tdrd5 (LOC106574052)


Basic Information

Item Value
gene id tdrd5
gene name LOC106574052
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 14251389 ~ 14304106 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036947346.1
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>XM_036947319.1
GTTAGTAACGTGCTGGACCATAGATACATTCCACCACACTAGCGAGACAAAATCAGAGCACATCACGAGCCATACAGTTAGAAGATTACTACTTAAAGattaatttagatttttttaaatctaaatcTAACctgtttcagctgtgctaattgATGCTATTTGGACAGTGTTGGCTACATGCTGTTAACGAATTGAATCCATTAATTTATCTGCACCTGCAGAGTTCAGACGAGTACCGTGGAATAAATTGACAGGCTGATTGACCTGTAGGAAAGGTTGGTCTTCACGAGTTGTTAGTTCTCGCAGAATGACCCAGGAGCAGTTGCTTTCGAGCCTGAAGAAGGATGTGCGCTCCCTGCTCATCTCAGCCAAGCAGGGCCTGACCCCAGATCAGTTGAAGAGAGACTACATCAACATGCTGGGCCACCCCATGCCCCTGAGGATCCTTGGCTTCCGCAACGTGCTGGACATGATCCGCGAGATGCCCGACGTGGTGCATATCCTCTATCTGGGAGATGGCAGCATAGTGCTGAAGGCGGTGGCTGATGATACCACCAGAGGCATAGTGGAGTTGGTGGCCAAGCAGCGCAGTGCCAAGAAGACCCCTGCTCAGCGTGGCGGTGTGGGCTTCTTCTCCCCACGCTACCAGCATCACAACCCCATGGTCCTGCCGCGGCGTGGCCGTGCACCCCCGGCCCTGCCGGCTCAACTCCGGGCCCAGCTCCACCAGCTGCTCTCCCATGGGGCCGTGGGTTTATCGGAGCTGGAGACAGCCTTCGTCCGCCGCTTCGGCTTCCCTTTACGTGTCAACAACTACGGTTTCTATTCCATCGCCGAGATGCTGGCGGCGGCCGCCGACCTGGTGGCAGTCACACAAAGCAGGATGGGCTCCCAGCTGTCCCTCAGGGGGGCAGTGGTGGCATCACGGAGGACTGGACCCATAAAGCCGTTATTCCCATTGAAGCAGACCTTCAAAACTGTTCCTATCGTAAGGCAGATGACCCAGACAAACTCAGtcCCAGTAGAAAGACACACCACGGAGTCCAGTACTCCGAATCCAGTGTCCAATACTCAGAATCTTGTGGTACCAGCGCCACTCCCTGAGGCTGCAGTCCTTAACAGCCCAGAGGGAGACCAGGGCTCTCTGCCAATGGATTACACAATACCACAGCCTGAACCTGAACCCACGCAGGATGGACAACTGTTTCAGAAGTGTGTCATCAAGCTGGAGGAGGAGCTTAGGCAGCGTATTCTGGAGAACGGGGAAGCGGGCACTGTCAGTCCAGAAGTAAAGGCCAAGCTTCGCCAGGTTGTAGCCCAAAACAGTGAGGGACTGTCCGTCCACGATCTCCCTGCAGAATTCAAGAGGGTGTTTGGGGAGGAGCTGCCGGTGGTCCAGAGTGGCTTCCTGAGTACCACGGAGATGGTGGGCGCCCTGAGCGACACGCTCTACCTGCGGCCCATGGCGGGCGACGAGGGCAACCACTGGGTGGTCATGGACATCCAGAATGCCCCTGGACACACAACGCCTCAACAACCAGGAACGGCGGAGCCCGAAGGCCCCGTTGAGGGTGTCAAGGCTCTGAACCCGTCAGGTACGGGCTACTACTTCAGCTGTGGGGAGTCTccctgggagggagagggaggcgaGACCAAGCCCAACTTGGAGGAAGACCTGGAGCTCCGCATCACCACCAAGACCTCCTACCAGATGGTGGATATGTACGGCTCGTTGCCGGTGCGTTGTCGGCGTGGGGCGGTGATTCCCCCGGACGCCATGCGGGGCCAGAGGCTGAGGGCCCCCACGTGCAGGGGCCCTCGGGAGCTGGTGGCCGTGCTGGTGGAGCATGTGGAGTCTCCCTCGAACTTCTACATCCGCTTTGATGAGAGCCAAGAGGCCCGCGCCCTGGAGAACATGATGATTGAGATGAGgagcTGCTACACCTGTCCCGAGGTGTTGGAGCGTTACCGTCTACCGGAGCGCTACGTGCGTACAGGCCAGGTGTGCTGCGTGGCGCCCCAGGGCATCTGGTTCTACCGCGTGGTGGTTCACCGTGTCCTCAACAACACCCATGCAGAGGTCTACTACGTGGACTTTGGAGACCTCACCACTGTCCAGAGGAGCAGCCTCAACTTCCTCAAGTCTTGTTATTCAGAGCTCCCAGCACAAGCAGTCCCGTCATCGCTGGCTGGAATCAAGCCTTTCGGTGGCAGCTGGAGTGCCAACGCCAAGACCTCCTTCCAGAAGCTATGTTGTGACCGTACCCTGGTGGCAGCCCTGCATGGCTACCATGCCGACTTCCTGCAGCTCTTTCTGTGCGACACACACACCGAGGAGGATGTGTACATCCACAGCGCCCTGCAGGCCCAGGGCCATGGGCTCTGCTGCGCACCCACCGTCAGCGCAGCGTTGTGTAACCAGTTCAACCCAGTGAGCCTCTATCTGGGCGAAGGCGTGTTCGGCGAGGGAATGGAAATAGAGGACGAGGACCCCACCCTGGAGCCTTGCCACGAAGCCACCACCATCACTTTCCAGCACAACACCACCCAACCCCTGTCCAAGAGCTCCCCTTGCCCCACTCACACGACCCCTAACCTTGTGGGTGGGAACAAAACCAACAAAGAGGAAGTTCTGCCTGACCTCCCAGCACTGGAGTTCATCGAGGTCAACTCTACAACTCAGGGGGGCCTGAATGCCAACCCGTTTGCAGCTCTGCAGAGTAAGGACCCACTGCTGCTGTGCTGTAGTGACTGGGACCAGGGCTGGACACCCAATGCCCCTGCCCCCACCCCTGCCCCAGAGGTGGTACAGCCCAAGGCAAACCTGGGTAACCATGGAGACACAGCTATGcccccccccccttcacctagTGCCAGTGAGCTGAAGGAGCCATGCTCTGCAAATGGAGGGGCGGGGTCCCATATACCTGCTGTGCCCCCCCAGCCCTCCACTCTGAAAACCCTGAGCCTCCGTACCCCCGGATTGACGCAGACCCAGACTGCCCCATACGGTATGTCCGTGTTCCCTCTGTTTGGAATGGGGGACATGCTGCGTGTCACCTCGCCCTTTGCCCTGGGCCCGGCTGCCCGTCTGGCTACCGGCACTGGTTTCCATCTCCTCAACTGGTACCCTCACAAAAtggcctgaacacacacacacttcctcaatGCACAGCTGGTCAAACCAACATCATCCTGCTATGTGCAGACATGATCCTTACCTGTTAGAATGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACTTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGAATGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGAATGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGAATGTTAGCTACCTACCTTTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACACGATCCTTACCTGTTAGAATGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACACGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACACGATCCTTACCTGTTAGAATGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTATAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGAATGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTATAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGAATGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTATCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACAATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTATAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGAATGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTATCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACCTGTTAGCTACCTACAGTCAGACATGATCCTTACTTGTTAGCTACCTACAGCCAGTCCTCTTTTTTTGGTTTGATATTGATGTCGTGTCATAGACTTCTCCCATGTTTTCTCTAACACTACAAGGAATGTGTGCAGAGTTGATCGCTCCTTCTTCGAAATAGAAAATAATCGGAAAGCTTGTTTTGTAGAACTTTGAGTTGTTTTTACCGGTTAAGTTTTATTTTCTGCCTTTAAGTACGCTTTGATCCGTTTTATGTGTTTCATATTGTAATGACCAGGTTAGTTTCCTCCTTTTCTACCTGTTGCCTGTTTAACTGCTCAGCAGGTTTGTTTCCTTAGAGGACAGGAGACTTTTCAAATTACACTGTTTCGAAACAGAAAGAAATaatgtcattttatttttttgaaaataAACCAAATTGAAAACTTGTGAA

