G361605


Basic Information

Item Value
gene id G361605
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000154
NCBI id null
chromosome length 1600967
location 794129 ~ 797777 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU412385
ATTTTTTATAAATGTTATAATGATTATCCCATTAACAGCCTGAAGAAACAATGACACATGTTTGTTTGGACAGGGTGTTGTGTTCTTTACTATGTGTCCATTGTTTCTAGCTTGAGTCAACACTGCATGAACAAACCCAATGTGCACGAAGCAGTATCGAATGTACAACACTGTGCAAAAAACAAACAAAAACATAAATACACAAAATATTACATTACGACAGGGCATCAGATTCACATCAGCATGCATGCTTTTAGCGAACATGGCAGGGATGTGAATTTACACCGGCACTATACAGACTTAGTTTGTTTAGTCAATTAAATTTCCTGATTCTCAGAACATTATACAGACTGTTAGTGGGTCATTCTCAGGAAAAAAAAAAAAACACGTTTGTGTGATAAATGCATAACAGGATACTGAATTTATTCACATTATTTGTTAGATTTACCTATTTAGTTTCTAATGCAAACATGTTGACAATTAAACAATTCTATTTTGAAGTGCTTTGAATTCAGCCAATTTGAATGTTCCCAAAATGTCATGCTTTGTGTACTGTAGTTTTTTTAAATTCTTTATGAATTTTCTGAGAATAATTTCTGATTTGTCTTTGTTCCTGCATGGATAATAGTTTAAAAATTGACCATTTGTTATCTACTAATCTGAATTTGTGGGGAAATGTATCCCCCTTAAGGTGGCCCCCCAATGTCTATTGGGGGTACAACCTAATGGATTTATTTTCTGGCAGTATTTCCTGACAATGACCCTAGTAAAGCATGTAATGAGACAGTTTTTGCCGTTTTTCTAGACCAATATCAAGTCTTTAGCTGCAGAAAACTTCAAACACAGTTTATAAATATGTTTCTTTACAGTGACCATTATATATGGTAAAAGCAAATGTATTTTAAAAACAGATATCCATGTTTTTAAGCGAAACATTTAAGGTGATATTAGTAGCTTTGAGAGCAGGTATAAAGCAGACATGCATTGTGTTAGGATAGTTTGAACTTTCTACATCAGCTGAACTGTAAACATACTATATGGTCAAATGTATTTACACTATACAGAAGCCTTTCTGTTAACACCATGTACTAACCAGATGATGTGCTAAAGCAAAGAGATAAAATCTCTTCTATCTGAAACTTTGTTTTACCCAACCCTGATCTCTTGGTTTCGATTTTGGCAGCTGGTACACAGCAGCCCGTACACAGTGCAATCTTATTGGTCCAAACTCCTATACCACACAACTATTCATTAAACACCAGATATCTTCTGATTGTTGCCGGAAACTCATAACACACCCAGATAAGACACAGCTTAAATGCCTTGTATTTTTGTTATTTACATTAAATTATTACAGTTAAATTAAAATATCCATTCTTAAGTACCTCCATGGCAGTGAAATGTAATTTTTAACTTTTCACAAAATACACACTTCTACAACACATCAATCCCTAAAAAGCTATTTAGGTATTATAATTTTGGTAACACTTTACAATAAGGGTCATTAGTTAACATTAGTTAACTACATTAGTTAACATGAACTAATAATGAACTGCACATATACAGCATTTGTTAATCTTTGTTAATGTTAATTTAAAAATTTACTTATACATTATTAAAATCTTGTTAACATTAGTTAATGCACTGTGAACTAACATGAACAAACTATGAACAGCTGGACTTTTATTAACTAACATTAACGAAGATTAGTAAATACAGTAACAAATGTATTGCTCATGGTTAGTTCATGTTAGATAATACATTAATGTTAACAAATGAACCTTATTGTGAAGTGTTACCATAACTTTAAAGGGTTAAGGTTCTTCTGAATTTTTTTAAACTGTACATTTGTGAACCTTGTAAAGCTCATCTGAATAAAAATAAATTAATAATAATTAATAAAAGTGTTTAATAACTTCTGTGGCAATATTTTTTATGACTTTAATGTAATTGCCTTCACTGTTTGATGCTTTCACTGCTTTCCTCAGATTCTGAAAACAGACTGTACAAAGCACATTAATATTGAATAAGACAAGCTGTTTTTAGTTTATGATTGGCTGTCTGCTGCTAAACAACTTGCTGTAACATTCTAGCACATATTTTGTTACACCATACATCTCCAACGCTGCAATTTCTGTGTGAAGAGTGTTTCATGAAGTGTCGATTTTAAAAGGAAAGTGGTATGCTTATTGTTTTCCGCTTCTATATGAGCTTTGATGTTCATGATGTTCTATGGTTGGTGATTATGGGTAAACTGAAGGACACGTGTCTGTTTTCTACATGTTTGTGGTAAGTGCCAGTTCCCCAAATGCACATTGGTTGTTTGTGCCTTCACATTCTGTTCATTTGTCAACATTTTTGTCCTTATGTTGTTCATCCAAATTCTGTGGTTTACATGCACGGAAGAGCCTGTTTAGCGATGGGCGTTATTTCACACATTTATAGTACATTTCCTTTCCATCGCCATGAACGTTATCAATTTTGACAGGTCCTCTGCTGTCAATGCTTTAATATTTGGTTCTAGTACACACATTCAGGAAGACTTCTCAGGCTTTGAAGTCTCATGGTCATGATATATCTCAGTGCACACCGTCATATATGCGTTGTCTCTCATCAAGGCCTCACTGAGGGAGGCTGCAGTAGATCTTGCTCTGGATGCTGGAGCTGTGTTTGACGTCTCCAGACTCCATTGGGAAGGACAGGGAGTTTTGAGCTGTGGTCTTTACTGCATCTCTGGGGAAGCAGCAGTGAAAGAATTCCCGGATATGGTTGAAGACTGCCTTACGGAAGATGATGAAGATCCAGGGGTCCAAGATGGGGTTAAATGCAGAGAAGCGGAAAGCCATTAGATTCTGCTGATCATTCCCAACCGGACTAATAGCA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU412385 True 2883 lncRNA 0.35 2 794129 797777

