Fish Transcriptome and Expression Database

G307552

Basic Information

Item	Value
gene id	G307552
gene name	NA
gene type	non-coding
species	grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species	economic fish

Chromosome Information

Item	Value
chromosome id	CI01000093
NCBI id	null
chromosome length	1475560
location	684406 ~ 715636 (-)
genome version	v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU349471
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TTCACTGTGTTCATTATTCTCATGTGTTCATTATTCATGTTTTTTCACTTAAGGCGTAAGAATTGCATGAAATGCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTGTGTTCATTCATTCACCTAATTCATAACAAATGAGAGTAACGTTTCTTTGTGTACTCGTTTATTCATTCATTGACTCATAACAAGTGCATTTTGACCAAGCATATGCTCATTAATTCCTCCAATGACCTCATGCCTTTTGCAGAGTGCAGCCTCAGAAATGGAGACTGAGATGGAAAGAGAGGGAGATGGAGAGGAAGGGCAAAAGTATGAAAGCGTAGACATGTTATGATGGACGCTGATGCATCATTAGCCCGCCCGCCCTGGCTGTGTACCGCCAGACGGCCAATTTCTCCTTCAGCCACACTGCATTAGAGCACGACCCTCAGGATTATGTCCATTGGATCCTCTATTTCAGCCCGCGCCACGCTATCTGCGATAGATTATTTAGCATCAGCTTTCAGCTACATTAAACCTTGTTAAAAGCAGCTTCATGGCGAAGGATTACAAGGACATGATAACAGGGAGGGCTATCTCTTAATGAAGGAGTAATTTGCTCCCTGCTCTCTCCAGACCCCCTTCAGGATATACTGTGAAGGGTACGGGGGGGTGGAAGTGGAGAGGGCAGAGCTGCTCTCTGTGAGAGCTTCCCAGGGGCTGTGTGGAGAGGCTCTTATGCCCTTACAAATACCCAGAGATGCTGCTAATGCGTGTCCACTTGCATGCCATCAAAATCTGAAGCATGCCCCCACCTCTCTGATGCATTGTGCCTGTTGTTCTCTCTCGCTCTATACGATTCTGGGCTTCGTATCTCTCTCTTTTGCTCTCTTTTATCTATTGGTCATGATGCTGTATTAATCCTCTTGCTGTCTTAAACGTGTTGGTAAATCTACCATGTATAGTTGTTTTCTAAATGATCTAAGAATGATTTTAAAGCACTTTACAGAGTTTTAGTTGGCGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id	representative	length	rna type	GC content	exon number	start site	end site
TU349471	True	10464	lncRNA	0.39	4	684406	715636

Notice the +/- strand.
Display format: symbol/gene id: RNA id. (Except when gene id is similar to RNA id.)
You can browse transcripts by dragging.
A more detailed transcript can be viewed by the zoom button in the upper right corner.

Expression

Co-expression Network

Homologous

species	gene id	symbol	gene type	chromosome	NCBI id	location
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)	LOC118966682	s47a1	misc	NC_048574.1	CM023228.2	2166865 ~ 2171687 (+)

gene	XLOC_000007 f7
RNA	TCONS_00000019
bioproject	PRJEB12982

economic fish

Basic

Function

RNA

Expression

WGCNA

Homologous

G307552

Basic Information

Chromosome Information

Sequence

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

Expression

Co-expression Network

Homologous

copyright 2021-present@Lab of Aquatic Bioinfomatics, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences