G419350



Basic Information


Item Value
gene id G419350
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000304
NCBI id null
chromosome length 18613800
location 2250825 ~ 2251046 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU481688
TGGTTAATGTGCAATCTGTCTGGGAGGGGAAGCTCTGTTTGCAAATGAGTTCTGTAATGTTTCATCCTGTTCTTTTGTACTTATGTTGTAGCTCACGGGAATGAGAAGTTTCCTCTAGAAGTCATACCCTTTAAGCTATGCTTGCAATCTTAGTCTGAACTTTTGAAAACCCTCGGCAGTTACAGTTGACATTTGAGGAAGTTTCACAAAAGTACCAGAATGGCTGACTACAACACCGAACCATCAGCGCCTAGCAAACTCAGTGAAGTTCAGGATCAAGTCAATGATGTTAAAGTGATTCTCAAAGACAACATCAACAAAGTTCTGGAGAGAGGAGAGAGGTTAGACGACCTGATCGGCAAAACAGATGATCTACAAGCTACGGCTGACTCATTTCAAAAGACGTCCACACGTGTTGCCAGAAAGATGTGGTGGAGAAACACCAAGATGATGATTATAATTGGTGTGGTAGTGCTTGCCATCATTGTGTTGATCATTTTGTTAGCTACGAACGTGATTCCCACATAAATTCAAACAGTTTCATAGCAAAGAAATGATGCATTTCAATAATTTGTATTCTTACAGACGCAGGCATTAATTACGTTTTTTTTTTTTTTTACTACTACAACCTGGATAAGTAACTATGAAACTGCATGGATTTATGTATAGATAAATTGCTGTTTTTGTTATAATGACATTTCCTATGACATTCTATATAAATCTGGGACGAATGTGTCAGGGCTTCTATACATACTTGTTTTTTAATAATATCATGGGACTAAATACAGGATAAACCATTGTAACTGGAAATGTTTTAGGATTTATTTACTTTGAGAGTAACCACTGTGCTTGACATGTTCATCCCAAAGACATCAAAAACTTTCTCAATTACATTTAAATAAAGTAATAATAAAAGATTTAATAAACTGCATACCTCCAGTAGACCTTGAAGTCTTCAGAATAACTGAAATGTTGTAATATGTTATATGATAATGACTCACATGATTCCTGGAAGGTTTCTGCATGCTTTAACTACTGTGAAACCGCTTTGTACTGACACTGATTTTATACCTAGACAAAGTACATGTTCTGGACTGGGTTTAGTTTGGAGTTTTTTTTGATATCTTGAAGTTTAAATTCAAACTCCTACAATGTATCAGTCAGTGTCTTTGTCAAAAGGATGTATGACCTATATGCATATTAGGTGCATCCCAATTTGCATACTTATGCACTATTCTATGCCGATTTGTAGTATAAATAGCCTGATTAGTATGTTGTTCACACTGAAAATTCCAAAAAGAATAAGTGCACTTTAAATACCCAGATGATGCATTTAATTAATCGAAGAAATGAAGTGTGAAGTGTTGGACACTCAAGTGTCACAGCTTTAATTATGTTGTGGAGGGGGGAGGGGCTATCAGACGACAACAAAATAACTCTATAAATCTCATTTAGTATACAGTTGAGTACATAGTGCATAAGTACATAATGTGTCATTTGGGACACAACTAATGTGTTCTGTAAAGGAAATACTGATTGGCATTTACTTCTATTGTAAATATATATATATATATATATATTAGTAAAAAAAAAATATTTGATGCAGAAGTTAAATTACTTGGTTCCTGGAAACAATATAATGAAAGAGATTTACATTTTCAATATACTAAAAGAGAACGGGGGCTGTTAAACAACAAAATGGTCACCATAAAAGTATAGTCTACATTACTCATGTGCCTTTAGTCTTTTTTTAATATCGCTTCAGAGGTCTTGGAATAACACACAAGTCATACGGACTACTTTTATGATGCTTCTTTGTTATTTCAGAGCTGGACTCCAGCCCCTTTCACTTTTATTACATTGAAAACAGCAGCAAGGATTCACCTTTTGTGTTCCACTGAAGGAAAAAAAAAACGAAGGCACATGGGTTTGAAATGACACGAAGGCAAGTAAATGATGACAATCTTCATTTTTGGGTGAACTATTACTTTAATCTCTGAAGAAATAACAGGCTTAAGGTTCATACAATTTATTTCATAGTATTTTTCAATGGTTTACATGACTCTGTAGCAAAATACTGCAATATGAAATGAATATTAAATGGCCTACACTCTGTACGCACTTGTAAGCAATAAATTAATATAACTGTATACAAATAGTTTCTAAATGATTTGGGCTCTTTATGGTTTTTTTGTATTCAACACAGAAATGTATAAGAGCTACACAGCAGGAAATACGACTATAAACCTTCACAAGCTCTAGAACAAATTAAACACAAAAACAAAAATTCAGGATGACTATCAATTGAAATAACACTTGAAACTTTTGTGTGTGTCCATGAAAGCAATTTCAGATTTGATCTGGCGACCAAAGTGTAGTAACGTGTTGATCGACTCCATATTTAACATGTCTCGCCCTCTCGTTTTCTCCTCTCAGGGGGAACTTTCAATTCGCCCTTCCATCTGAAAAACAAAGAAGAAAATATTAATTATGCTTCAGAAAGACACAAACTCATAAAATGTAAAGGAATCCCAATTCTTTAATAATTTCAATAAGGAGACAAGACGTGACTTTGAAATAGAATAATAGTTGTGAAATTAACAACTTGTGCAATAGAGCTCATAACATTTAATGCAAAACCTTGAATTGATGGAAATTAAAACACAAAAGGAAAGCATTACAAGCATAAGTTCTCATGAACAATATGACTTTTCCACGATTTCAAAAGGTTAAAAAAAGAGAATTTGTTAGATGAAATTAACACTGTTTACAGGTGAAGCTTTTTCCACCGCTGTCAGTAGAAAATCACACAATACAAATATAAAAAAGCACTTCTCCAGCGCAGCGGCGTCCGAGTACAAACCGGCTTTTAGCTCATGGACTACAGGAAATTACAGCTACACGAGCTACAAATAAAGAAAAGCAAGCATTACAGGTAAGATTAGAAGTGCATATTAACACTGGAAAGTCCAGAGAAAGCCGTATCCTTCAAAAAGTGAACAGTTAATTTTATTCCGGCTCTCGTCATATTTTACCATTACTTGATGGTGCCTGTAAAAAATGGCATTAAATTATAATATATCATTACATAAAACCAATCCCAAGAAGTTTTAAGAGGAAAGCAAAAACAAAAGAGAAGATAAAAGCTTGACGTGTCCTTTTTATGTTTTTTTTTTGTTGCTGTAGTTGCTGTTGCTTTTTTTGTTTGTTTTTTTACAATTCGTATACAGGATGTTGGAAGACCATACCAAATGGGAGCATTCGAGAGCGTACGCCTCTCGTACCCTGTCCGCATTGAGCGGGCCTGAGACAATCGGGAAGTCAGCTCATGGCCTGCAAGGAAGTCCCCGCTGGCAGGTACAAACAAGGTATATGTCAGAGTTAGGAGACAACATTCTTCGGTTTTCTTTCCTTGTAATTCCATATTTTCTGGTACCCATTTAGCAGTACTGTACCTGTTAATTTTTACAGTTACAAAATGGCAAGAAACAGCCAAAAGCCAGCTGTTACATTACTGCCAAAAGTCTCTATGTTACCACTACTGTAAAGCACTTCAGGGTGCTGTGAAACTTTAAAGAAAAACAAAAATTAAGCAATGTACATTACAAAAAGATCAAATCGTGATGATTTAGAAAACTAAAGATGCATCACTGTGAGCAACGCAACAACATACCTGCACGTTTCTGGTGGAGTTTAAACGTTAATACGGCTTGTAACTGTTTTGATGGCCGCCTCGCCTCGGGGATTTGCCGTAGCCGCTCTGCTGATCTAGAGTTGGGAGCACAAAACAGAAACAACGCAAATGTCTACGGTTAAACGTGTTGGTGGTGTACGGTCGCTCCAGAAGATCTCTGAGAAAGGCACATCATAGAAAACATTGCCATTTTGGTTTTAGAGCCAATTCTGTGATACTTGCGAGATACTTACGTTAATTGTTTTGAAAATACTGTATTCTGAAAATATGGTGAGAGACAAAAATTTGTGGAGTAAATGGGTGAATGTTTGAAAACTGTTTATTTTCTTCTAAAAACGACCACTGTCCAGTGGTCGTTTTTTGCATGGCCTACAGATTTACATGTTCAGTTACTATCCAATGGATTCAAAGGCACTTTGACAAATGTGTTTTGAAGCTAAGACATCCCTTTCTATATTTAGCACCATAGTTATTATAATACATATGTACAATATAGCTTTGTGCAAGCAAGCCTTCCCTGTAAGACAAAAAGCAACTGCAGCAATGTTCTAGAGTTTTCTCTCAAAGCGTAAGGCATATATCATACAAGCATGTGCATTCTGCTCAGATAATTTAGTGCACAATTGTCATAGTCCGGGTAGAGTACCGACAATCCACGATACAATATATCCTTAGTTTTTTCATCTGTGCGTTCACAAACAGTATTACATACTGCTGTAGTCACCATATCCGTAGTAGTTGTTGTAACCCGAGTAATCATAGCCCCCGTATCCACCATAGCCTTGATTGTTGTAGCCATAGTTCCCGTAATTTCCATAACCTTGATTCCAGTAGTTTCCGTATCCCTGGTTCCAATTCT

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU481688 True 222 lncRNA 0.36 1 2250825 2251046

Expression



Co-expression Network


Homologous


species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) LOC100305243 LOC106562364 misc NC_048576.1 CM023230.2 16634735 ~ 16638951 (-)
tiger barb (Puntius tetrazona) si:ch73-234b20.5 si:ch73-234b20.5,LOC107702596,LOC107558257,LOC107653492,LOC107573851,LOC107732123,LOC108440734 misc NC_056708.1 CM032077.1 3596606 ~ 3604216 (+)