G286867


Basic Information

Item Value
gene id G286867
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000072
NCBI id null
chromosome length 5473029
location 4053051 ~ 4065995 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU325197
GGGAAAGGCTAACATGGGCATTCTGACGATAATGATTGCCATTTGGTTAAGAAAAGTGCGTGTATAGGCAGTATGATAGCTCTTCAGCTCTGGGCTGCTGTATTTGTGTCTCTACTAAGGCAAAAGTTGAGGACAGACACAGACACATACAGAACCTCAACAGTCTGAGATAAGATGTGTGTTAGTGCGGACTTCCACTGAGTCAGTGGGAGATAATGGACCAGTCGAGAGTTTGTTCCACACATAACATTATCAAGACGAGAGGGATTTGATTTGGCAGGTCTCCTGGTTTCTCAGAGCAGCTTTCAGAGCTTTCAGTGCCTGTTCTCCATTTTAAATCGGTTCCTATTAAGACTCGTCAGTACCGTAATGGTGTGAGACTTTTATTCCGTTACAGCAGGGCCCGGGTTTTCTTTATTTTCAGAGGGAATGGCTAAGTAGTCTGTCCTTGTCCTGCGCCTGTTCATCAGATTTGGAGATCTTCCTGTAGCAGTAGACCATCTCCACCAGCAACCAGAATGTGAGGAACACCAGGAGCACATACATCATGATCTCAGAGTACATCGCCGCGGTGTCTTCACTCGCTGAGAAAATGAAAATATGCAATCAGACAGAATTTTGTACAATTAATTGAGCAATCAGAGGAGGCCTGCCAGACCGATACTGTGCTACTAAGGATGTTTGTGATGAATTCAGTCTTACACTCAAGTGTACTGAGAATGAGGACAGAAGTGCAGAATGCATAAGTGGGCAAGTCAAAATATAGCTGCACTCAAAGCTATTTTAGGTCATCAGGAACTATAGCAGTTAGCAAAAACAAAGTGCTACGTCACCTCAGAGATGAGCAGTCATGCTTTGCATCCAGGTGGTACATTTGTGAGCAACTGGTTTCATATAACAATTTTTTAAAAAAAAATGTTTTAATCCGTTTTATTTTTATTGTTATATGAACAAAAGCACAAGACTACAACAGCATGCATATCAGATCTATAATCAGAATGAATTCACTGCTGAATTTATTTAAATTATCTATGAATTTGCAATTGATGTTTTTTAAATTTAAGTCAGTAAAATCAGTTAGGTGTTAGAAATAGATAAATCTATATTTCTGCATGTCCTTTAGAAGACCCATTACAGTAATTATTTGCATGCAAACACAAAACCACGCAATAATACAAACATGCTCAGATACTTCATGTCAACTTTCACTTGGAGGACAGTGAGACTCAAAAGTTATATTACATACTGTAAGGCATGTAACTGGTCTTTAAAAAGATCGACACAGAGTGACTGTGTGATCAGAGGTTCTCAGCTTCACCCTTCTGAGCAGAAGCCCACCCACATTGATCTGATTATATTCATAATGTATCCACCACAAACAGTTTTGGATTTGAAAATGGGATTTAAAAGGTGAGAACCACTGTGTATACATAGACGGTAGTGCAGCGCATGTGACATTTTAGAGAAAAAATAATAATTGTGTACGATTGTCAAAAAAGATTCTAAAAAGTTTTTTATTATGTATGTCTCATGCACTGCAGTGAATAGATCTAAAATGGCATGAAATGTAAAAGCAGAGTTGTACTGTAAGTTTGTGGTTCTGGAAAGCTGGTTGCAATTCAAAATATCCTCTAAACCCATCACTTAAATACAACGTTGTATATTTCTATCTGCGAATCGAGACACTCACAGATAGAGATGATGCATTGCGGTTGCATGATTAAATATAGACAAATATACATTAGGTAAAGTATATTCGATTGAAGTGAGAGGAAGTACTCTGCATTCAGCAATCTCAGGCATCCAGAGAATAGCATACAAACCAGAATCTTTACATTACCCCTTACAACAGATAGAGAGGTAAGTAGTTGCTTAGATAAAGCCCTGAAAACAACTTCCTGCCTTCCAATAAGTAAGCTTAAATAACAATAAAAACAGAACAGAGCACACCATTACTAGAACAACACAAACAACATGTCAGGACATCGCATTGAAGGAACGACACTGTACTGAGGTCAGCAGTATCTGATTTTCGAGTTACAGCATGTTTGAAAATGGCCTATAGCGCGACCATCCAAAACACTGCAGAGATGAGGTAATCAGATTGAATATGGCTAGACAAGGTACTGTAATTCCAGCGTGACAAATGTCTAGTGTTGTGTATGCTCACTTACCTTTCTTTTTCACCTCCAGTTCGATTTCGATTATCTTGATGGCGGAATGCTCGAATGCATCGAACTTAAAGAAGCGGGACACCTTACATTCGTATTTGCCAGTGTCGTTTAAAGTGACGTTTTGGATACTAATGGAGAGGTCCTGCAGGTCCTTGCTGCCGTTCCACATCAGACGGCCCTTCCACTGCAGTTCTACATCCTCTGGCTCTTGTGGCTTATTGTCATACAGATAGATCTGCACTGTTTTATTATCCGGACCGGTGTAGGACCACACCACTTTGGTCTCGGCGGAGATCTCCTCTCGTTTCATGCAGTAGATGCAGGTTAACTTCATGACATGACCTACAATGGCCTCTCTGTCTGAATCCACATCCACACACACCAGCCTGACCTCCTGCACTGAGGAAAGCACAGAGTGTTACTACATACACACATGCAAACTCTGTAAATCAATCAATCCATCAATCAATCAATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATTAGTCCAATTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATCTATCTATCCATTAGTCCAATTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTTTGTCTGTCTATTAGTCCAATTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCCATTAGTCCAATTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCCATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTGTCTGTCCATTAGTCCAACTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTTTGTCTATCTATCCATTAGTCCAATTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATCCATTAGTCCAATTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATCTATCCGTTAGTTTTGCTATTAGTCCTGCACCTTTGAACCACATGTAAGGCATACAATCATGCCTTGCTTGGCCTTTCCAAAAACGTAGCTTTAATCTGCATATACTTTATGGAGGTCAATTAAATCTGAGGCAGAGTTTTCTCAAGGGAGCACCAGAGAATGAGAAAGAGAGAGATCATTATCCATTACAAGCTCCAATTCCAGAAAGAGCTCACAGCACACCCTACTCCCGGTCAGACAAAAACATACTTTAAAGTGCACCGATTACTGCAGACACATGCTCAGTATTGACGGCAGAGAACACCTCATTGAGCAGGGGCCGGGACGAGGCCTCAACGATGTGAAGATTGTTCTGGAGTGTTCACTCGACTGTGAACATAACCTCTATGCCATTGTTGAAATGGAGGCCATCTTACATAACTCACAGCCCTAAGCACAAGCTGTCAACACTGATCGCGCCTTTTCTGTTTGAAGAGTCATATGGACCAATGGAAACACCAAATGTAGTTGTCCAGCCCACAACCATACTGTAGATGATGCATAATATTGATTAGTTGCGACATATTTCGACACTAGTCAAAGAAATGTGAACTTAGTGGTAGATGAAATACAATTCTAAATCTATTTCAAAACTTAATATTCTGATGACATCAGACTGCCAAAATCTGTGAAAAGAGGCTGTGTGAGTCATTGACACTTATGTTACTGTTTACAGCTGAGTCAATGCCATCTCTGTATGTAGGGATTGTATTTTTTGCGGATATGTAAATTTGTGTCTCATAATGTTCAAGAAGTAACGCTAACGTTCTGATGTATAATTAATTGGGTTAAATGGTTTCTGTATTCTAGGAGATACAGACATTTAAGAGGCTGGGGGAGTGAGTTAGTGAGAATAATTTCTGATTAAAAAAATATTGGGGGTCCCTGCAAATACTCAAGTGTATTGATATAAAAACATCTTTATCTAAAAGCAATATAACAGCATGCTGTAAATAATACCACACATTTATGTCTTTTGCATTTACATGGGAGATACAAACTGTAAAATCAAAAACAAATGCAATAAAAAAAAATCTGATAAGTTTAACACATTCGGTTCCTATAAATATATAAAACTGTAATAAAAAATTAATTAAAAATAAAATTATCTTTCTTTCTTTTAATTTTTTAAATGACAAAAAGGTGTCTGTTATAAAAATACTCATTATATATCATTCGAATTAGACATTTAAAATATAAAAACACTTACCAGCAAATAGAAACAGCAATAGCAAATGCAACACAAGTCTCATTTGAGTTGCCATGCTGGGAGTTCTAATAACAGGGCGGCGTCTCAGATTGAGTCTTCCTGTTAGTACAGAGAGAAAAGAAAATCCGACACTGAAACTTCATTTTGAAGAGGTTAAAACCTTGTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATAGACAGATAGATAGATCTATATGATTGATGGAATAGGGGTTTCAGCACCACTGACAGCGCCCAATCGAACGCGATTGTCAATTACTTACTATTTACAGCAGATGTTTACATCACTGACACAGAGAGGTCTGTAAAGATGACACACCATGACTTTA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>TU325196
