XLOC_018506 (ppp2r5cb)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_018506
gene name ppp2r5cb
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 53898193 ~ 53963515 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00036332
gattaaacacacacacaatcacacacacacacaaacacactgactgaCAGCGgctccacacacacacggacGGATGAGCCATGCCGAATAAAACCAAAAAAGACAAGgaTTCTCCGAAATCAGCAAAAGTGGGTAAAACTGCAGGACAGGAGAATTCAGAACATGAGCAGGCTTCGAATAAGAAGGGTGGGAACAGCGTCCCGCCGGCCACACAGCTGCTGAAGGGTAAGCAGTCTGGATCTCAGACTCCAGTCAAGAAAGAAAAGCGTCCGAACTCCTCCAGATTCAGCCTCAGCAACAACCGAGAGCTTCAGAAGCTGCCCGTTTTCACAGATGTTCCTCCCGCCGAGCAGGAGAAGTTATTCGTGCAGAAGTTGCGCCAGTGCTGCGTTCTCTTCGACTTCGTTTCCGACCCGCTGAGCGACCTGAAATGGAAAGAAGTAAAGCGTGCGGCGCTGAGCGAGATGGTGGAGTACATCACCCACAACCGGAACGTCATCACAGAACCCATCTATCCGGAGGTGGTGCACATGTTTGCAGTCAACATGTTCAGGACGTTACCGCCGTCATCCAACCCAACGGGAGCTGAGTTTGACCCAGAGGAGGATGAACCCACACTGGAAGCGGCCTGGCCTCACCTGCAGCTCGTCTATGAGTTTTTCCTGCGGTTTTTAGAGTCACCAGACTTTCAACCAAACATAGCCAAGAAATACATCGACCAGAAGTTTGTGTTGCAGCTTCTGGAGCTGTTTGACAGTGAAGACCCTCGAGAACGAGACTTTCTGAAGACGACGCTCCATCGCATCTACGGGAAGTTTCTGGGTCTCAGAGCGTACATCAGGAAACAGATCAATAACATTTTCTATAGGTTCATCTATGAAACAGAGCATCATAATGGAATAGCAGAACTACTGGAAATATTAGGAAGCATCATCAATGGCTTTGCCTTACCACTGAAAGAAGAGCACAAAATCTTccttttaaaagttttgttacCTTTGCATAAAGTGAAGTCCCTCAGTGTTTATCACCCACAGCTGGCTTACTGTGTggttcagtttctggagaagGACAGCACACTCACTGAGCCTGTGGTCATGGCTCTCCTAAAATACTGGCCCAAAACGCACAGTCCGAAAGAGGTGATGTTTCTGAACGAGCTGGAGGAGATCCTGGACGTCATCGAACCCTCAGAGTTTGTGAAGGTGATGGAGCCGCTGTTCAGACAGCTCGCCAAGTGTGTGTCCAGCCCACATTTCCAGGTAGCGGAGCGAGCGCTGTACTACTGGAATAATGAGTACATCATGAGTTTAATCAGCGATAACGCAGCCAAAATCCTGCCCATCATGTTCCCTTCACTCTACAGAAACTCCAAAACCCACTGGAATAAGACGATTCACGGGCTGATCTACAACGCTCTGAAGCTGTTTATGGAGATGAACCAGAAGCTGTTTGATGACTGCACACAGCAGTTCAGAGCCGAGAAAAACAAAGAGAAAGCCAAGTGGAAAGAGCGCGAGGAGGCCTGGATCAAGATCGAGAATCTCGCCAAATCAAACCCACAGTTTCTCATGTACATCGACGCCAATAGCCTCTGCAGTCCGATGGACATGGAGACTGATGGGCCGATGCTTGAAGACGTCCTGATGCTGAAGAAAACTGTAGAAGAAGAAGCCACTCCATTGCACAGAGAGCAGCGTAAGGAGCGTCCGCTGATGCGGCGTAAGTCTGAGCTTCCTCAGGACACGAGCACCGTGAAGGCGCTGGAAACACACCGGCGTGCAGAGGACATGATCGGCACTCAGGATGGCCACTAGAGGacacaagcacatgcacacacaaatacacacacacacacacacatctcaaacCAAACCCGGTGTTCTGACGATATGTGCTAAACCCTCAGAGTGTATCTAAATCTGTCATGTTTCATCTAAAAACACAGGGGCTCTATCACAACTTCTCTGCTTCAAATGTGTTAGAGTTAACTTCCACCTTAAATTAGAACTTCCACTTTGAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGAACTTCCACTTTGAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAAATTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTTGGACTTTTACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAATTTGGACTTCCACCTTAAATTTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAATTTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAAATTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAATTTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGTCTTCCACTTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTTCACTTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAAGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAAATTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAACTTAGGATTTCCACTTTAAATTAGGCATCCACTTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAATTAGGCATCCACCCTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTTCACATTAAATTAGGCATCCACCTTAAATTAGGACTTTCACTTTAAATTAGGCATCCACCCTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTTCACATTAAATTAGGCATCCACCTTAAATTTGGACATCCACCTTAAATTTGGACATCCACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTTGGACTTCCACCTTAAATTTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAATTTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGTCTTCCACTTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTTCACTTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAAGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAAATTGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAACTTAGGATTTCCACTTTAAATTAGGCATCCACTTTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTCCACTTTAAATTAGGCATCCACCCTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTTCACATTAAATTAGGCATCCACCTTAAATTAGGACTTTCACTTTAAATTAGGCATCCACCCTAAATTAGGACTTCCACCTTAAATTAGGACTTTCACATTAAATTAGGCATCCACCTTAAATTTGGACATCCACCTTAAATTTGGACATCCACCTTAAATTAGGACTTCCACCTTAGATAAGGATGTAAAATTAGGGGTAGCACACTTTGTCAGCTCTAAACATCTTTTGAAATGAGCTACCACTCTAATAATACGTGaacacattttcaacattttatgATGATTGACATTTGAAAGCTGACAGTGGGTTCTACTTGCTACCCCTGTTTTTACAGTACATCCTCATTTAAGCCGGCATTTATCTGTGATGGACATTTGGAAGCTGACATGATGTGCTACATGTTTTTACATCCTTATTTTACGGTAGAAGTTCATTCCAATAGCCATTTAGAGCTGACAAAATGTGCTCTCTCTGTTTTTACAACCTTATTTAAGGTGGTATTGAAACCTGATAGACTTTTGGAAGCTGTCAAAATGCGTTACTTCTGTTTTTACACCTTCATTTAAGGCAGTAGTCCTCATTTAAGGTAGAAATTTATTCCAATAGACACTTGAAGCTGACAGAATGTGCCAACCTGTGTTTTTACATCATTATTTAAGGTGGAAGTCCATTCCTATAGACATTTAGAGCTGACAAATTGTGCTCTCTCTGTTTTTACAACCTTATTTAAGGTGGTATTGAAACCTGATAGACTTTTGGAAGCTGTCAAAATGCATTACTTCTGTTTTTACACCTTCATTTAAGGCAGTAGTCCTCATTTAAGGTAGAAATTTATTCCAATAGACACTTGAAGCTGACAGAATGTGCCAACCTGTGTTTTTACATCATTATTTAAGGTGGAAGTCCATTCCTATAGACATTTAGAGCTGACAAATTGTGCTCTCTCTGTTTTTACAACCTTATTTAAGGTGGTATTGAAACCTGATAGACTTTTGGAAGCTGTCAAAATGCGTTACTTCTGTTTTTACACCTTCATTTAAGGCAGTAGTCCTCATTTAAGGTGGACATTTATTCCAATAGACACTTGAAGCTGACAGAATGTGCCAACCTGTGTTTTTACATCTTTATTTAAGGTGGTAGTTTATTCTGATTTACACGTTAAGTGGACAAAATGTGTTACAGCTGTTTTAACGTCTTTATTTTAAGGTGGTAGCTCAATCCAATAGACATTTAGAAGCAGTCAGTATGTCAATCTTCCAAATGTCAATCAGTTAGATACCACCTTAAATAAGGGTTAAAAAACTCTGATGGACATTTGGAAGTTGACAAAATGGGCTACTCCTGTTTTTTTACATCCTTATTTAAGGTGCTATACCTTATTTAAGGTGGTATTTAACTCTGATAGACATTTTGAAGCTGACAAAATGCGCTACCCCTGTTTTTACAGCCTTATTTAAGGCGGTAGTCCTCATTTAAGGTGGAAATTTATTCTGATTGACCTTTAAAGCTGACAAAATGTGCCAACCTGTGTTTTTACAACCTTATTTAAGGTAGTATTCAACTCGGATGGACATTTGGAAGCTGCCCAAATATGCTACTTCTGTTTTTTCTGTCTTCATTTAAGGTTGTAATCCTTATTTAAGGTGGTATGTAACTCTAATTGACATTTGGAAGCTGACAAAATGTGCTACTCCTGTTTTTACGTCCTTATTTAATGTGGCAGTCCTAATTTAAGGTGGTAGCCCCAATTTAAGGTG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>TCONS_00036333
TTTTCTGCTGAGAGTGTTTGTGCTAAAATGGAGGCTAGCAGCTCGATTTAGCCCGAATCGTTTGGACTTTTAGATGTTGACATGCTCTAAAGACGAGGCCAGGATGGTTCTGGATGCTCCCAGCGCAAACGGGCCCTTTCAGCCGGTGGCTCTGATGCACTTTAGAgATGTTCCTCCCGCCGAGCAGGAGAAGTTATTCGTGCAGAAGTTGCGCCAGTGCTGCGTTCTCTTCGACTTCGTTTCCGACCCGCTGAGCGACCTGAAATGGAAAGAAGTAAAGCGTGCGGCGCTGAGCGAGATGGTGGAGTACATCACCCACAACCGGAACGTCATCACAGAACCCATCTATCCGGAGGTGGTGCACATGTTTGCAGTCAACATGTTCAGGACGTTACCGCCGTCATCCAACCCAACGGGAGCTGAGTTTGACCCAGAGGAGGATGAACCCACACTGGAAGCGGCCTGGCCTCACCTGCAGCTCGTCTATGAGTTTTTCCTGCGGTTTTTAGAGTCACCAGACTTTCAACCAAACATAGCCAAGAAATACATCGACCAGAAGTTTGTGTTGCAGCTTCTGGAGCTGTTTGACAGTGAAGACCCTCGAGAACGAGACTTTCTGAAGACGACGCTCCATCGCATCTACGGGAAGTTTCTGGGTCTCAGAGCGTACATCAGGAAACAGATCAATAACATTTTCTATAGGTTCATCTATGAAACAGAGCATCATAATGGAATAGCAGAACTACTGGAAATATTAGGAAGCATCATCAATGGCTTTGCCTTACCACTGAAAGAAGAGCACAAAATCTTccttttaaaagttttgttacCTTTGCATAAAGTGAAGTCCCTCAGTGTTTATCACCCACAGCTGGCTTACTGTGTggttcag

