XLOC_016193 (BX323564.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_016193
gene name BX323564.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 10597810 ~ 10600950 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00031946
ATCAAATGTCACATTCTAGCAAATGGGAATTATTTAAGTTTAAAGTTAGACAGTCAGCCATATATTTTAGTAAACAAGTTAAAAACAATAACTTGAATAAGGAACGGTCATTGATGAAcgagttaaatatttatttaaaaaaagagaatctAACAGAGGATGAAAAAGTTAGATTAGAAACTATAAAATCTGAAATTGACCAAATTTACGTTGATACTGCAAAAGGTGCTTTTATTCGTTCAAGAGCCAAATGGTtagaaaaaggagaaaaaaatacaagTTACTTTTTTTCACTAGAAAAGCGGAATTATAAAAGGCAAATGATTTCCTCACTTAAAATTGATGATGTTATTACTTCAAATCCTAAGTTAATTTCTACATATGTAGAGTCCTTTTATTCCCAATTATATAAATCTGTATTTCAAAAGGataaatgttataatttttttgaatCTGTTAAATCTTCTGTCTCTCCTATTTCACCTCAATTTAAAGATACTTGCGAAGAAAATCTGAATAAGCTTGAGATGGAAATAGCATTACGTTCAATGAAACAAAATAAGTCTCCAGGCTCAGATGGTCTTTCAGTGGAGTTCTATCTGCATTTTTGGAATATAATTGAAAATCCTTTATTTGAAATGTATAAGGAATCTATTGAGCTAAAGGAGTTACCAACCTCTTTGAAACAAGGATTAATAACCTTGCTTCCTAAACCTAATAAAGACCTTATGATTTTAGACAACTGGCGCCCAATAACACTACTTAATGTAGATTATAAATTATTATCTTTGATTTATGCAAAACGCTTAAAGGAAGGTCTAAATGAAATTATTAGCGAGTATCAAACTGGTTTCATGGCTGGGCGACACATAAGTTGGAATATTAGATTGATTCTGGATTTGTTAGATTATTCTAATTTGATTGAGTCTGAAGCATTACTACTTTTTCTGGATTTTCATAAAGCTTTCGACACTATTGAGCACCAATTTATGTTTATGGCATTAAAATATTTCGGTTTTGGGGACAGGTTTATTTCTATTATGGAATTGTTTCATAGAGATATCAATAGCTCTATAAATTTATACCCAAATACTTCTAAAAGGTTCCCCATATGTAGAGGAGTCCGTCAAGGATGTCCTATTGCtccatttttatttcttcttGTTGTAGAGTTCCTGtccatttatgttttaaaatcatCAGCAATTCAAGGTATTaccatatttaataaagaaataaggatATCTCAACTTGCTGATGATACCGTTCTTTTTCTAAAAGATAAAGATCAGTTACCTGCAGCTTTGCAATTAGTAAATGATTTCTCTATTGCATCTGGATTAACCTTAAATGTGACAAAATGTGAAATTATATCACTTTATAATTCTGAagtaaaaagtttatttaatataCCTGTTAAAAAGACGGtaaaatatttaggaataagTATAACAAAAAATTTATCAGAGAGACAAGATTTAAATTTTtcccctaaaataaaaaaagctcaaGGTATATTTAATAACTGGCTTCAAAGGGATTTATCTATTATTGGAAGAGTTTTGTTGACTAAAGTAGAAGGAGTGTCTAGATTTGTTTACCCGGCTTTATCCCTTTTTGTTCAAGAtgctatttgtaaaaaaattaatgatttatttatacaatttgttTGGAGAAACAGACATCATCATTTAAGAAAGGAAGTAATTCAAGGGCCAAGAAAAGATGGGGGATTTgaacttttagatttttttgacttAAACTATACTTTTAAAGTTAAATGGCTTAGGAATTGTTTATTGAAAGCAGACTCAATTTGGTTTTTTATACCatataatattttcaaaaaggttGGAGGATTGCGTTTTTTACTAACATGTGATTATTCTGTTAAGAAACTACCAGTAACATTGTCCAATTTTTATCAACAAGCTCTTAAAGCATGGAAGCTGTGTTATGTGCACAATTTCTCACCCCATAAAGCAATTTTGTGGAATAATTCTTATATAACTGTTAATCGGAAATCTCTCTACCTACAAAATTGGACAGATAAAGGTATTTTTTTCTTATCTGATATTTTGGACCAATCAGCTAATTTACTTTCTTACAAAAATTTTATGGAAAGATGGTCATTCCCTATTAAATTTAAAGAATATAACTATGTAACAAAAGCCATCCCCTCTGGTTTGTTAATGCTAATGAGAAGTCATATGTCTTCATATAgtatcaatattaataaaaatgatccTGCTCTTTACTTAAATGGGGTAGACTTTTGTagtaaaaaatgtacaaacaaagttattagattaatattttgcAAAAATAGAGCATTACAACCTAGAGGAAAATTTTTTTGGAATGTATATTTCCATGATATTGTGTGGAAAAAAGCTTGGATGCTTCCTTTTCGTTTTTGCTTAGGTAACAAGTACAgggaattacatttaaaaattttacataACATTTATGTTTGTAATCAAACATTAACTAAATTTACGCAGACGGATGGAAACTGTTCATTTTGTTTACATCACCCAGAGACGTTGATTCATCTTTTTTATGAATGTGAATATTCAAAAAAATTTTGGGAAGATCTAtcattatatgtaaaaaaaaaatcaggttttagTTGCAATTTGACCCCCaaagacattattttttattttgtttcaaacaATTTATCTGTGGAATTTTTATTGAATCTTTTAATTTTGTTCGGTAAATTTCATATTCATAAATGCAGGTTAAATAACTCTAAACCTTGTTTAAAGGTTGCTATTGCAGACTTTCATTTGTATATAGAATCGCTCCAATATATTAAGAGcgaaaaatgtataaatacaattattgtggCAAAGGagcttaagttaattgattaGTACTCTTGCTGTTAATTGgttaagttaaaatattatcaatgTAAAGACCTCTATGTTGTATTGTctgtttcatttgtttaatttatgtaatttattttaatttatgttattaGTTACTTTTGAATTTTGGATGTCatgttaaaattgtatatttgttgttcaataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagtgtgtgacCATCGCTGACAGTAGCGGTATGTAAAGATCTCTCTGAAAGTA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000098557

