G414452



Basic Information


Item Value
gene id G414452
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000300
NCBI id null
chromosome length 11740502
location 10646191 ~ 10663487 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU475996
GTTTACTTGCAGTCTGCATTAATTTTTGTCGAGAGTCTCTACGACTCGGAATTGAACTGTTCATATCGAGCGTCATCACTTTTTTTTCTTTATTTGTTTTGTTTTTGTTTCATCCATTTGTTTTAAATTTGTTGTTAAACAGTGTAAATACGTTTTTTGTATTGTTTTTATTTCTGTAAATACACCAGGATGGAACTTAATTCTCTTCTACTTCTTCTTGAGGCAGCAGAGTATTTGGAAAGAAGAGACAGAGAAGCTGAACACGGTTATGCGTCTGTTTTGCCGTACGATAGCGACTTTTCCAGAAAGAAAACTAAATCTTCTCCCATTTCAAGAAAAAACCACAACAATAGGTCATCACACAATGAGCTGGAAAAACACAGACGTGCCAAACTGCGATTGTACCTGGAGCAGTTAAAACAGCTTGTGCCTTTGGGTCCTGATAGCACCCGTCACACCACACTGAGCCTGCTCAAACGCGCCAAAATGCACATCAAGATGATGAAAATAACTTGAATCCAAGGAGCTCTAAAAGAATTGTAGAATTTTTATCTGAGGCTAAAGGCGGCATCCTTCAACTGAAGTCACGCCACCCGCGCTTCATGTGTTGATGACTCCATTGCTGTAGACCATCTACAAATGTTAAATCCACAAATAAAATGTTTAGGTTACAACTGTATCTGTATGAAAAAGATTTATTTTATTGTTGTTATTTTCAGAGCTTTTAATGTACTCTTATTATAGAAAGAACTTCATTAACATTTATTTAGCACTAACAAGTAACCTTTTGTGCAGGCAAAAGTGGCCCAAATCTTTTTTTTTTTTTTTGCTCATATGCGACTCAGATCTGAACAGTCATATCATAATTCATGCTTGATCTAGAGTGATTTTTACGCCACTTTACAACATTTGTCACCATTCCCGCGCTGGTGGGAGTCACTCTAAAGATTTTACATTTTGTAAGTTCTTTGGTCACTCTATGAATATGGTAGAAAGCAGCAAAGTTAGTCAGTGAGTGATGGTGAGCTGTTATACTCTTTAAGTATTACAGTGACAGCTCTATAAAAGCAAAAAAATGCAAGGATAAACTGTACGAGAAAATTATGCTCTCTTTCTCTCCTCATCCTCGTCTATGTCCTCCTTATTGGCTGTGCACAGATTTACTGGCTTCCACAGCACATCACTGTATAAATGAACTCATAAATGTCGATTTCAGTAACCTCTGTGTTTACTTCCGTAAAGTTCTGTGCTGTGTGCCGTCCTTGTTATTGTTCTTTTGCACTTACAGGTCAGTTCAGGATCGTAAGCTGTTCAGACTTAAAATCTGATAGTGGCCACATTTAAAAAATAATGTAAACAGCCAAGCAAAAAAATCTGATCTGAGTAATAAATCAAAACTG
>TU475997
GTTTACTTGCAGTCTGCATTAATTTTTGTCGAGAGTCTCTACGACTCGGAATTGAACTGTTCATATCGAGCGTCATCACTTTTTTTTCTTTATTTGTTTTGTTTTTGTTTCATCCATTTGTTTTAAATTTGTTGTTAAACAGTGTAAATACGTTTTTTGTATTGTTTTTATTTCTGTAAATACACCAGGATGGAACTTAATTCTCTTCTACTTCTTCTTGAGGCAGCAGAGTATTTGGAAAGAAGAGACAGAGAAGCTGAACACGGTTATGCGTCTGTTTTGCCGTACGATAGCGACTTTTCCAGAAAGAAAACTAAATCTTCTCCCATTTCAAGAAAAAACCACAACAATAGGTCATCACACAATGAGCTGGAAAAACACAGAAGCTGGAGGAACAGGACAGGAAGGCTCTAAACATGAAGGAGCAACTGCAGAGAGAACATCGCTACCTCAAACGGCGTCTGGAGCAGCTCTCTGTACAGGGCTTAGAGCGCATTCGCACTGACAGCATGGGCTCCACCATCTCCACTGACTCTGAGCAAGAAGTGGACATTGACATAGAGGGAATGGAGTTCACGCCAGGTGAGGGTGATAGTGTGGACAGTGTTAGCGATGGTGAGGACCACTACAGCCTGCAGAGCAGCTCCAGCGATGGAGGCCACCATTCACATTCCCACAGATTACAGGCTCACATCTGCTAGGCCGTGTCAGAAGGCAACAGTGTGTCACCTCCAACATACCCATCAGCCACTCCCAGCTGGCAGGAAGCACCTGGCTGATTTCCACTCCTCAGAAAACTCTCTCTCCCCTCTCAACCCTTGCAACACTTTATATCAGACCCCCCTCCAACCCCACAAATACACACAGACAAGCAATATGTGGTTTTAGTGAGAACATGTGGTGTGGTAATGCAGTTTTCACTTGTCTGTTTTGCTGCTGTGTGAAATTGTGGCTCTGTTCCTAAACCTAGTAACTGCCTTGCTGTCTATCATCTACATTGGCAGTCTACATTGGTATCATCTAAGGCAGTATCTTAACTGAAATTGATCAAAATTATAAAACACTATATAGGCTTGCTTATGTGCATCACTCACATAACTCACATTTTAATCAAATATATCCAATTCCCATTGGAATTCCAAGCCACCACAGGCGAGGGCAACACATTTACCCACAAAGATAACTTCTCTTAATGTGGAGCACACATGCCTGTGCACCCTCACACAAAAACTTGCAGCTTCTTTTACTGAGGCAAAAATTTATAAATAGAAGATTGCACACACACACACACACACACAGGAACACAGAACCTTGTTTTGAGCCGCTGCCCTGTGAATTTTATAAATAAAATAGCTTCACTACTGAAAGCTACAATATATTTTTCAGCAACAAAGGGGATAACGTTGCTGTTTTTGAAGCCATTAAACTCACAGCTTCACTATATAAACTAGATGCAAGTAAATCACATGCACAGTCTCTTTATCGAATACATTCAAATAATCTTAGAAGGTTAGATCCAAGTTACAAGTTGTTACAAGATACAAGTTGTGTCTTAAATGACTAAACAAGTGGGACAAAAAATCGGATATGGTCAAAAGATCACATCTGTGCATTAAGCCTTGTACTGTAAACACAGCCTTTGACTGTTCCAAAAAGTTGGAAGTTAGACTATAATATCTAAAAATGTTGTCTATCTAGGCAGCTTGCTAGTTTTGGGAATAGAGCTTGCTTGTGTGCCAGTTCATTTTGCACAATGGGCTTGAACAGAATTCTTGTGTTTCTTGAAACTGCAAGACATAGCATTAAGCACATTAATAGACTCCTTAATAGACTAATGGAAAGGGAGCAAAAGGCTAAAACTTCAGGGTACTTCTAGGAATCAGTGGTTTCTATTTCAGATTAAAAAATGTTATGTTCTCACCACACAGTTAAAATGACCTTGAAGTTCATTAATTTGTTACTTTTTTGTGAAAGAAGAAAGAATATTAATATCTAATGGCTGATTACTTGTGTAATTAATTAAAACACTCAGTTGCGACAGGAACAAAAAAAATGGTGCTGTCCAGATGCATCACTACGACAGTCTGTTGTCAATACTTTTAGTAGTAAATTATGTAGCAATAAACTTGGAAAGCTACAGCTTTCTAATGCAGTGAAATGATTCTGCACCAAGCCTGAAAAACTTGAGAAGATAAGTAGTTTTGTGAGTACTTGTACAACTATCTTTGTGAAGACAGGTTTGAATTTTAGTGGAGTGAGGACAAAGAGAGTAAAGTGAGAACATTTTGGCCAGTCCTCAATTTCTGACACTCTTTTAAAGACCTGTTTGAGGGTCAAGACTTGGTTTTAGGGATAAGGTTATAATTAGGTTAAGGATAGGTTTAGGGTAAGTGTTCAGGTTAGGCACTTAGTTGTGATGGGTAGGGTTAGTGCAAGGAGCTAGAGATGTCCTCACAGAGATAGATGTACAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCCAGCAATGAAACTGACAAGTCAAAACTGTATGACTGTACATGTGAAGGTGTAGGGATGGGAAAAGCTCTTTGTCGAAGTGTTGGTACTATCAGAAAATTATATTGATGCTTTTAGTCCCATGTCTTTCCCTGTAACTTACTTGCAATAATTTTTGAAGCCTTTATTCTTCAGCAGTAAATATGCAGTGCGGTGTGCAATATTCAGAGTATATAAAAGAAAGTTCTTTGTGCTGGGAATTCCAACTCTTCAGACAGTCCCAGTCTTAAAAGCAGGTTAGACCAAAAAAAATAAATAAAATAAAATAAAATAAATAAAAAAGCAAAAAAGCAAATGTACAATACAAAAAAAGAAGCCACAAAATACTTGTGATTTTAACAAATGCAGTTTATTTTCTGTAGTAGCTTTTGTACTATATTTTCCTAAATAGTCCTTGGTTAAAAGACAAATAGAAGACCATATAAATAAATATATAGTATATACAATGACAGAACATGAAACCAGGATAATGTTTGGGAGAACTCTGGCATTTGTCCCTTATCTCCAGCTGTCATGCTGTGCCTTGACTGGTCGTATCCCTGTTTCTCCCCCCATCTCCTTGACACATCCCTCCAGCCCTGCTCAGATCCACAACCAGCCAGCCACCCTGCAGCTTCCATCCTCAGAATAGACTCTTCTTTGGCCTTTAGCACAAGGTGACGAGAAACATTCGTTAGTCACCTCTGACCTCCATCTTTTAATTCTCCTAAAATGTGCTTTCCATTCTGCCATGCAACATCATCCGCATCACACTGGTCATCTCCTCTTGTGGCAGCTCGTCTCACCCCATTGAAAAGTGTTGTCTAATCAACCCTGCCCTTGAGGCTCTTTTCATATATTTTTTTTTTATAATAGCTGTCTTTTATTGTCTTTATGCCTAAGATGTGTTTTGTATTTCAAACAATGAAGTGGAAGACCTTGGGAGAAGAGCATTGGAATCAATCATTAATGGCAGCTCGAGTCCTCCCCACCCTCTCCCAATGGTAGTTCCTGTTTTAGTGTTAAAGTGTGCTTAAGGTGATGGTAGTATTTGATCCTCTGCCCATAAAAGCAAAGATACAGCAATATGATTTTTTTGGTTTGTTTGTAAAGGGGTGGAGACTGGGTGTATTGGTAAGCAGCACTGTTTCAATACTATGGTGCATATTGTGACCAACTCATTGAGGTGTTTTTTTTTATTTTTTATTTTTTTTATTATTGTTATTATTTTATCTCTCCATTCTCTGTAAACACTGAAAGGAGGGAACATGTTTTATTTTATATCTTTTTTTAAAGCTACTTTTTCATTGAAGAGTTTACATTTATGTCATGGATATGCCTGACTGTTGTAGCATTCTTTTTCAGTGTGATTAAGTGAATTGTTAAAAAAAGAAAAAAAGGAAAAAAAAAACCTCTCGCACAGAACCTCCCATTAACATGATTTGATCAAGAGTTAAGAGAATTGTGCATGAGATTTTTTTCAAATCTTTAAGAGATTGTAGCTTTCATTGGCATTATCTAAGAATCACATGTCACATGCCAACTATGTGAAATCAAGCTAGTCAGCTTCCAGTGTGGTGAAAGAAATACTTTGTAACAAAGACAGGGCTATTCAGTGGCTGCAGGGTTTTTGAAAGCTTTAAAACACTAAAATGAGTGTATGTCAGCAGACAGGTACACATATAGTTATGTGAAAAGAGCCAGGTGTCCAAGGATCTTAGATGTGTGTTCCAAAAAAAAAGTACAGAAGATACAAAAGATGCCATGTTGTGATGATACTTTGTGTTTGTTGGGCCTTGCAGATTGAGCTTTCCGCAGAGTATGTTTGATTGAGTTTACTTAAAGTCTGTGCGGCAGAAAAGCTAGATGGCATGGAGACAGGAGTCTGGGAGTCAAGGCTACTAAAGAACAGAATGACCAAGAAGAAAATATATAGCTATAAATTCCTTTTATCTTTGTTATACACATAAAAGCACTTGAAGAAAGAAAGAACTTCCATAAAAAAAGATTCCTGCCATATAGATTCTATTAGATATAGACTTATTTTTCTAACCCCTCCCAATTTTAGGAGGCATCAGTTGTAATATCAGATTTATATCTTTATATGACTAGGTTTGTGACCCATATTTTCTGCTCACTTTCCTTCTCCCCTGCTTTTATTTGTTTTGTGTTCATGGAGCAGTTTGTTGACAGGTCAGCATGTGTGGTGTAGCTCACAGAATGCTTGCATTTTAGCATGAGAAAAACTTGCAGAAAGACTGCGAAGGGAGGGTTCTGTGCCAGAGACCTGTGAACAGATTTCCTTTTAGAAAACAAGTAATATGCATTCAGATGTTGTATGATATTGTAAAGGTGTTTTTTTTTCTTTGTGTGTCTGTGTGTATGTACACATATTTACCTGGTGCTGGCTATATTTAAGCCCACACTCTAAGGTATTATGTATTCTTGTATTGTAATATAAAGAATTAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU475996 False 1285 TUCP 0.37 4 10646191 10663487
TU475997 True 383 lncRNA 0.38 3 10646191 10648902

Expression



Co-expression Network


Homologous


species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) G9883 NA non-coding NC_047595.1 CM018541.1 17909358 ~ 17909757 (-)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G8542 znf281a,LOC108432039,LOC107737892,LOC107720029,LOC107674693,LOC107591442 non-coding NC_035898.1 CM008301.1 6717714 ~ 6725962 (-)