XLOC_013439 (AL935295.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_013439
gene name AL935295.2
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 24741499 ~ 24746401 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00026530
atgctcgctatcccaaggttcattgcgatcccaaggttcactgcggttttccacaagatgcagaaacttttgacatatgaattcattttgactaaggaactcttcacagcactgcagctaaacagtcacaacctcacagagctgcacaactgccccactcagatcagtgttgaagctggaacctcatcttgtgtacagcaaaggcagagctgaaaattcactgtttgtcttgtattgtgtgtggcaaaacctggaataacacatgggagccctccaggaattcctgacactttacgcccaagtctcctcatgctaaccggattgcaatatgacagtctaatcagcataaacacctggactcaccaagcacactttggttctcagtgttttgtaaaaatagtttttgctattcttcagtaaatacttgaatatgttttgaacttattctacttttgatgtttaagttcagaaagttgttattataaacataatttgcatttgtcatgaacttgacttcttgttattgtgaaagctgtttattatgatggcatttccaaaggcatcatttgaaaagattttttgcagtgcagttttacttgagcttgacataccagatgtatgacatgaataaatatcacaaaataaatataataataataatacaaaatatacatttccttcaattataattgtttttaatcatttatatatgtatggtaatatattattgcattaaaaacttataaaatatatatttttggttaaaatatatatttttgcatttttgtgtgatttttattatttatttttatttgtggcattataaataaattataaatgtttcattaaaaatttattgtgtttatttgcattctcgtttacaatgaactactatttatactatttaatgggcactatatttgtcatttaagtttgacatatatttatatttgtatacctaCATGATGCAGGGTTTAGTTGCAGCAAATGcttgaaatgttttcaaacatgaagcttttttattattttattattcgtttcaaattaagtatactgcctatgatctggttttactatgatcattttgcacatcaggttacccccacaaagtaatctcacggtaaatatacatttgtatttttaataagacaataaataacatgtaatattaatacacattttgatatttaagttatattataaggtTATAATCAACCTTCAGCCGGAAGATTACCAAATAGAGACAAAGTGTGACGTAGATTGCGACGTTGTGATTGGACTATAACTtcaaagccaaattaaaagatccttcgtgttgctaactatgttttgctaactttgccactttactaacagtgtcctttatcaatgagttatcgctgtgttttaaatagttaacgattaaccaagatcgtaaccctaaacttaaccctaacTACACCTTTCAAGGAACTACAATTTGTAGCGCCATGTCTTTCCCCTCCCATCTCTACAGCGACaaaggattgtgggtaatgtagtttaaggcctttttgtaataaaatggaacagatacaaattttaatgaactaaagactatctgaataaggtcattgtgcatatatttatgacatatatgaaagccaggcataaatttgttattttacaatgagtattttttaaacagcttttattgacttgatcagtatatatcagactattatatccaacattatttattgaacatagcataggtaatagtcttgctgatattctctcactcatttctcgtttgaaatgtgaatactttttccttttctacggggctctactcatcccctttgagtaaaagggcagttaacctatgtagatgtattatcttcaacatggacaagaaattgtattgtcacatgtacagttgtggtaaaaaaaaaaaaaaagctgtaaaaataagctaaacattagtatcctctttaattacaagttattagcaatagtgatctatgttcatcacaaatgttatgagttcagaataatatgtgtggatgtaattctgtaagtgtgtttcattaatggtcatcatgtgatatttaattgttttcactttatttgaaatatggataaaagctcttttaaaatatgtaaatgtttataaataaaacctttttaaagacatgtatttgtttaaaaaccactctttttctgattatttttactttctaaatcttcaactgtttgtgtaacagtatgatttgatgacaatggatgaacttgtgtttaataatgattccacataatgtctttgtcctgcatgtgggttaatttgttaattattttctttatgatcaaATGGTTGTAAGATTTGCTGCATTGTAAGAATCATGAAAATATTGAGAAATGAGGTAACAATGATGAAAAGATATCTTTTCAAATGCTGCGAATAGTTCAAACctccaaatgattaaaaatacatagccattaaccaacaaaataaaaatgcaaacatttaaattatctaaactagaagtaaaatagttc
>TCONS_00026531
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>TCONS_00026971
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Function

GO:

id name namespace
GO:0044464 obsolete cell part cellular_component
GO:0005623 obsolete cell cellular_component

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117663

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00026530 False 2517 lncRNA 0.30 4 24741499 24746319
TCONS_00026531 False 4034 lncRNA 0.30 2 24741499 24746401
TCONS_00026971 True 576 lncRNA 0.37 3 24744790 24746333

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_013437 NA coding downstream 179615 24497624 ~ 24561884 (-)
XLOC_013435 si:ch211-147m20.3 coding downstream 264589 24273428 ~ 24476910 (-)
XLOC_013436 CU855551.1 coding downstream 425200 24316181 ~ 24316299 (-)
XLOC_013434 NA coding downstream 657663 24047486 ~ 24083836 (-)
XLOC_013433 NA coding downstream 856845 23877479 ~ 23884654 (-)
XLOC_013440 chd2 coding upstream 187072 24933473 ~ 24989580 (-)
XLOC_013441 NA coding upstream 243867 24990268 ~ 24997070 (-)
XLOC_013442 st8sia2 coding upstream 281094 25027495 ~ 25051846 (-)
XLOC_013443 slco3a1 coding upstream 327583 25073984 ~ 25177230 (-)
XLOC_013444 BX901968.2 coding upstream 412260 25158661 ~ 25158777 (-)
XLOC_013384 BX323829.1 misc downstream 5199268 19542102 ~ 19542231 (-)
XLOC_013445 NA non-coding upstream 434138 25180539 ~ 25225436 (-)
XLOC_013448 CR450716.1 non-coding upstream 769492 25515893 ~ 25516631 (-)
XLOC_013450 NA non-coding upstream 950874 25697275 ~ 25745621 (-)

Expression


Co-expression Network