G685182


Basic Information

Item Value
gene id G685182
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01180000
NCBI id null
chromosome length 11503085
location 10727816 ~ 10740749 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU806589
GATGTAAATCAAGCTAAAGAAGGACATTTTTGGATGTATTAACACATGTCGCTATCATCAGATATTTACTTGTGAATACTATCTATCATTGCATTTTCTCAATCAGGAAGAATCATCTTACTACCACACAATCTTGTGATAGTGAAGGATGAATAGTGGCTTCCATGCAGGTCTAAAGATTCAGCTGGTGCTGTACTGTATGCCCTAAAAGCAGTGCTGCCTTTCCAAGACTATTTTAAGCCTCTATATGGTGTCTTTGTAAAAATAATATCAACATCACAGGGACTACTACTGAAATAAATGGGCATTTGTATTGGGGTCAATGTTTTTCAACTTTGAAAGGTTGAGTTTCCGGCAGGAAAACACTTACTGAGAGGAAAGTAGAGAACATGTGCATTGGATAGTAGATAAACTTTTATTAATGCTTTTGTTGCAGAAGGAAACAGTTTTCCATTTTGGAGAACTACATTTACAGCCATTTATTCTGTATTATTTATGTGTTTTCTCTGACCCCACCCTCCTTTTTATTTTTGAGATGAGACAGCAAAAATGCCTATTTGTTCCACAAGAGAAACAGAGGATGAGCAGGGAAGCTAATCTAATTTCACATTAATTTCAATTAGGATTTTTCTTTTTTCTTTTGCACATTGTACTGGGTTACCTGGTGTCCATCTGTTTTCTTGGTATTATTGAAGTATTACAAGGCAAAAATAGATGGTATCTTTCCTCCCCCAACAAACATCTTAAATGCTTATTTCTTCATTCAGGTATATTCAGTCTTTCTTTATACAGTCCAACACATCCAAAAAACCTTTATGCAAATTATAGCTCCAAGCTATTTTATTTTCTCCCATGGATGGTTTGCTTAAATAACTAAATGCAGTAATTAGCATGGAATTGTTTTTCTACAGATATTTGTTCCCCACTATTAGATGTGTTAAATTACATTGCTGTTCCAATACTAAGTGTATACATTCCTGTAAATGATATTGGGTAAACAAAGAATTGGCTATGTCTGCTGTAATTGTTGTGCCCCAGTCTGAATGCTAAGTCTGTTACTAATGCTAACATTCAGTACTGTTAGACAGGATGAAGTCCAAACTCTCTCAGAAAAAAAATGTATGGTACAAAGCTGTCACATAATAAAAGACAGACATGGATGGATTTCTCTGTGTGTCCAAACCTGTGACCCCAGCAAGATTCTCTCACAGTGGCACAGCTCTATCTCTCTGTAAAGTCCATGATTTGGCAGCCTTTTCATCAGGGTCCACTCACAGTGTAGCCCACACACCAGATCTGCTGCTCCAGATGTAGAGCCAGATGTGAATGTCTATAGTGTATACCATAAGTGGATTGGGAAAGTGAGCCTGACAGTCAATAAGCCTTACTGCATGCTTCAATTTAAGACAAAATGCACAAAAATAAATACCCAGCAAGGTTTGAAGTCATTTTCATGTTCTCCATCATTGTCCCTCCTCAAAGTCTTTGTCCATAAGGGGCTGTTCATAGAGGATGTGGTCTTGCATTTCATCTGTGCTGTTTTTTAATGTTTTGGTAGGTATTTAGGTCTACATAGGTAGCAACTCTGCATAGCACACAAATGCACCACACAAAAGATAATTGATTATAATAGAGTTTTATGTTTGCATGTTGCTAAGCTAAGGATGTGGTACTCTAGTAAGAAAAATAATCATAGCACACACAAAATAGTGCAATGCAAAGGAGACACGATAACTGATTCCAGTAGAGTTCGTTGATAGCATGTTGCTAAGCTAAGGATGTGATGCTCTAAAGACCCATTCACACCAAGACTGACAACTATATTATCATCCAATAATAGCACACTGCAGTTATGTCAGTTGCTGCTTTAAATGCTCAAGCTCTTTAAAATCAGTGGATTCTGATTGTCAGTTTTTTTTTTCTTTTATTATTGAGCAGCTGAAAAAAATCATTCTGAAAGTGATTCCAATTATATTGTTCCTCTGTATCTTTAGCATAGTTGTGGTGTGGACTTTGCTATTATCTTGATTATTAAAACTTTATAGTTATTGTTAATTACCGTCCTTGATGTGAATAGGACTTAAATCATGGCACACAAAAAATACTGCATTTTTAATTGGACTTTGCTTTATCTGTCATATTGTATCATCATTGCAATGCATTCAAGCCTTTTAAATAAAGTATACATGCAAACTTTATTAAAATGTGGTTATACATAAGGTAGCATAATGAAATTCTCTATGTTTTGGAACTTTTCGCATTTTAAGTGTACTGTACATTAGGGGTGGGAATCGCAGGGTATCTCACGATACGATTATGATACTTGGCTCACGATAACGATAATATCGCGATTCAGCGATAATTGATATATTGCGAGACAATCCTATAATGATACATCACGATATCTGTCTAACTATGACACAAAATGCCAGTGAAAAGGTTAAGTGCAGGTTTTCTCTCTTTATCCGCAAAACGGATAAATTCGATCTTCGGTTCCCGCGCTCTTTGCAGATTTAATGGAGTTCACGTCACCGAAAGCAACAAATATAAGGTGCATTTTATTGACCATCAGCTAATTTTAAAATCAAGACTGCAATAGGAGAGAGCGGCAACAGCACTGGTAAGGTCTCGTTACTTTTAATGAAGGTAATTGTGTGTTACGCGTCTGCAGCTTACTTTCACTTTCATATGCGGCAGTTTGCGCGTCAGCTTGCTGAAGAGATGCTCAGCTGTTCATCTGCTGCAATGCGTGATGCAGTAGCGCTGTCATATCTGACTCACACGTTTCAGTTTTAGTGTTTTTGGGAGAAGTAAAATCTGCATATGTGGTTTCAACAACCAGATGCATTTAGACTGATGCATAGTCAATTTTGACTGGAATGCGTCCCAGACCACCTCCTGAAGTGGTTTGAGCGATCGGATTTAAATCCATCTCAAATGCGTTTCGGAGGGCTTTTAGACCTGGTCTGATCTAGCTATCCGATCAGAGAAAATACATAAAGTGACCAGGTGAAGAACGTCAAAGATGTCTACGTTTGTCACATCAATGGTATAATAGTGCATCAAGACTTGAACTTAAATGTGGCTGGGGCATCTATTTTACTCACACTGCTGTATGCCATCCTGTTAAAACCTCTTTTTCTTAGGCTAGTTAACCTATGTTCACATTTCCCTCATTCATGTGTTGAGCACCGCCTTGAAGTAGCGACGCTTTGAGCAGAGAAATCTATTTATAGCGCCTTATTTTATTAATTAAAATATCGATATTTGGCGCAGCGTATCGATTCTCGTATCACACAGAGAAGGACGACGATATATCACCATATCGATATTTTGTCTCACCCCTACTGTACATGATGCCTTAATGCTGTCTACAGTGCTAACTAGGTTTTGGGACAGAGGAAAAAAATAGTTCAACTCAGATTAGTCTGGAGACACTTGCAAGATTAGTATATTCATATATGGACAAGCATATTTAGTGTTTATAACAATGGTGATTTTAGATTTAGATTGAGTCCTGTGTGAGCAGTCTTTGCTCTCAGTCTTCATTTAGTAGTTAAGAGGTAAACCACTCCAGTGCCACTCCATACACTTAATAGCAGATTTCTCTTGTACAGAAATCCATCTTCAGACCCCGATTAAATGTAATTTTACAGTCAGTACTTGGAAAGGTTTGCTTTATTCAGGGCTATTCAGCTTAAGATGGCTCCCTGGTAGGGTGTCTGGCTAACCCCCAAATCCATTGCCTTGACAACAGTATCTCACACCAGTCACAGAATGTCTGCCAAGCTAAACTCAAATAAATAAGAGCTACTAGCAGGGGCAAACTGCAGGAGCGTTCCATCTGTGTTTTGTTAATTGATACTCTTAGTTAGTGAGGATTAACAATCGGATGACCACATCCTCCCCACCTTGAGGATGGTCTTGGACCAGTTTCAATAACTCAACTATATAGTCAAGTTTAGTGTCTATATATCTCGCCTGTCTCAGGACTACTTTCTTAGAGTCTCTCTTAAAAAGACCCATTTTTAATTCATATAATCTTTGGCACCTCATTACCTCGAAAAGTGTTAACAGTAATGTTCCCTGCGCCTCAACTGAAAGAATCTAATTTTACGCAAGTTTTGTGACTTCCTCTCATTAATGGAGTAGTCTTGAGTACATCCTGGGGGTTTTGTTATACAATGAAACATGGGCTTTATATTGAAGTGCTGATTGGTTTGTAGGGGATGCTTGTACCTGTCACTCAGACAAATGACTTGTCTCCTCTGGATCAGTCTGATGCACGTTATAGCCCATTCACTGCATCTGATAATGCCCTTGAAACTACCAGCCATCAGCTTTAATGCAGCGTGCGAAAAACTAGCAGGCATTTAAGTGTGTGTTCGTACATGTTTGTGTGTTTAATGTAAATGTTTTTTGGAGGGGTGTGTAGATCTGAAAGATCTTCCAAGTGGGAAGGTTCTGTAGAAATATGTTGTGACAAACACTTCCATGCAGAAATGGTTGTTTTGTGCATGAAGCACACTGATGTGACAGATTATGTGAGCTGTAGGTCATGATTAGGCCAATGGTCTAATAAACTGTAATCACATGCGAGGAGCTCAAGGAGTCACAATATCCGTAATGCTGTCATTTATAGACTAGGTTGAGGTCACTGACTGACACGGGGGCTGTTCACCAGCGGGAGATTATGGGAGTCATTTACCTTGAGCTTGACGGTGCCAGTGGTTTAACCTAAAGCCTCCAATCCAATTAGAGCCGGATGCTCAGCCTAGATCTGCCACACACAGACCTCTCGGTGACCTACATATTATGTGCTGTGCAGGGTTATGTTAATTTTAAATCTAATGTGATTAAATGCATCTACGGCATACAGGACTAACTGCAGGTGTGTTTGAGCATTTGCCAGTCATTCTGCATAGTTACTGGCAGTCACACAGCAGCAAAGTGCAGTTGTCAGACTTTACAGTTCGGTTTTAAACAGGAGTAAAATGTTC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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU806589 True 12704 lncRNA 0.36 3 10727816 10740749

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01180000_10662835_10678837 NA coding upstream 48348 10662052 ~ 10681213 (+)
CI01180000_10529410_10533314 CCDC172 coding upstream 194153 10529410 ~ 10533663 (+)
CI01180000_10484149_10494886 NA coding upstream 232454 10483725 ~ 10495362 (+)
CI01180000_10473976_10478167 NA coding upstream 249553 10473184 ~ 10478263 (+)
CI01180000_10428368_10431006 NA coding upstream 296410 10428368 ~ 10431406 (+)
CI01180000_10921304_10932428 NA coding downstream 179655 10920404 ~ 10932543 (+)
CI01180000_10964009_10980799 NA coding downstream 223260 10964009 ~ 10981104 (+)
CI01180000_11058495_11071337 NA coding downstream 317531 11058280 ~ 11071439 (+)
CI01180000_11103142_11105610 NA coding downstream 362393 11103142 ~ 11105838 (+)
CI01180000_11153499_11155781 NA coding downstream 412434 11153183 ~ 11157626 (+)
G685351 NA non-coding upstream 117682 10609908 ~ 10610134 (+)
G685350 NA non-coding upstream 117941 10609673 ~ 10609875 (+)
G685335 NA non-coding upstream 135403 10590754 ~ 10592413 (+)
G685308 NA non-coding upstream 171841 10555481 ~ 10555975 (+)
G685189 NA non-coding downstream 1152 10741901 ~ 10768236 (+)
G685184 NA non-coding downstream 51325 10792074 ~ 10796291 (+)
G685186 NA non-coding downstream 57700 10798449 ~ 10819873 (+)
G685177 NA non-coding downstream 291832 11032581 ~ 11076280 (+)
G685421 NA non-coding downstream 345687 11086436 ~ 11086680 (+)
CI01180000_09036547_09038313 MGST3B other upstream 1688924 9035736 ~ 9038892 (+)
G682232 NA other upstream 2358881 8368185 ~ 8368935 (+)
CI01180000_07694615_07695428 MRPL14 other upstream 3032149 7694529 ~ 7695667 (+)
CI01180000_07403482_07412752 HELLS other upstream 3258211 7403482 ~ 7413190 (+)
G681667 NA other upstream 4068270 6655846 ~ 6659546 (+)
G685188 NA other downstream 79237 10819986 ~ 10866176 (+)
G685443 NA other downstream 392983 11133732 ~ 11141722 (+)

Expression


Co-expression Network