G304457


Basic Information

Item Value
gene id G304457
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000092
NCBI id null
chromosome length 5370156
location 1472008 ~ 1481912 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU345948
ACATACGAGCTTGATAAAAATGCTCATTTTATAAAAAAAAATCAGATGGCACTTAGAGGCTTTTTCATCTGAAGTCTTCATATATGTATATATGTGTATGTGTGTATATGAATTGTTGGTTTAACTTAAAAAAAAGTAAGTTACCTGGTTGCCTTAATTTTGAGTTCACTGAAATTAAAAATTAATACAATAAAGGCGATTGGTTTAATCAAAAGAAACTCAGAATATTATGTTATCTGAACTACATTAATTATCTAAGTTGATTTGACAAAAGAAAAAATTCCATAAGTTTATTCTATAGTTCCATATTCCATAATTTTCCATAGTCTATTAACTGAGTCCATGAGAGAGGGAGCATCCCAAAAAGATTCTCTAAGGCCAAATTAAATGATGAGTCTACCATTTTATTTTTAAACTTTTCCAACGGTTGCAGTGTGTCCGCACTGTTTGGGTCCCTAAGCGACCTGTCCACAACTAAGTAACTGAAAAAAATGTACACACGCGAAATCATTTTGGTTCCCGGGCTGCTTTTACTTTTCCCAAGGGGATGGAAAGGAGATAGAGTGATGGAGAGAAGGATGGGTAGTGAAGAGATAAAAGGATCAGGCTGGAGTTAATGGACAGGTCCGGCTCAGCGAGACATCTGCACCCTGATGAATGTCCGTTTGGATTAGCCCAGATTAACGCTTCCCAATCTACTGTTGACCTTGCTTGGGTTAGCTATCACGCTAATCTATTCACAGCTTCTTGGTTTTGTGGCGATGTGGTATGATGAGCCTCGAGCTGGTAGGATCTCAGGATATGTTTACCGCATGCGGTTAAACTGATGAAAGAGAACGTTGTTCTCCATTAGGAGACCAACCATGTGGCAGTGATGCTTTCATATGCAACAATGACCTATTTTCTGCATGTCATCAACGAAACTTCCTGGTCCTGTCCGCCCCATTAACGCGGCCTTGAAATGCAATTTGAGTATGTGTGTTCAAGCATGTTTGGTTCACAACGTAGTAATTGAGGAACTGCACAACAGTGGCTTTTCATTCACATTTTAAATTGGGAAAATGGCCATTTCATGAGCCATTTCACCCTTCATGAGCCAAGTTAAAGGAGTAGTTCGCTAAAAATGAAAACCACTCAAATGTACTTTATTGTCTTATTTTGTACATGGAACAAGAAAGGACCATTTTTGAAGAATTTTTATTAGTGATGCACCAAAAATCTGATCAAAAATGATTTAACAATATAAAAAATGTATATAAAAATTGATAAAATCGCTAAATACTGAATTCGCTACATTATATTACTTTGCAAGGAGGTGGTGACGTCGCTGTTTTCGAAGTAATGAAACTCACAGCTTCATTGCTAGTAGAGAGACGCTGCACAGATGCAGGCTAATTATTGGAGCTGGATTGTAATCCAGAAAGGTCCAAATGACAATCATCAGTGACAACTGGAGATTAACCCGTAGTCAAAAGCAAAAGACTTCGGACTGTGGAGTGGCTACAGAAATTGAAATCTGCAGGTAATGCTAATACACACTAAATACACAGTCACACAATGCTGATGTTGTTAACATTAACAATTTGAGAACAAAGTATAACAATAATAATAATTTGCACGGTTTGACGTGATCCGAGCTAAGCGATCGTTAGATTTAATCACCATTGGCAGCGCGATTTACTGTAGGCCTAATACTTTTTTTTTTTGTTTTCAGTTGGTCAGAACAAAAATGGCAGACATGTTACTTACTTGTTCAGATGACATTTTCCGGTGAAAATTCTTATTTTGGTCATACTTCCAAGATGTAGAATCTGTGATTCTGAAGTACAGTATCCACACCGATGTGGTGACTGACAGAAAACATTAGATTCATCCGCGCTGAGGAGTCATGCCGATGCACAACCCACGTAAAGATGATAATTCTGCAAATAGCTGCAATTGCAGGTTTCAAACAGAGATGGTGACAAAGAGTCAACTTACAGACTGCAGCTTTAATATTCATGTGTCTGTATAATGAATGTGTTGCAGGTCTGTGTTTTATTGGTTGGTTGATCATTCAATTAAGTCATTAATTACACACCCTCATGTTGTTCCAAACCCGTAAGACCTTCATTCAAACCTTCTTCGGAGCACAAATGAAGATGAAATCCAAGAGCTTTCTAACCCCAAATAGACGTAACCACTTTCAAGGCCCAGTAAGGTTGTAAAGACATCGTTAAAATACTCCATGTGACTACAGTAGTTAAACCTTAATGTTATGAAGTGACGAGAATAGTTTTTGTGTGCAAAAAAAATGACTGTATTCAACAATTTCTTATCATTTACTACACTGTACCATTTTAGAAGAACTTGAGTCATCAATAAAAAAATGGTTCATTTCAAATGCAGTAAGTTTAGACATCATGTTATTGATGTCATTAATCACTTTAGAGGTTAGGGGTTTGTTGACATCCCTAATATAAGTATTAATTAAGTTTACTTCAGAAAATGTGAACTCTCATCTTTCATGGCCAGATTATTTTATGTGAAATTTTTTTTTTCAGTTTTACTAATGAGAAGTGTAGCTGATGGCACTACCATAATCATGTGAATGAATTAGCACTAGCCTGAGGGAATGGAGCTGTCTGGGTTTCGCCCGGAGGAGGGATTCTGGCAGTGAGGAAAGTCACACTGGGAGTCTCAGCTGTTCTCCAGCGCCTCTTCCTCTCACCATCACTGGGTGTTCTGCCACTCTTCTCTAGAGCCAAGCTGTCCACTCTGTGCTACGTTTACCCCTGTTGATCGTACGCTGGAGTAAAATGTGCTTTATGGCGAAATGCGGTTGACGATGGGTGGGTAGTGCGAGAAATTTCTATGAAATGGTTTGAGCACAGTTTAATGTCTTGTGTTGATGTATTTCCTATTGCAGGGCTATCAATTAGCTTCATTTGAGGGCCGGATTATCAAAATAAATTGTAGAATGAAAATTTGAGGTGGGCCAAGGGGGTGGAGGGTTGTCCCGATCGCTTTCTGGAGGCCTATAAAATGAGAAATTCTAATCAAATGCATATTCAGCAGTAAAATGTACTGATATTAACAACAGTAAAATCTATGAAGTATGTAACAGATTTTTATTGGGTTAAATTAAAATATTCTGACAGTGCGACTGAGTTGGTAACCCCTATACATACACTGAACAAAACGATAAACGCAACACTTTTGTTTTTGACCCCATTTTTCATGAGCTGAACTCAAAGATCTAAGACTTTTTCTATGTCAATTGCACGCTCCCTCAAAACTTGCGACATCTGTGGCATTGTGCTGTGTGATAAAACTGCACATTTTAGAGTGGCCTTTTATTGTGGCCAGCCTAAGGCACACCTGTGCAATAATCATGCTGTCTAATCAGCATCCTGATATGCCACACCTGTGTGGTGCATGGATTATCTCGGCAAAGGAGAAGTGCTCACTAACACAGATTTAGACAGATTTGTGAACAATATTTGAGAGAAATAGGCCTTTTGTGTACATAGAAAAAGTCTTAGATCTTTGAGTTCATCTCATGAAAAATGGGGGCAAAAACAAAAGTGTTGCGTTTATAATTTTGTTCAGTGTATATAAACACTGCTTTTCCCACACTCTGCATTACCACTTTTCCACAAGGCTCCGATATACTTCAAGCGAAATCAAAGAACTGGTGGCACATAATTTCAAACAAAATTAGGCCAAAATTAAGTTAGTTTGGAGTTTGTTTCAGGAGTTCAAAACTTTTTGCTAAAGTGAAATTTCCAAAAATCTATTGTATAAAATGCAATAAAAAATAAACGTGATGTGACTTGACTGGAGTACTCAATTTTAGAGCTTGTGCAAACATATCCACATGCTTTATTCACTGCTGTTTTATATCAGGATTTTTAAGGGTGCGTTCACACTTTGTTTGGTTCGTTTGGTCCGGACCAAAGAAGGAAAAAAAAAAAAACCATTTAGTCCTGGTCTGATTAGCGTTCAGATTGGCAATTTTATTACCGAACCTAAAGGCATAGGGATATGTTCACAACCTGATTGGTCTGATTTTATGATGTATTGCCTATTTTGAGACGGGACTTACCGAATATCCAAAACAATGCTGTGTGCTGAGATAAATGCGCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGCCTGCATATGATGATATTTTTGGCCAGCTGGGAACTCGTGAAGCACTTATAAAATGTGTAAAGGATTCAAAACAGGGGCGGGAATCCCTCCGCCTGTGATGGGCAAACCTGCGACTATGACGAAAAAAGCGATGAGTGATGATTCTGTCCTTTTTAGGGTCTCATCTTCCTGTTTTTGGTTCGTTTACATGTCTTTGGTCCATATTGCGTTCATATATCATTCGAACCGCACCAGAGTTCATTTGGAAGCAGACCGAGACCCATCTTTTCAGCGGTCTCGGTCCGCTTGTTTGGTGTGCAGCAGGGTTTGGATGGCAGCGTTCACATATGTTCAAATGAACCGCACTAACAGAGCAATCGCACCAGGGTTCGTTTTAATCGAACCAAACATGACAAGTGTGAACGCACCCTAACACTTCTTTTTACCCCTAAGTGAAAAACAAAAAAATAGACTACTTCTCCATGAATATATCTTAGCATTTACACTCCTATTTCTTGAATCTTTTTCAAATCTGAGGTGTGAATGGATCTTTGCTAAAAAGTGCTAAAAAGTTCATGATATAATCCCACAGCTCAACTAGGCTCTTCTGTCCTGTAATGTTTTTAAATCTGGGCACAGGTTGTCTTTTCCTTACAGTGCTGGTTTATTTGATCGTTGGCCCGTGCCATAGTTAATGGTGTAATATGCAGCTCAAGCATATCCACTTACAGAAAAACAGACGCTTATGGGTGGTGCTCACTTTGTGAGCCACAGTCTCAGTACGGTACCCTAAATTACCCCCACGACACCACCGGTCTGCACCCTGCTGTGACGGCACACACCCTCACCCCCCT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU345948 True 9475 lncRNA 0.40 3 1472008 1481912

