XLOC_010155 (BX470182.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_010155
gene name BX470182.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 40217043 ~ 40220920 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00020137
TGATGAACAGCTTTTTTCAGAGTTTTCTTGAGTTCAGAGGGTTCCGCGTCAAACATAGACTACAACTGCAGCCACACACATTATGGTTTGTATCTATGCAATGGAATAGCACTTAAGATATGCTGAAAGTCATAATCGTCGTAAACACAATGGAGTTAAGACATATGGAGTATTTCAACGCAGTCCCTATTACATTGGTTAATTTGTATGGTCCAAATTACGACGACCCTTCTTTCTTCAATAAACTCTTAGTTAAAATACCTGATGCGGctttacaaaatgtaattatTGGGGGAGATTTTAATTGTGTCATTGACCCGATAAAAGATACACGGCCTAGTCGTACCTTTAAAAGCAAGTCTGCAGCTacgttaaataattattttaggaATATTAATATGGTTGATATCTGGAGGCATTTAAATCCATATTCTCGAGAATATTCATTTTATTCTTCAGTGCATAAATCCTACTCTAGAATAGATCTTTTTGTTGTAGATTCCAACTTAATAAAAATGGCTTCATCCTCCCAATATCACAATAGATTAATTTCAGATCATGCCCCATTGTCACTAGATTTAAAACTAAAGTTGGAAAAAGGAACGTACTGTTGGAAATTCGATAACTCgcttttaaatgataattttttttgtaattatataaCTGAAAAAATTGGGTATTTTTTATCTGAAAATGACAATGGCAGCGTTAATGAATCTGTATTATGGGATTCAATGAAAGCTGTAATTAGAGGTGAGATAATCTCCTTTCAAAGTAGAAAGAACAAAGAAGATAAAAAGAGATTAAATGAAATAGATGATCAGATCACTAAATTAGAAGAAAACTATAAAACTAACTTATGTTCAAAGACATTGAAGAAAATAGTAGCATTGAGAAGTGAATATAATTCTATTCTTTCCAAAACAATTgttaaacaaattaatcaaattaaacaacGTCAATTTGAACTTGGTGAGAAGCCTCAAAAACTTTTAGCTCGTCAACTAAAGCAAGCTCAAACAAAAAAAGCCATTTATAAAATTCAAACTGAAAACGGGGAAACGATAACCGaccctaaaaaaataaatgaaagcttTGCAGAATTTTACAAAGAGGTCTATACATCTAATGGAAACACGGACAGAAGTGAAATAAACAAGTTTTTAAGTAATATTAATCTTCCTCAAATAAGTAAAGAAGCTGCTGAAACGTTAGAGAAGGATATCACCCTTAATGAGTTAAATGAAGTAGTGAAAAATCTCCCGGTTAATAAGTGCTCAGGCCCCGACGGATTTAGTGcagaatattataaaaaattttgGGGGATTTTAGGTCCAATCTTTCTCCGCGTGATTAATTACTCATTTTCTCAATCGATACTCCCCTCAACGCTTTACAACGCTACTATATCACTAATACAAAAACCCGGACGAGACAAAATGAAAGTGACATCATATCGCCCAATCTCAATTATCCCAATCGAGACAAAAATCCTTAGTAAAGTCTTAGCCAATAGATTACAACAATATATATGTTCGGTCATAAACCACGACCAAACTGGATTTATGCCAAATAGGCACATACATTCAAATTTAAGACgtctttttaatataatttatacgAAACATACAACTAAAGCATGTGTAATTTCATTAGATGCTCAACGTGCATTTGATCAAATTGAATGGTCTTATATGTTTGCAACTTTATCTAGATTTGGATTCGGAGACAAATTTGTTCAGTGGGTTAAAATGTTATATGCTAATCCAAAAGCTTCAATCCTCACAAACTCTACACTATCACCTTCATTTCCATTGTATAGAGGAACACGCCAAGGCTGTCCCCTATCCCCTTATCTTTTTGCCTTAGCTATAGAACCATTGGCTGCAAGTATTAGACAGAATAGTCAAATCTCtcctattttaattaataatagaccccaatatatatcattatatgcAGACGACGTGCTTATATATATGACAAAACCGGAATTGTCCATTCCAACCCTTCTAAATGTATTAGAATCATTCAAAAAATTGTCAGGTTTTACAATAAATTGGGACAAAAGTGAGTTAATGCCCCTTACGGAGGATaatgatatacattttttacaatcgACTCCATTTAAAATAACTCAtaattcatttaaacatttaggaattaatattacaaaaaagGCAGAGGCTTTATTAAAATCCAATTGGCAcgttaaattaaatcagttaaaagACAATATAAAATTTTGGATGACTTTACCAATTTCTATGGTAggaaaaattaacgcaattaagaTGGTAACACTTCCCAgattcttatatttatttttgtccatTCCAGTTTTTATTCCAGTTAAACTATTCACAAAATTAGATTCCATAATAACTTCATTTATATGGAATTATAAAACTGTTAGGATATCTAAAAAACACTTATGTAAATCTAAAGTAAAAGGAGGATTCAACCTTCCTTCGTTCAAACATTATTATTGGGCTGCAAATTTACAGTCCCTTGCTTGGTGGAGACATACTCCAGAAGACATTAAAGAAACACCAGAATGGGTTTTACTAGAAAGAACCTCCTGTAAGACAACATCATTGAGAGCTTTACTGAATAGTCCATTAAAAGTTGAATCAAAAATCTACACAGATAATTTTGTGATTAATAACTCTCTCAAGATATGGAAACAGATTAAACTGTCCCTCAGTCTCCCAAATACTTATTTGGATTGCCCAATAAATTCAAACCATGCCTTTATTCCTGGAACTCTAGACAAAACATTTACACGTTGGAAAGAAAAAGGATTAGTATATATAAGAGATTTATATGTTGATAATAAATTTGGCTCATTTAGTCagttaaaatcaaaatataatcTTCAATCCTCTGAGTTTTtcagatatttacaaataagGGATTTTACTAGGAAAAATTTTCATGGTTTTGAAAATATACCCATACACCAGACACTTGAGAATTTAACAAAACACAGCCCAATAGAAAAAGGTACTGTCTCTTTTTTCTATAACTTATTATTGGATGAGGTTAATTCAAACACTGACAAAATTAGGAAAGAGTGGGAAAAAGAGCTAAATACAGTAATATCAGATGAGTCATGGGAAGATTATCTTTCCAAAATTCATGATTGCTCTATCAACACGAGACACAGACTGATTCAATTTAAAGTTGTTCACAGACTGCATTATTCTAAAgtgaaattaaataagatttttccaAATTCTTCCTCATTGTGCAACAAATGTAATAACTCTGAAGGTACACTGGCTCACTCATTCTGGTCATGCCATAAACTTAGCTCATTTTGGCagagcatttttaattttatatctgAAGTATACGGGATAAGTCTGTCACCAGATCCAAAATTGGGCATTTTCGGAGACACCTCAGAAATAGGAGATAAATATATATCACAGGCAGTATCTTTGTGTATGATATtagcaaagaaaataattttacaaaattggAAGTCAGATTATGTGCCTGTTTTTGAAATATGGGTTAGAAGCTTAAGTTTCGTGTTGCCCATGGAGGAAATGCGATATGGGATGATAAACaaactaaacacatttttaaaaatctggagcCCTATTATGTTCTATATCAGTAATGCTAACTTGTAACTTTTTATAAGTGAGATTGGTCTGGAGTAAATCGAATTGTGGAGCCtatgcatttctctgtaaattatttttgtttcatatttaattctatttatttccttATGCTTTCTGGATGATGTTGTATTATGTTGTATCTGACTATTTGTATATTTTGAAATGGCCTTTGTAACcccccttatttttatttatttatgtagttttttttttttctgtttatgttgTTGATTAtttctt

