XLOC_016058 (CU861459.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_016058
gene name CU861459.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 731491 ~ 732864 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00031730
tgtgtataaatgtatatatgtatataaatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatatgtctgtgtgtgtgtatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatatatgtctgtgtgtgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgtctgtgtgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtatatatatatatgtgtgtgtgtgtatatatgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatatgtctgtgtgtatatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtacatatatatgtgtgtgtgtgtatatatatatatgtgtgtgtatgtgtgtatatatatatatgtctgtgtgtgtgtgtgtatatgtgtatatatatatatatatgtctgtgtgtgtgtatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcatatgtctgtgtgtatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtatatatatatgtctgtgtgtgtgtgtatatatatatgtgtgtgtatatctatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtacatatatatgtgtgtgtgtgtatatatatatgtgtgtgtatgtgtgtatatatatgtctgtgtgtgtgtatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtatatgtgtatatatatatatatatatatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtatatatatatatatatatgtgtgtgtatgtatatatgactttatattctatactggacattttttctgttcagtgatgagacttagcagagtcagagcgcactgtcctcatcacatcagtcaacatcaagacatgatcagattttattgagctcaaataagcaaaatctagaggccttcacctttcatagagacacttctgatgccaaatcatcaactagaagaccaGTTATTACATGTGCTCCCAAAACTTGGACAggagacaagacttttatcaggtagtgtttG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000098888

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00031730 True 1374 mRNA 0.29 1 731491 732864

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_016057 NA coding downstream 1261 728660 ~ 730230 (-)
XLOC_016056 foxq1a coding downstream 9321 720781 ~ 722170 (-)
XLOC_016055 foxf2a coding downstream 15065 713080 ~ 716426 (-)
XLOC_016054 ftr93 coding downstream 24339 696244 ~ 707152 (-)
XLOC_016053 foxc1a coding downstream 42444 686873 ~ 689047 (-)
XLOC_016059 irf4a coding upstream 121580 854444 ~ 879800 (-)
XLOC_016060 dusp22b coding upstream 149090 881954 ~ 898899 (-)
XLOC_016061 NA coding upstream 198204 931068 ~ 1195912 (-)
XLOC_016062 si:ch211-241e1.3 coding upstream 211477 944341 ~ 985417 (-)
XLOC_016063 NA coding upstream 385888 1118752 ~ 1121302 (-)
XLOC_016051 NA non-coding downstream 116635 552481 ~ 614856 (-)
XLOC_016052 CABZ01117963.1 non-coding downstream 147924 583451 ~ 583567 (-)
XLOC_016050 NA non-coding downstream 199047 492923 ~ 532444 (-)
XLOC_016049 NA non-coding downstream 272580 405330 ~ 458911 (-)
XLOC_016067 NA non-coding upstream 582302 1315166 ~ 1331542 (-)
XLOC_016069 NA non-coding upstream 672647 1405511 ~ 1406153 (-)
XLOC_016076 NA non-coding upstream 912695 1645559 ~ 1647983 (-)

Expression


Co-expression Network