G247950


Basic Information

Item Value
gene id G247950
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000058
NCBI id null
chromosome length 5213219
location 1927222 ~ 1941268 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU281433
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU281433 True 13946 lncRNA 0.40 3 1927222 1941268

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000058_01838039_01842964 NA coding upstream 83992 1838039 ~ 1843230 (+)
CI01000058_01794468_01800421 KISS1 coding upstream 126801 1794468 ~ 1800421 (+)
CI01000058_01740599_01784355 PLEKHA6 coding upstream 142546 1740599 ~ 1784676 (+)
CI01000058_01625351_01664692 PIK3C2B coding upstream 261428 1625351 ~ 1665794 (+)
CI01000058_01580247_01591754 NA coding upstream 334969 1579663 ~ 1592253 (+)
CI01000058_01957358_02009847 ATP2B4 coding downstream 16090 1957358 ~ 2009847 (+)
CI01000058_02028188_02037502 MDM4 coding downstream 86881 2028149 ~ 2037628 (+)
CI01000058_02052152_02085378 NA coding downstream 110695 2051963 ~ 2085455 (+)
CI01000058_02227590_02229507 MYOG coding downstream 286150 2227418 ~ 2230021 (+)
CI01000058_02348646_02354404 TMEM183A coding downstream 407347 2348615 ~ 2355085 (+)
G247977 NA non-coding upstream 190 1881180 ~ 1927032 (+)
G248152 NA non-coding upstream 50040 1876979 ~ 1877182 (+)
G248140 NA non-coding upstream 67242 1859734 ~ 1859980 (+)
G248139 NA non-coding upstream 69156 1857684 ~ 1858066 (+)
G248138 NA non-coding upstream 70694 1856310 ~ 1856528 (+)
G247991 NA non-coding downstream 57602 1998870 ~ 2003167 (+)
G247969 NA non-coding downstream 62029 2003297 ~ 2056291 (+)
G248173 NA non-coding downstream 100903 2042171 ~ 2280818 (+)
G248208 NA non-coding downstream 148989 2090257 ~ 2092730 (+)
G247940 NA other upstream 470775 1452997 ~ 1456447 (+)
CI01000058_01280337_01289153 DNASE2B other upstream 638952 1278592 ~ 1289874 (+)
CI01000058_00592498_00596709 NA other upstream 1330051 592331 ~ 597171 (+)
CI01000058_00435196_00437830 AGTRAP other upstream 1471478 434913 ~ 455744 (+)
G250039 NA other downstream 2753140 4694408 ~ 4697161 (+)
CI01000058_04864571_04888198 NA other downstream 2885108 4864571 ~ 4888216 (+)

Expression


Co-expression Network