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000092_01352766_01386659 ECE2B, ECE2 coding downstream 85349 1352745 ~ 1386659 (-)
CI01000092_01317932_01336911 ANO7 coding downstream 133462 1317774 ~ 1338546 (-)
CI01000092_01307631_01315805 NA coding downstream 156203 1307315 ~ 1315805 (-)
CI01000092_01270604_01273133 NA coding downstream 198875 1269745 ~ 1273133 (-)
CI01000092_01266540_01267541 NA coding downstream 203529 1266358 ~ 1268479 (-)
CI01000092_01488880_01522758 TFDP2 coding upstream 6968 1488880 ~ 1522758 (-)
CI01000092_01562366_01575276 RFFL coding upstream 80136 1562048 ~ 1575276 (-)
CI01000092_01588502_01599337 NA coding upstream 106561 1588473 ~ 1599337 (-)
CI01000092_01802304_01802591 NA coding upstream 318883 1800795 ~ 1804239 (-)
CI01000092_01866991_01869504 LIPT2 coding upstream 384989 1866901 ~ 1869535 (-)
G304487 NA non-coding downstream 48217 1423589 ~ 1423791 (-)
G304455 NA non-coding downstream 125120 1346329 ~ 1346888 (-)
G304484 NA non-coding downstream 126395 1345293 ~ 1345613 (-)
G304481 NA non-coding downstream 182231 1289439 ~ 1289777 (-)
G304477 NA non-coding downstream 185453 1286228 ~ 1286555 (-)
G304512 NA non-coding upstream 66326 1548238 ~ 1548482 (-)
G304518 NA non-coding upstream 73486 1555398 ~ 1555698 (-)
G304520 NA non-coding upstream 129168 1611080 ~ 1611355 (-)
G304524 NA non-coding upstream 147172 1629084 ~ 1629384 (-)
G304544 NA non-coding upstream 213896 1695808 ~ 1696381 (-)
G304459 NA other downstream 239716 1231900 ~ 1232292 (-)
CI01000092_01086701_01097333 CLRN1 other downstream 375090 1086404 ~ 1097333 (-)
G304369 NA other downstream 413088 1058325 ~ 1058920 (-)
G304368 NA other downstream 416286 1055304 ~ 1055722 (-)
G305772 NA other upstream 1242682 2724594 ~ 2724944 (-)
G306014 NA other upstream 2195962 3677874 ~ 3679488 (-)
G306679 NA other upstream 3014502 4496414 ~ 4505953 (-)
G306792 NA other upstream 3322483 4804395 ~ 4865973 (-)
G306902 NA other upstream 3671756 5153668 ~ 5154133 (-)

Expression


Co-expression Network