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000112132

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00020137 True 3878 mRNA 0.32 1 40217043 40220920

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010154 BX470182.2 coding upstream 33184 40183743 ~ 40183859 (+)
XLOC_010152 NA coding upstream 102236 40082902 ~ 40114807 (+)
XLOC_010151 CT025588.3 coding upstream 134987 40075545 ~ 40082056 (+)
XLOC_010150 trmt11 coding upstream 142898 40043673 ~ 40074145 (+)
XLOC_010149 hint3 coding upstream 185264 40024883 ~ 40031779 (+)
XLOC_010156 mettl6 coding downstream 119302 40340222 ~ 40345372 (+)
XLOC_010157 BX072576.2 coding downstream 125527 40346447 ~ 40354078 (+)
XLOC_010158 BX072576.1 coding downstream 242445 40463365 ~ 40464426 (+)
XLOC_010159 nagpa coding downstream 287962 40508882 ~ 40541981 (+)
XLOC_010160 tp53inp1 coding downstream 339702 40560622 ~ 40569769 (+)
XLOC_010148 CT025588.2 non-coding upstream 205052 40011869 ~ 40011991 (+)
XLOC_010147 NA non-coding upstream 239655 39972169 ~ 39977388 (+)
XLOC_010162 NA non-coding downstream 652321 40873241 ~ 40893518 (+)
XLOC_010163 NA non-coding downstream 720817 40941737 ~ 40945757 (+)
XLOC_010166 NA non-coding downstream 815727 41036647 ~ 41054652 (+)
XLOC_010168 NA non-coding downstream 908144 41129064 ~ 41129320 (+)

Expression


Co-expression Network