XLOC_010037 (mlf2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_010037
gene name mlf2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 31827502 ~ 31837482 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00019959
TGTAAATGTTCTGCAGAGCTGCTTTGACATATCAGGGTGCTTTGTCCATTTCGCTCGCTTTATTGATGGTTTTGATTGTGGTTAAGTTATAGGGCGTGCAGGCCGAATTTTGTAATTCTCCAGTTGAGGTTGTTTTGCATTGCTACCAGAGGAGCTGGATGATTGGTTGACCAATTAAGGGCCCCAGAGCTGCTGTTTCACCGGCGTTTGATTGAAGAGACTGaagtttatttacttgtttgacTTGAACCGACCAAGGAAGGAAATCAACAATGTTTCGTTACTTGAATGATGTGGATGACAGCCCGTACATGATGGATCCATTCGCAGCACACAGGCACCAGATGAGGAGTATGTTTGGGTCATTCGGGATGGATCcgtttgctctcactccgcagaTCCAGCATCCACGTACACGCATTCAGCCACAAGCTGGAGCCTTGACCCCCTTTGGCATGATGGGAATGggTGGAGGATTCATGGACATGTTCAGCATGATGAGTGGAATGATGGAGAACATGGAACGAATGTCTGGTTCTCCAAACTGCCAGACCTTTTCCTCCTCGACAGTCATCTCGTACTCCTCTACAGACCCAGGAACACCTAAAGTCTATCAGCAGACCAGTGAATATCGCACTGCTCCCGGGGGTATCAGAGAGACGCGTCAAACGATGCGGGACAGTCAGAGCGGGCTGGAGCGAATGTCTATTGGGCATCACATTGGTGAGAGAGGTCATGTGATGGAGCGTTCCAGGAACCGTCTCACAGGCGATCGTGAAGAGAGGCAGGACTTCTTCAACCTGGAGGAGAGTGAGGCAGCTGCCTTTGATGAAGAGTGGAGGAGAGAGGTGGGTCGGTACCGCCCCCCTACTGCCCGCAGTTTAGATTATGGGCGTGAGCGGGGCGCAGGGGTTGGACAGCAGCTGGCCCTCACAGCACCTCcgacctcctcctcctctccttcACCCCGCCACGAGTCACCACGCCACCATCCTCCTCAATCCCGTCCACGCTACGACTGGTGAACGGTGGAGTTATCTACCTGATGCTGTGAAATGAGAGAAAGGAGGAATAGAGAAGAAAAATTATAACCGATGGGTCAAATGTTTGATAGATCTGAACTGTCTCAATATGTGTAGTCAGCTTCTTACAGGAACATGTGCTGGCATGAGGTATCATAACACGGGCTGAAGAGTTTAGAATGCATCCCCGTTGTGTGTAATTCGGCCTGGTCTGTGTACTTCATACCACGTTACTGCTCCCAAAGCATACACACCAGCATCCATCATATTTCAAACAGCTCTTCAACCTTgtgatatatacatacacaatgaCATCTTTGTATTTAAATGAATTCCCATGCTTCCAATATTTCAATATccaaatatttaattatacactacacatatatgcacacacagacacatacacgcacacatgcacacacacacattcaccgtAAAGTCCGTATATGTTTGTGTTGACACTAGGGTATTTGTGGGTTTAACTGTACAATGCTGACTAATTAAACTTATTAACTAATAAAAAGACCTTGTTACATCA
>TCONS_00019960
GAGCTGGATGATTGGTTGACCAATTAAGGGCCCCAGAGCTGCTGTTTCACCGGCGTTTGATTGAAGAGACTGaagtttatttacttgtttgacTTGAACCGACCAAGGAAGGAAATCAACAATGTTTCGTTACTTGAATGATGTGGATGACAGCCCGTACATGATGGATCCATTCGCAGCACACAGGCACCAGATGAGGAGTATGTTTGGGTCATTCGGGATGGATCcgtttgctctcactccgcagaTCCAGCATCCACGTACACGCATTCAGCCACAAGCTGGAGCCTTGACCCCCTTTGGCATGATGGGAATGggTGGAGGATTCATGGACATGTTCAGCATGATGAGTGGAATGATGGAGAACATGGAACGAATGTCTGGTTCTCCAAACTGCCAGACCTTTTCCTCCTCGACAGTCATCTCGTACTCCTCTACAGACCCAGGAACACCTAAAGTCTATCAGCAGACCAGTGAATATCGCACTGCTCCCGGGGGTATCAGAGAGACGCGTCAAACGATGCGGGACAGTCAGAGCGGGCTGGAGCGAATGTCTATTGGGCATCACATTGGTGAGAGAGGTCATGTGATGGAGCGTTCCAGGAACCGTCTCACAGGCGATCGTGAAGAGAGGCAGGACTTCTTCAACCTGGAGGAGAGTGAGGCAGCTGCCTTTGATGAAGAGTGGAGGAGAGAGGTGGGTCGGTACCGCCCCCCTACTGCCCGCAGTTTAGATTATGGGCGTGAGCGGGGCGCAGGGGTTGGACAGCAGCTGGCCCTCACAGCACCTCcgacctcctcctcctctccttcACCCCGCCACGAGTCACCACGCCACCATCCTCCTCAATCCCGTCCACGCTACGACTGGTGAACGGTATGAGTCTCACACTGCCAGAACTCAACTCATGTGTGGAGTAGAGCTGCATAATTCTCCATAAATTGAGAATTACAGCCAAGTTTTGGTTTAAAATACAATTGATTTTAACATGATTATGAATAGACATCAAAACTTATTTAagattatcaaaataaatatacaatgtgcttttacagacaatttttttacaaaaaatgtgaGCTGTAGAAATTTTAGTTAtactttaaaaataagaaaataagtaaataagccaATAGATAGATGGAGGTAaagaaaacaagaagaaaaagcGAAACATCATACCATCCAATGTACATCTAGTCATACCTTCTCAAAGTACTAATATTGGTGACCCATTAGTCACAAAGTCTCTGAAAAggtgaacaaaacaaaatatgatattttccACATCATGTAgtagaagtttttaaaaaaatctgattgcTGCAGATTCAGTTGTCATATTTAAAAGAATGTCTTGAACAATTAATTTAATGACATACATTTCTTTTTTAGTcaatagctttgtttccatcTAACCTATTTTCTCATATTTTGGAATATTGAATTTGGAAACTTATGCATGCAACTGAGTAGTAGGATACATTTTTTATCCTATTAAAAAGTGCATGAACTAGATGGAATTGTATTTTCTGAATAAATCCTAGCATGCACATCAAAAGTGATGTGTTTTTTGTtataacagatcatgtgatgatgatgaGCACAATGGGTCTGCATTAATGGAAAAAATAGGCGACCGACCACATTgcacaacatctgaaatgttgtttcggTCATGCTAAAATCCCTTAGCCAAAGTTTGTCATTATATTGGTTCCATATTATTACCTctagaactgtcttgagcatctgtggTCACAAAGAGCATTTTCGCACACCCCAAAACCACTGTGCATTCATTGGGTTTCGTTTCTGAGTTATAAGTATATTATTGtattcgaaaaagaaaaaaaaaaaaaaaacacagtggcttctcctatggcaaaatatttttttttcttttagatatATGGCTCCAGTATATCAgcatgattttgttctttttgacttgttggatggaaagggtgctttattcgcaaacattttatgaaaaagTAATTCACCTTTTTGGgtagaaacatagctattgactgTTACACAAGTAGATGGTGACAAATGTAATTGGTACACTCTGCATTTGAAGCAATAAGTACATTGGTCTTTATCCTGAAAAGGACATTTGCTATTTTAATTACTATTTCACTTCTGTGGACTGTAGTGTTTATATCCAAAATACATCTCTCGGGATTTgtattttgcattttgtgtgGTCTGAGCACAGATCTAAATATTCAGTATTGTTAAAGGTTTAATAAAGAAAGGCACATCTCTGTGATTTAGAAAAGGACCCTTTTcaagactgttatgacgtgtTTAACTGTGATCATAAAcctaaatccttgaaagtttttaataatttgatttaaaaaaaaaaaaacatatcaacatttttatgcatttttgtatgtattatatcatcttggcgtcaaattacaaaaaacaccttatgcaaggtgtttctaatgcggcatctatggggctgagagtaaatttgacattattctctcctctgtCTGCCGTCACCAGTCTcgcaccatttatttattttttctgaaagtcttgaaaaCACCATCatagagtttttcttttattatttcagtgaaagggattgtaaaaaaaaatatttgttgtactctctgattcactgcgctctaagggtgttttcacacctgccttatttagttctgTTGAAtgacactagagttcgttttcccttttggaacggttcgtttgtggtgagaatatgatccgaactaaaacagacccatctgcaataaatattgcgcctttttggactaatccagctgctgtaggccgatgcgctgtgcattatggaataTGGAGGAAAAtgttgttgacagcgctttactgACAGTGAGAGAgaaagggaaaaacattacctgttGGATCGTTGGaaatatttccggaagatgactattgtagtttagctaaattaattcatgccTCCTGAAGTGACCTGCAATGTGCCATCGCAGTTTGCAATGCCTTAAAAAAATTGCTCTTCAgccgcagccgcgcttcattctcaaaaAGTATAGTCTgactaaagtgatgtatacaaactgtattgtatactatgagcagggatacaatcagtcagcgcagttgTAGCCCAATGgtcaaaagcgacattttgtgtctgccggtttgtttacttgaggGAATTTCATTGCCATTTTCTTGCACGTGAATTCTAACCGATTGAAAAGCAGttaggaaatacgttcaataacatctgaccaatgagtgatgtggattttgtcagatgactgaattttggttcttttcaactagTTCAGACCAAAGCAATCAATGTGGTGTAAAAACGACactgcagaaaatgcaacaatgtatcatttgttgcccttggtccggaccaaattaACTgtactacagatgtgaaagcaccctaagtttacccttccgctactgagaaacacgcaaatgtgaaaagggtctataatgTATGAATGtcaatgttaaaatgtaaatggcagcttgttttcatgtttttatcaTCAACGTTATGGTGATGAAAGTACAAAATCAACATAtatgtgtttttaaatttttagttGCTTCAGTAGccaagtaataaaaaatacatgaaatactGATTGATTACCATTGTCAGAGAAAATAAAAATCCATAAATTTGCTAATAGTCTCTGTATAACGTTtgctccagttttttttttttaggtatagTGATCATAAATGCATAAAGTcactgtaatatatttttttaatgtaatatagcgatatttatttttaacaattgatCTGTGATACCTGATGTGATTTCTGCGGAAATAAATTGCATAGCGATATTACAAACGTGCTCTCTTTTGAAGATGTTTTAAACttagcagctgatcacagagagttggaacagatcttttaatcccagtttctttgcgaATTCTATTTCTGGGACTTTTATATGCATTACTACGAAGACATGCTAACATGCTCCTGTCATTTAATGGGCAGAGAAAACTGCACTTCTATGTCATGTTGCGGCCTCAAAAACGCTAggatttgaataatattttaacatcaggaaattaaaatcttgttgtgtttatatgacagctcctacacacagttcagtccaaacagcttccaaacgTTGGGTTTTGCATCATAGGTTtttgtataactttttttttgtaatattatttttagttCAGTGAATATAAATGCATAAGAAAATCACTGTAAAATacctttttaatgtaataaaacaatatttatttttttaacaattgatCTGTGCATATGCTTGAACTCATACAATGTtgtaattaatacaaaaaaaaactttacctctCTTTGCAATGGCATCCTGATTATGCTTTTACTCAGCCTTCCTGTTTTGTTGTTGTGCATTTGTTTGTAGGTGGAGTTATCTACCTGATGCTGTGAAATGAGAGAAAGGAGGAATAGAGAAGAAAAATTATAACCGATGGGTCAAATGTTTGATAGATCTGAACTGTCTCAATATGTGTAGTCAGCTTCTTACAGGAACATGTGCTGGCATGAGGTATCATAACACGGGCTGAAGAGTTTAGAATGCATCCCCGTTGTGTGTAATTCGGCCTGGTCTGTGTACTTCATACCACGTTACTGCTCCCAAAGCATACACACCAGCATCCATCATATTTCAAACAGCTCTTCAACCTTgtgatatatacatacacaatgaCATCTTTGTATTTAAATGAATTCCCATGCTTCCAATATTTCAATATccaaatatttaattatacactacacatatatgcacacacagacacatacacgcacacatgcacacacacacattcaccgtAAAGTCCGTATATGTTTGTGTTGACACTAGGGTATTTGTGGGTTTAACTGTACAATGCTGACTAATTAAACTTATTAACTAATAAAAAGACCTTGTTACATCATTGGCTTTGCTGTAGCGTGTGATTTGTGATAGAAATAT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>TCONS_00019961
GGACATGTTCAGCATGATGAGTGGAATGATGGAGAACATGGAACGAATGTCTGGTTCTCCAAACTGCCAGACCTTTTCCTCCTCGACAGTCATCTCGTACTCCTCTACAGACCCAGGAACACCTAAAGTCTATCAGCAGACCAGTGAATATCGCACTGCTCCCGGGGGTATCAGAGAGACGCGTCAAACGATGCGGGACAGTCAGAGCGGGCTGGAGCGAATGTCTATTGGGCATCACATTGGTGAGAGAGGTCATGTGATGGAGCGTTCCAGGAACCGTCTCACAGGCGATCAGAAGAAAAATTATAACCGATGGGTCAAATGTTTGATAGATCTGAACTGTCTCAATATGTGTAGTCAGCTTCTTACAGGAACATGTGCTGGCATGAGGTATCATAACACGGGCTGAAGAGTTTAGAATGCATCCCCGTTGTGTGTAATTCGGCCTGGTCTGTGTACTTCATACCACGTTACTGCTCCCAAAGCATACACACCAGCATCCATCATATTTCAAACAGCTCTTCAACCT