Function

symbol description
ppp2r5cb Predicted to enable protein phosphatase activator activity. Predicted to be involved in protein dephosphorylation. Predicted to act upstream of or within signal transduction. Predicted to be part of protein phosphatase type 2A complex. Predicted to be active in cytosol and nucleus. Orthologous to human PPP2R5C (protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma).

GO:

id name namespace
GO:0006470 protein dephosphorylation biological_process
GO:0031952 regulation of protein autophosphorylation biological_process
GO:0007165 signal transduction biological_process
GO:0005829 cytosol cellular_component
GO:0000159 protein phosphatase type 2A complex cellular_component
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0019888 protein phosphatase regulator activity molecular_function
GO:0072542 protein phosphatase activator activity molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-041014-4 Predicted to enable protein phosphatase activator activity. Predicted to be involved in protein dephosphorylation. Predicted to act upstream of or within signal transduction. Predicted to be part of protein phosphatase type 2A complex. Predicted to be active in cytosol and nucleus. Orthologous to human PPP2R5C (protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000031200

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00036332 False 7556 mRNA 0.40 16 53898193 53963515
TCONS_00036333 True 892 mRNA 0.49 8 53912858 53949798

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_018505 NA coding downstream 87524 53804362 ~ 53810669 (-)
XLOC_018504 slc25a29 coding downstream 273529 53600638 ~ 53624664 (-)
XLOC_018503 mettl24 coding downstream 462710 53408284 ~ 53435483 (-)
XLOC_018502 wasf1 coding downstream 532056 53300588 ~ 53366137 (-)
XLOC_018501 NA coding downstream 605678 53287873 ~ 53292515 (-)
XLOC_018507 hsp90aa1.2 coding upstream 3835 53967350 ~ 53981626 (-)
XLOC_018508 hsp90aa1.1 coding upstream 18802 53982317 ~ 54012043 (-)
XLOC_018509 si:dkey-241l7.6 coding upstream 49697 54013212 ~ 54034543 (-)
XLOC_018510 NA coding upstream 82663 54046178 ~ 54046733 (-)
XLOC_018511 NA coding upstream 86917 54050432 ~ 54051494 (-)
XLOC_017928 CU539064.1 misc downstream 43844492 10053405 ~ 10053701 (-)
XLOC_018498 NA non-coding downstream 902854 52973860 ~ 52995339 (-)
XLOC_018493 CABZ01076171.1 non-coding downstream 1071067 52827010 ~ 52827126 (-)
XLOC_018491 NA non-coding downstream 1078577 52818807 ~ 52819616 (-)
XLOC_018513 NA non-coding upstream 185682 54149197 ~ 54154203 (-)
XLOC_018514 NA non-coding upstream 201370 54164885 ~ 54173299 (-)
XLOC_018520 NA non-coding upstream 307376 54270891 ~ 54271455 (-)

Expression


Co-expression Network