XLOC_018505


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_018505
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 53804362 ~ 53810669 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00037013
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>TCONS_00037014
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00037013 False 5444 lncRNA 0.32 2 53804362 53810646
TCONS_00037014 True 5996 lncRNA 0.31 2 53804362 53810669

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_018504 slc25a29 coding downstream 179698 53600638 ~ 53624664 (-)
XLOC_018503 mettl24 coding downstream 368879 53408284 ~ 53435483 (-)
XLOC_018502 wasf1 coding downstream 438225 53300588 ~ 53366137 (-)
XLOC_018501 NA coding downstream 511847 53287873 ~ 53292515 (-)
XLOC_018500 CABZ01115113.1 coding downstream 627687 53169969 ~ 53176675 (-)
XLOC_018506 ppp2r5cb coding upstream 87524 53898193 ~ 53963515 (-)
XLOC_018507 hsp90aa1.2 coding upstream 156681 53967350 ~ 53981626 (-)
XLOC_018508 hsp90aa1.1 coding upstream 171648 53982317 ~ 54012043 (-)
XLOC_018509 si:dkey-241l7.6 coding upstream 202543 54013212 ~ 54034543 (-)
XLOC_018510 NA coding upstream 235509 54046178 ~ 54046733 (-)
XLOC_017928 CU539064.1 misc downstream 43750661 10053405 ~ 10053701 (-)
XLOC_018498 NA non-coding downstream 809023 52973860 ~ 52995339 (-)
XLOC_018493 CABZ01076171.1 non-coding downstream 977236 52827010 ~ 52827126 (-)
XLOC_018491 NA non-coding downstream 984746 52818807 ~ 52819616 (-)
XLOC_018489 BX005301.1 non-coding downstream 1113358 52686229 ~ 52691004 (-)
XLOC_018511 NA non-coding upstream 239763 54050432 ~ 54051494 (-)
XLOC_018513 NA non-coding upstream 338528 54149197 ~ 54154203 (-)
XLOC_018514 NA non-coding upstream 354216 54164885 ~ 54173299 (-)
XLOC_018520 NA non-coding upstream 460222 54270891 ~ 54271455 (-)

Expression


Co-expression Network