Function

symbol description
mlf2 Predicted to be involved in regulation of transcription, DNA-templated. Predicted to be active in cytoplasm and nucleus. Orthologous to human MLF2 (myeloid leukemia factor 2).

GO:

id name namespace
GO:0006355 regulation of transcription, DNA-templated biological_process
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0005737 cytoplasm cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-050913-67 Predicted to be involved in regulation of transcription, DNA-templated. Predicted to be active in cytoplasm and nucleus. Orthologous to human MLF2 (myeloid leukemia factor 2).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000034616

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00019959 False 1563 mRNA 0.47 8 31827502 31836739
TCONS_00019960 False 5705 mRNA 0.37 7 31827653 31837482
TCONS_00019961 True 529 processed_transcript 0.48 4 31829038 31836487

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010036 wnt4b coding upstream 14484 31802203 ~ 31813018 (+)
XLOC_010035 CR855311.5 coding upstream 192907 31634470 ~ 31634595 (+)
XLOC_010034 SLA coding upstream 279702 31542645 ~ 31547800 (+)
XLOC_010033 ndrg1b coding upstream 310275 31511739 ~ 31517227 (+)
XLOC_010032 scxb coding upstream 425348 31396647 ~ 31402154 (+)
XLOC_010038 atn1 coding downstream 16437 31853919 ~ 31868985 (+)
XLOC_010039 rps9 coding downstream 84330 31921812 ~ 31927522 (+)
XLOC_010040 phc1 coding downstream 105045 31942527 ~ 31960652 (+)
XLOC_010041 NA coding downstream 123426 31960908 ~ 31985059 (+)
XLOC_010042 mboat7 coding downstream 177070 32014552 ~ 32026333 (+)
XLOC_010031 NA non-coding upstream 692071 31121756 ~ 31135431 (+)
XLOC_010030 NA non-coding upstream 732922 31090998 ~ 31094580 (+)
XLOC_010029 BX510336.1 non-coding upstream 856345 30970501 ~ 30971157 (+)
XLOC_010024 NA non-coding upstream 1496621 30329863 ~ 30330881 (+)
XLOC_010047 NA non-coding downstream 255230 32092712 ~ 32095684 (+)
XLOC_010052 NA non-coding downstream 441517 32278999 ~ 32365571 (+)
XLOC_010053 CR533571.1 non-coding downstream 560025 32397507 ~ 32509458 (+)
XLOC_010055 CR848729.4 non-coding downstream 835338 32672820 ~ 32672936 (+)

Expression


Co-expression Network