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000154_00776484_00783606 CALML6, CALM2, CALM3, CALM1 coding upstream 10447 776484 ~ 783682 (+)
CI01000154_00753231_00755134 TRAPPC4.S, TRAPPC4 coding upstream 38995 751150 ~ 755134 (+)
CI01000154_00709450_00737541 SACS coding upstream 55885 708287 ~ 738244 (+)
CI01000154_00641532_00674274 GAB2 coding upstream 119855 641532 ~ 674274 (+)
CI01000154_00583484_00594396 NARS2 coding upstream 199698 583484 ~ 594431 (+)
CI01000154_00887422_00890641 NA coding downstream 89645 887422 ~ 890943 (+)
CI01000154_00902311_00907798 RHOUB coding downstream 104277 902054 ~ 907995 (+)
CI01000154_00956115_00973357 RAB4B, MIA-RAB4B, RAB4A coding downstream 157253 955030 ~ 973682 (+)
CI01000154_01001933_01010068 NA coding downstream 204117 1001894 ~ 1010582 (+)
CI01000154_01057020_01083988 ARHGAP35 coding downstream 259007 1056784 ~ 1086056 (+)
G361598 NA non-coding upstream 10776 743086 ~ 783353 (+)
G361584 NA non-coding upstream 86513 706992 ~ 707616 (+)
G361580 NA non-coding upstream 106871 687049 ~ 687258 (+)
G361578 NA non-coding upstream 109794 684094 ~ 684335 (+)
G361569 NA non-coding upstream 211521 581978 ~ 582608 (+)
G361627 NA non-coding downstream 36326 834103 ~ 834363 (+)
G361628 NA non-coding downstream 38568 836345 ~ 836602 (+)
G361631 NA non-coding downstream 48941 846718 ~ 847242 (+)
G361694 NA non-coding downstream 64902 862679 ~ 862917 (+)
G361670 NA non-coding downstream 169577 967354 ~ 970074 (+)
CI01000154_01258168_01258920 RAB34 other downstream 459594 1257371 ~ 1258920 (+)

Expression


Co-expression Network