XLOC_010114


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_010114
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 36955088 ~ 36958828 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00021995
GTAATCTACTGCATTACACACATCTCAAAAATCCCTGAGGACAAAGCAAAATCACAGAACAATTATTCTACCTCAATAGAATTGTTGTCATGACTCAAGAAATTAGAAACTGTTCTTGGCTTAAAAATTATGGCAGTGTTTTATTAGTTGTCATAATTAAGATTAAAGAACTATTTTTAAAGAATGGTTAATATTGTAAAGGAAGTatagtacatactgtatattatcAGTGGTTAAAATCTtgcaatacaaatatttattgcCTTATGATGTCATTAATAGAAGATTGCTGACAGTGGAAGCAATGTGCTAAATGCACCAGACATTATGTGAAACAATTTTGGATTTCAATTTTACCACCACATGACAGTACTAAACATCTGTTTTAAATCTAGGTTTCCATAGTTTCCAAGTTTTCGATAGTTCATGCATGAAAGAACATCAGAAAGTAATTCATAAATGTGTGATTCTTGCGACTGCAATTGCTCTATGGCAGCTACACCTCTGGGCTCAGTGGGTCTCCTTGTGCGGCTCCACCTCTGGGCCCAGTAGGTCTCCTGGTGTAGCTCCACCAGTGAGTCCAAGCCAAGAActgaaacatattttttaaatctgaCAATAAATGTGCCACAGCCAGATCTTTTGAGGCACAACTAGACTTTCTTTTCTGGCTACATGTGTGGTTTTTTGCAGTCATGGCTTTCTCTTTTAATCAGGGAAGGAAAAAGAAAAGTGTTTTCACCGTGATCTTTATTGAATGTTTTTAACTCTTTGAAAAATTGTGCCGTTGgcataaaatatttctaaaaatccATATTGGTGGTGAGTTTCCCTTTCAGAAACAGTAAGAGCTGGCCATATCTAGAACCACTGAAGtttgaataaaactttttttttttagcctagAATGAAAAAATGTTAAGCCaagaattaaaaatgttttctatCTCAGAATAAATCTGACcagtttttttcagtagtcttaagttatgattaaattagagttaaaaaacttttttttaaattatttattttgtgatgttACTATTGTAAGTACATACAGAAGCTGTGATCTTACAATCTTCTATTCCTTAAAGCAGTTCCACAATGACATCATTCATTgcctgacagtgtgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtatgcgcatgtgtgcgcgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtatgcgcatgtctgcgcgtgtgtgtgtaggtgtgtatgtgtgtaaatgtgtgtacgtgtgcgtgcatgcgtgctaGTTAGGAATGGACAGAGACTTTTTGTTGCTACTTGCAATTTGTGTTTCTCTGAATGTACTGGATTTACTGAATACagttagaaaaataataatattcacacGTACTGATCACTAAATTTGTCCATTATGGATAAACAGTTTGAAAATTACTGAACACTTTTGTCTGAAAGTTATATTTGTACCTGTATAATATTAAattcctgaaataaaataagGATGATGATTGTTGTTtatgatatatattatattttaacatatatatttttaactgagTTCATATAATTAGAAAAACATTTCATTACAAAACCCCATAAAATTCCATATTATCAGCTgagactcactcactcactatcctttggcttagtctttgatttatcaggtgttgccactgcagaatgaactgccCATTACTCAGCTGTAACTTAAGTCTTCTATAATTCATGCATGAAAGTTAAAGAATACCAGATAGTAATTcagaaaaatgtgtttaatgacCTTGACTCTTGCGCCTTTTTTTCTTCCTGTACTGTGTGTGCAACTACAATAGCTCTACATGCAGCTACACTACTAGCTACACTAGTGGGTCTCTCggtgcagctccacctctgggCTCAGTGAGTCTTGGGGTGCAGCTCCACTTCTGGGCTCAGTGCGTCTCCTGATGCAGCTCCACCAGTAAACCCGacaagattttaaaatataaatctgaaaataaaaaaagaacgcTTCGTTTTTTTGAGGCACACTTAGACTCTTTTTTTCTGGCTATACTAGTCATTTTTACAATTATAATAGAAACTATTTTTTTAGTGTATTATATGTGGTTCACTATTATAATGAGTGGAGGAAAAAGAAAACCTTGAATTGAAATCAATTACTGTGATCTTCAGTGACTTTTTGAAATCCTTTAAGATGTGGCACTGACAAATAAGATTTCTAAAAATCCATATTTTTGAAACTGAAAAGGCTGGACATATCTAGAACAACTAAAGTTTGAATAAAAGACAGACAGAATTCCAAACCAAGTATTGAAAATATTTCCTTATCcaaatattaattttagtttattttttattttttgatagtgTTGAGTTGGGGGTTAAAATGATTTGAAGAGAATGGTTTCTTTTGTGATGttaatatagtgtgtgtgtatattagctGTGATTACAATCTCGCATTTCAAAAATGTGTTCCATGATGACATCATTAATAGAAGATGGCAGACAATGACAGCCATGCTAAATGTCCAGCTCTGGGCTCAGTGAGTCTCCTAGTGCAGCTCCAGCTCTGGGCTCAGTAAGCCTCCTAGTGCAGCTCCACCTCTGTGTTCAGaggtctcctggtgcagctccacctctgggCTTAGTAGgcctcctggtgcagctccacctctgTGCTCAGTGGGTCTCCTGGTGCAACTCCACCTCTGGGCTCAGTGGGTCTTCTGGTGTAGCTCCATCAGTGAGCCCAAGTCaagaatttaaaacatttgtaaattatTTGCAATAAATGTTGCACAGACAGTTTTCTGAAGCACCATTAGACAtcattttcttgttttgctaGTGATTTTTGCTACTATAATGTATAAAATGTCTGGGGTAGTATGAGTAATTCACTATTATAATCAATTGAGTAAAAAGAAAACCTGATATTAAAAGAGGTCAC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00021995 True 2947 lncRNA 0.36 2 36955088 36958828

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010113 si:ch73-215d9.1 coding upstream 23260 36768674 ~ 36931828 (+)
XLOC_010112 decr1 coding upstream 194932 36748538 ~ 36760156 (+)
XLOC_010111 col6a4a coding upstream 235383 36650984 ~ 36719705 (+)
XLOC_010109 NA coding upstream 341237 36579000 ~ 36613851 (+)
XLOC_010110 NA coding upstream 346114 36606042 ~ 36608974 (+)
XLOC_010115 adgrb1a coding downstream 511889 37470717 ~ 37630250 (+)
XLOC_010116 NA coding downstream 674619 37633447 ~ 37641863 (+)
XLOC_010117 NA coding downstream 700692 37659520 ~ 37660611 (+)
XLOC_010118 NA coding downstream 754436 37713264 ~ 37713637 (+)
XLOC_010119 BX294107.1 coding downstream 812655 37771483 ~ 37771600 (+)
XLOC_010108 NA non-coding upstream 363747 36560692 ~ 36591341 (+)
XLOC_010107 NA non-coding upstream 397208 36548027 ~ 36557880 (+)
XLOC_010105 NA non-coding upstream 597986 36282260 ~ 36357102 (+)
XLOC_010122 CT025591.1 non-coding downstream 1062191 38021019 ~ 38021134 (+)

Expression


Co-expression Network