XLOC_016087 (guk1a)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_016087
gene name guk1a
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 3026802 ~ 3045863 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00031763
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Function

symbol description
guk1a Predicted to enable guanylate kinase activity. Predicted to act upstream of or within phosphorylation and purine nucleotide metabolic process. Predicted to be active in cytosol. Is expressed in cardiovascular system; neural tube; polster; spinal cord; and yolk syncytial layer. Orthologous to human GUK1 (guanylate kinase 1).

GO:

id name namespace
GO:0006163 purine nucleotide metabolic process biological_process
GO:0005829 cytosol cellular_component
GO:0004385 guanylate kinase activity molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040625-130 Predicted to enable guanylate kinase activity. Predicted to act upstream of or within phosphorylation and purine nucleotide metabolic process. Predicted to be active in cytosol. Is expressed in cardiovascular system; neural tube; polster; spinal cord; and yolk syncytial layer. Orthologous to human GUK1 (guanylate kinase 1).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000030340

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00031763 False 3344 mRNA 0.36 8 3026802 3038904
TCONS_00031764 False 3428 mRNA 0.36 8 3026802 3044947
TCONS_00031765 True 3391 mRNA 0.36 8 3026802 3045863

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_016086 si:ch1073-82l19.1 coding downstream 68832 2927463 ~ 2957970 (-)
XLOC_016085 usp14 coding downstream 213543 2790573 ~ 2813259 (-)
XLOC_016084 serbp1b coding downstream 384326 2630188 ~ 2642476 (-)
XLOC_016083 CABZ01088149.1 coding downstream 402819 2621400 ~ 2623983 (-)
XLOC_016082 NA coding downstream 532502 2485435 ~ 2494300 (-)
XLOC_016088 arf1 coding upstream 16874 3062737 ~ 3077027 (-)
XLOC_016089 wnt3a coding upstream 60374 3106237 ~ 3158919 (-)
XLOC_016090 FO818692.1 coding upstream 80095 3125958 ~ 3126074 (-)
XLOC_016091 snap47 coding upstream 341527 3387390 ~ 3403793 (-)
XLOC_016092 CU633991.2 coding upstream 366213 3412076 ~ 3416207 (-)
XLOC_016081 dre-mir-460 non-coding downstream 725368 2301358 ~ 2301434 (-)
XLOC_016079 CU929426.1 non-coding downstream 854163 2171371 ~ 2172639 (-)
XLOC_016076 NA non-coding downstream 1378819 1645559 ~ 1647983 (-)
XLOC_016069 NA non-coding downstream 1620649 1405511 ~ 1406153 (-)
XLOC_016095 NA non-coding upstream 473720 3519583 ~ 3520166 (-)
XLOC_016100 NA non-coding upstream 1068148 4114011 ~ 4118815 (-)
XLOC_016102 FO704866.1 non-coding upstream 1525150 4571013 ~ 4571103 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000098_00088670_00090682 KGUA, GUK1A, GUK1 coding CI01000098 null 88670 ~ 90711 (+)