TCGAATCAGTGGTTCGGAGCGTGTATCAAACTGCCAAAGTCACACCCCCCAGTGGTGAACCATTGACATTTTGAAATGCTTATGACATAACGAAGCCACATTTGCTGAAATCACGTGACTTTGGCAGTTTGATACACACTATGAACCACTGATTCGAAACAAAAGAGTCGCAAAGCTTCAAAGCTTCATGAAGCAGTGTTTTGAAATTGCCCATCACTAGATATTGTTGAATGAAGTCTTTTTTTTTGGCGCACAAAAAGTATTCTTTGAGGGTGAGTAATTAATGACAGAATTTTCATTTTTTGCTGAACTAACCCTTTAAGGTATTGTTCCCTGTTAGCTGGGAACTTTTCTGATATCCCAAAAAAGGCAGTGTTATCTATTTTTTAAGAATAGTTGGCTTTTTTGGGATATCAAAAAAGTTAACATCATTATGGAACAGCATTTTCATATTAATCAAATCGTGTTTCTAGAACATTCCATACTATCTTCCATCAGAAGAGGATGTTACATAACCCCATTGACAACAAAAAGTCGTCCTCAAATTACAAATCACTCCAGTTCTAGTAAAACATATCAGATGACACTGCAGGAAGCTGCCTAGAATTTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAACATGGCAAATTAAAATAAATGGATCCATGTCATTTCACAACTATCTATGCATTCTCATATTTCAAAACACTTTAAACAATGTAAAATCATCGATCGAGGAGTTTACACAGAGAATAAACCCTGACCTCAGCATTATCGCTGCTGTACTTTACCTCTATTGAGTTATGTTGTGAGATCAGCTGAGATTAGTAATTGCTGGACAGATATGGCAATGAACAGAGGAGTGGCATGTGCTTGAGTGGATGAGAATAGAGATCCGGTGATGTTAAGAGAGGATGTGGAAAAGGAAAGAGAGAAACAGACCGTGATGGTGGAGGGGCTCTAGTCAGCTACTCGGGATGAGTGGGGAATTATTGATGATGTTTCTAATTGAGAGGTAAATTAAAAAATACCGTAATGGTGTGAGACTTTTATTCCGTTACAGCAGGGCCCGGGTTTTCTTTATTTTCAGAGGGAATGGCTAAGTAGTCTGTCCTGTAGACACATGGGTACAAAAGAAAAAGGCAAAAACTAAGAGTTGAGGGTGCACTTCTGCACCACCTTAGGTCCCTTCAGCAAAGCAGCAGTCAATTACCATCACCAAATTAAAGGGATAGTTCAACCAAAAATAAAAATAACTCATAATCATGCTTCAAACCTGTATGGTGTTCCCCACCAGAACACAAAACTGAACATTTTTAAAGAATCATTATTCAGCTCTTGCACAGTAAAAACATGTTAACATGTAATTGTTAGGAGCAACCTGATCTAACCCCTAATTTGTTAGGGAAACCTAGTATATTTAGGTTGATTCATTGATGTTAAATAATAAAAAATTATATTATATTATATTACAGTCTTAAAGGAACACTCCACTTTTTTTGCAAATAGGCTCATTTTCCAACTCCCCTAGAGTTAAACAGTTGAGTTTTACCGTTTTCGAATCCATTCAGCCGATCTCCGGGTCTGGCGGTACCACTTTTAGCATAGCTTAGCATAGTTCATTGAATCTGATTAGTAATATCATTGCGCCTGCTGCACCCATGGTACGGCAGCAAATTTCCTTGATTATTACACCAGAATGAGAGTTTAGTTCCTAGCCATATCGGCCTAGAAAATTGCAACTTTTCATTTTCCGTCGGTCTTAGTGCACGATGTAACTATAGAAGAGTCAAGTTTTAAATAGGAAAAATATTGAAACTCTTTGGTCATTTTTTAAGGAGATGCTAACAGTCTAATCAGATTCAATGAACTATGCTAAGCTATGCTAAAAGTGGCACCGCCAGACCCAGAGATCGGCTGAATGGATTCGAAAACTCTAGGGGAGTTGGAAAATGAGCCTATTTTCAAAAAAAGTGAAGTGTTCCTTTAAATAAAATGTTTAATGTACTGTAGATGCTACCAAATGAAGCACATTTTAGGTTAACATTTTTTTTTCAGTGTGCCATATAAGGACAGTTCATAGTGACCAGGTGCTCCAAAAACTACAAATAGACCCTTAAAAATATAATGAAAGTAACAATTTAAGTCCAAATGTAAGTCATTATTCAATAATAGTCACTATGTGGTCGTTGTATGACAAGAGCTGCACAATGATTCTTCACAAATGTCTGAAACACCATACAGATCTGGAATGACATAAGGGTGGGAAAACAATGACAAAAATTATTTTTTGGCTAAACTATTCCTATAATACTTAATGACTCTGATTGAATATTTATGATGCTGACGTTTCAGGGATCTCAGTGTTTTCTTCTGCAGGCAGAGTGAGGACAGCAATATAAATCACATATTCATATGACTGACAAACAAATCAACAAGAAATGACTGACAACAAAGTAAACTATGGTAAAGAAAGAGCAGGAAGAGAGGGTTAAAATGACCCAATGTTGTGTCAAATGACAGTCAGAGATCAATAAGTATCAGTTTGGAATCTGATTATAACCTGATGTGCCACCACTTTATTTTCCATCTGCTGTACATGACTGATGGGATTAGGTCACACTAATGCACGCTCTTAAAGCACTTATGCACACATTACCCATATGTGTGTGTGTGGATGCCTGTGTTTGTGCATTATGGTAGTCTATCAAGTATCCAAACAACTCAATAATCTCCAGAATACAGCGTTAAATTCATCACTAATGATTGAACTTTCAAGTTAGTCAATCATGATGAATGTCATGTCTGAGTAAGAACATGTTTTATCCACCTGTCAAACAGGCCGTACATACGCCTATATTTCCATTATGCTTGGAGTGCATTGAATAATGAAGTAAACTATAGAGACTGGAAGTAAAATTTTGATTTTGATTAGAGTTTTCTTTCACGCTTGAACGGACAAAAACACAAAATTATGCCAAAATGCCGTTTTGTCGAGTATCTTTGTAACAGTCTTAAATGAGATAAATAAAGTCTTAAATGAACGTAAAGAGTTGGATGTGTCAGATCCGCGTCATGTACTGCAGGTCTTAAAGTGACAGCAGCCTAATAAACCTGTTGCAGTCTGTCAATAAAGGATTAGTTCACTTTCAAATGAAAATTAGCCCAAGCTTTAC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU325197 False 5383 lncRNA 0.38 6 4053051 4065995
TU325196 True 3170 lncRNA 0.36 3 4060759 4064416

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000072_03972493_03983836 SPA17 coding downstream 69215 3972401 ~ 3983836 (-)
CI01000072_03959944_03964339 NA coding downstream 88435 3959919 ~ 3964616 (-)
CI01000072_03941680_03952617 PDE9A, PDE9AL coding downstream 100434 3941331 ~ 3952617 (-)
CI01000072_03908090_03922942 NA coding downstream 130109 3907387 ~ 3922942 (-)
CI01000072_03898250_03900844 TMEM136A, TMEM136 coding downstream 152207 3898165 ~ 3900844 (-)
CI01000072_04125176_04131163 ANKK1 coding upstream 57563 4123558 ~ 4131448 (-)
CI01000072_04150260_04155131 NA coding upstream 84235 4150230 ~ 4157566 (-)
CI01000072_04156907_04167270 NA coding upstream 90912 4156907 ~ 4167270 (-)
CI01000072_04191370_04195085 NA coding upstream 125375 4191370 ~ 4195085 (-)
CI01000072_04197826_04201434 NA coding upstream 131831 4197826 ~ 4201434 (-)
G286256 NA non-coding downstream 210989 3841670 ~ 3842062 (-)
G286236 NA non-coding downstream 550836 3501101 ~ 3502215 (-)
G286249 NA non-coding downstream 580000 3393763 ~ 3473051 (-)
G286219 NA non-coding downstream 616852 3410662 ~ 3436199 (-)
G286873 NA non-coding upstream 941 4066936 ~ 4067174 (-)
G286874 NA non-coding upstream 1598 4067593 ~ 4067795 (-)
G286877 NA non-coding upstream 14987 4080982 ~ 4081213 (-)
G286880 NA non-coding upstream 27115 4093110 ~ 4093325 (-)
G286883 NA non-coding upstream 203027 4269022 ~ 4270014 (-)
G286005 NA other downstream 1053556 2993769 ~ 2999495 (-)
G285752 NA other downstream 1882393 2168048 ~ 2170658 (-)
G285766 NA other downstream 2044742 2005551 ~ 2008309 (-)
CI01000072_01596829_01610605 NA other downstream 2425156 1594111 ~ 1627895 (-)
G287021 NA other upstream 320150 4386145 ~ 4394223 (-)
G287264 NA other upstream 1314725 5380720 ~ 5382001 (-)

Expression


Co-expression Network