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00031946 True 3141 mRNA 0.28 1 10597810 10600950

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_016192 ccdc18 coding downstream 33791 10467799 ~ 10564019 (-)
XLOC_016191 scinlb coding downstream 147026 10396579 ~ 10450784 (-)
XLOC_016190 wls coding downstream 211072 10342177 ~ 10386738 (-)
XLOC_016189 gng12a coding downstream 258997 10287133 ~ 10338813 (-)
XLOC_016188 dmbx1a coding downstream 405323 10183640 ~ 10192487 (-)
XLOC_016194 mtf2 coding upstream 2600 10603550 ~ 10641998 (-)
XLOC_016195 rpl5a coding upstream 86326 10687276 ~ 10703621 (-)
XLOC_016196 rpap2 coding upstream 189925 10790875 ~ 10821053 (-)
XLOC_016197 cdc7 coding upstream 262992 10863942 ~ 10877765 (-)
XLOC_016198 cdcp2 coding upstream 280218 10881168 ~ 10906854 (-)
XLOC_016181 BX470264.1 non-coding downstream 734422 9862833 ~ 9863388 (-)
XLOC_016178 NA non-coding downstream 849594 9746437 ~ 9748216 (-)
XLOC_016176 CU633992.1 non-coding downstream 909625 9688055 ~ 9688185 (-)
XLOC_016169 CR385076.1 non-coding downstream 1191135 9406558 ~ 9406675 (-)
XLOC_016165 NA non-coding downstream 1756926 8835922 ~ 8840884 (-)
XLOC_016199 CR450845.2 non-coding upstream 304112 10905062 ~ 10905179 (-)
XLOC_016204 BX901918.3 non-coding upstream 729774 11330724 ~ 11331316 (-)
XLOC_016205 BX901918.2 non-coding upstream 736090 11337040 ~ 11337983 (-)
XLOC_016208 NA non-coding upstream 956025 11556975 ~ 11558124 (-)
XLOC_016211 CT573467.1 non-coding upstream 1159876 11760826 ~ 11767204 (-)

Expression


Co-expression Network