTATGCTGAACTTTAAGGCTTAATATAATTTAAACGGATGAGTTATAAAAAAAATCACCCCCCTCAGAGTTGTCATGAAGGGCAAAATTAGTAGTATAGACCAAAACCACAATTTGATCCAGGCTGTAAACATGTTTTTTTCTGCTGTAAAGTTGGCCATTTTAACATGGGGGATTCTGCTCTCTTTTGGAGCCTGTCCCTAGCGGCCAGTCGATGAATCGCAGTTTAAGTCACTTCCATATTGGCTTCAAGAGAAACTGGGGGAGGTTGCCACTTGGTACAAACATAGAAAAATGTACACTTTTACATCTTAATTCTCAACAGTATCAGCATAATTAATGTACTCACTTCCAGCATGAAAAGAATGTCCCACTAGATTCCCATGGGTAGTTTTGACATTGTGGTGGCGTTCGCCTTGCAGATATAACCATTTTGACTTCAAGACTTGAAGGCAGCATATGTCTAACTGTGTGCTGATTTTGTCTCAGAAGTGTTTGGCCAGCATGTTCTAAAAGTTTTCATCCTCCATGCATTTTAACAAGCAGTGGGCTGTGTCGGGGGTCAGCTGGCTCCAGGCTATGTAGCCCACTGGCTGATCAATGGAAAGAAAAATACAGACCTTGTAAATCCTTCAGGCTGTGTTACAAACTAGAACATGGTGTGGGCGGGGTCAGGGGTCATCAGAAGAGGGTGAGAGCACAAATTGCTATTTACATATTTAATATAAATTAAAAAGTATTTAAATTGTATTGTGACTACATTGCTTCTATTCTGTAATTTGGTGCCATTAATGCATAATACAGAGATAATTAGTTACATCCCCTTAGGTGCTGATTTTCTGCTGTTGTTTGTATGCATTCATAAAACTGCATCAGTTAGCTAAAATCAATGCAACCCCCAAGTTGTTGTTGTATTATACTGATTAAAAGTGGCATTCATTTGAGCGATTGATTCACATCTGATTATTACCTGTCATAGTCCACCTTAATATGAAAATCTGTGACTTTATTTCTTCTGTGGAGCACAAAAGAAGAGATATTTCTCAATGTTTTCTTTTATGTTCCCCAGGAAGTCCTAAAAGTTTATAACGACATGAGGGTGACTAATTTAAGACAGAATGATTATTTCTGGATGAACTGTCCCTTTAATGGTGGAGTATGTAATATGGACAACTAGTACTGCAATCCAAATTCAAAATATTGGAGAGAATTGTTCCTCCTCCTCAGACTTGACTCTCACGCAAGCTGCAAGATTGAGGACATGCAACAGGAACGAGCGCAGTTGACAATGGAAAACCATAAGCCTTAGGGGCTGTTCACATAGAACGCGTTTTTCTATTCCAATGCACTACTTTTCCATTGTTTTTCTATGTAAGCACGCACTAAAAGGACGTGTATGATCGTTACGCTTGCGTCTCATGTCTTTTGCAGCGCCTCGCACATGAACGCCGCGTTTTTAAGATGCCGTGTCAAGTTAAAAGAATTTCAACTATTACACACAGCACCGCTCATCAATGTCAGTTCCAAAACAGTGGACCAATCAGAAGAACTCGGAGGCGGGGCAAGCATTGCAAGCTTTTGTTTACAGTAGCAAGTTAGCGTGGCAACTGTTTTATTTGTTGGTTATTGCCTGTATTGCATTGTGTCTCAAAAGTGCGTCTCGAGTCCCTCGCATTCTGCGCTGCGTTTATTTTTAAACCATTCCTGAGCCCTGCGTCTCGCGTTTTTAGATGCAAAGACACGTTCTGTGTGAACAAGCCCTTGCACTGTAAGCTGATCAGCTAATATATACGTTTGCAACGTTTTTATTGCCGAGGCTTTTTAGGTCTGGTAGAATCTGTGGTTTCTCACACAGTTCATTTACTCACTTTCTTGGCTGCAATACGCTGTGTTTTCCAACGACTGGCAACCCGAGGTGTTGAAATACTATTAGGTAAATTGGCAATGGGCGGGATCATACAGACCAAAACAAAAACAGACTTTCTGACATGAAATGCACATTTCAAAGTTGAATAAATGCCAAGTTCTCTCATGAAACTCTAGATGGCACAGGCTAATGGTTCCTTAACGCAACCTTGACATTTACATAGTTTACTACATGGCACAAGCTGATTGGTTCCTCTCGCATCTGCAGCCAATGAGATTGCTGCTCAACATTTAAATAGCTGGTTATAGTTTACTATAGCAGTTTGCAGCATGCTCAACCTGTATAGATCTGCTATAGGTAATTTTGCTATTTGTGCAGCAGCAGTATATCTTGGATGCCACAGCAGCATATCAGTGTTTGTATTGACAGTAGCAAGGCCCTGTACTTGGTCTGCAGCCGAAGCAATAACCTACAACAACGGCAATAATCAACTGCAGCAGCGTGGCAGATCTATTTCGCCAACACATGCTTAAAATCTTCAGAGAGTTGTCATGATAGAACTGGCTGTAGCATTGTTTTTCAGAGAAACAAGTATTTGAACTTGCATGTTTCCTAAATCTCTGCAAACATATTATGGAATTTTTATGCTTCCAGCATCTTTTAAGTCAGAGACTTGAGAGGAATGACGGGTTAGTGCATAAGGTCACATCATGTAATATCCGATACTTCCTGATTCATGGAATGCTAACAATACCAGAAGGCTACTCAAGGAAGTAAAGCACTGTGTTGTTGTTTCCTATTTTCCTGTGAAAATACCAATCTTTTCACTTCACCCAGTCCAACTTGTGTGCTTCAAGTCCCTTAACGTCATAAGGAGCTGAAACGGAACTTTGCAGATTTTCTCTCGAACACCTGCGCTACTGTGAGCTAATTAAAGTTAATGAGTGAATGAATAGAGTTGTGAGTCATGTCTGTTTACCCAGCATCCCTCAGCTGATGCTCACGATGAAGCATCTTGTGAATGAGTCTTACTTGAGACCCAGATTCAAATTAGACTGTGAGCAGACTTTATTTGTGAAGCACACAGCTGCTCGCTCGGATATGGCCAAGTCGAATGTAGAACAGGTAGTGAATTTTTCAGATCGGATGCTCCTTTACCCATTGACTCAAAATCGCGGGAAGAGTCATCGAGATTTTTTTTTTTTTGTCATTGCAGGTTTTTAATTTAAGAAAGGAAGCAGACAGAGCAGGGTTATTTTCTGAATGGGCGTGAGTTGAGATTGTAGGACACACATGCTTTAGAGACCAATAACATCTGTATCTGATACAGCTTTTCTTGCTTTGTTTAAATCACAAGAACAAGCTACATGTGGGTAGATGAAACTAGTAATTTAGTGATCAACCAATATGATGTTTTCAGTGTTGAATTTACATGCCACGTCCACTTTTAGAAAGTGGAAAATGGTGGTTAATCATATTTTAAAGCAGGTGTCATTATCAGACCATGGTCTTTCTTGGTGAATAGAAAGACCATCTGTCACATAATGTATATGGCTGAGTGTTGCATTTTAAGCAACAATATGTCTGTGGCATCATACTTATGTCTCGTTTCCCCTATTTCTACATTTAAATTA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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU255771 True 7984 lncRNA 0.39 2 272956 280959

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000053_00236043_00262938 SGSM2 coding downstream 9392 235840 ~ 263564 (-)
CI01000053_00116887_00128931 NA coding downstream 143227 116666 ~ 129729 (-)
CI01000053_00094748_00113755 ULK2 coding downstream 159201 94497 ~ 113755 (-)
CI01000053_00292771_00295073 TNFAIP1 coding upstream 10955 291914 ~ 295073 (-)
CI01000053_00379771_00382260 NA coding upstream 98750 379621 ~ 382260 (-)
CI01000053_00390989_00410148 SUPT5H coding upstream 109840 390799 ~ 410148 (-)
CI01000053_00432322_00449797 NA coding upstream 151310 432269 ~ 449797 (-)
CI01000053_00454429_00457235 NA coding upstream 173453 454412 ~ 457235 (-)
G225534 NA non-coding downstream 42488 230259 ~ 230468 (-)
G225466 NA non-coding downstream 89360 160717 ~ 183596 (-)
G225505 NA non-coding downstream 117298 155251 ~ 155658 (-)
G225499 NA non-coding downstream 131736 140674 ~ 141220 (-)
G225604 NA non-coding upstream 209964 490923 ~ 491132 (-)
G225606 NA non-coding upstream 212094 493053 ~ 493289 (-)
G225571 NA non-coding upstream 243535 524494 ~ 525945 (-)
G225570 NA non-coding upstream 245158 526117 ~ 527530 (-)
G225574 NA other upstream 262688 543647 ~ 546868 (-)
G225812 NA other upstream 1178636 1459595 ~ 1466732 (-)
CI01000053_02225226_02226481 YPELD, YPEL2B, YPEL1, YPELC, YPEL2 other upstream 1936489 2225210 ~ 2226481 (-)
G226826 NA other upstream 2284933 2565892 ~ 2567072 (-)
G226963 NA other upstream 2715758 2996717 ~ 2997268 (-)

Expression



Co-expression Network