Function

NR:

description
tudor domain-containing protein 5

GO: NA

KEGG:

id description
K18407 TDRD5; tudor domain-containing protein 5

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036947346.1 False 4691 mRNA 0.52 17 14251389 14304106
XM_036947319.1 True 4713 mRNA 0.52 17 14251390 14304106

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
axdnd1 axdnd1 coding upstream 6977 14220167 ~ 14244412 (+)
LOC110486057 NA coding upstream 36450 14192456 ~ 14214939 (+)
LOC110485979 LOC106574047 coding upstream 66132 14172519 ~ 14185257 (+)
LOC110485648 LOC106574045 coding upstream 79789 14162385 ~ 14171600 (+)
LOC110508285 LOC106574085 coding upstream 106443 14140496 ~ 14144946 (+)
LOC110486340 fam163a coding downstream 14430 14318536 ~ 14349627 (+)
LOC110486505 LOC106574055 coding downstream 46439 14350545 ~ 14495848 (+)
gpr52 LOC106574057 coding downstream 96473 14400579 ~ 14406157 (+)
LOC110487584 LOC106574067 coding downstream 689831 14993937 ~ 15003427 (+)
LOC110487655 LOC106574076 coding downstream 712032 15016138 ~ 15019092 (+)
G12692 NA non-coding upstream 60574 14126330 ~ 14190815 (+)
G12680 NA non-coding upstream 152098 14099008 ~ 14099291 (+)
G12675 NA non-coding upstream 160038 14090734 ~ 14091351 (+)
G12670 NA non-coding upstream 167413 14083471 ~ 14083976 (+)
G12663 NA non-coding upstream 182703 14068471 ~ 14068686 (+)
G13121 NA non-coding downstream 117299 14421405 ~ 14421630 (+)
G13334 NA non-coding downstream 264993 14569099 ~ 14571242 (+)
G13359 NA non-coding downstream 329857 14633963 ~ 14635553 (+)
G13363 NA non-coding downstream 338257 14642363 ~ 14642610 (+)
G13364 NA non-coding downstream 338624 14642730 ~ 14642996 (+)
G12410 NA other upstream 619499 13617059 ~ 13666871 (+)
LOC110538561 LOC106574035 other upstream 991393 13238613 ~ 13295452 (+)
LOC110523899 LOC106574090 other upstream 2737007 11433102 ~ 11514427 (+)
gipc3 LOC106574151 other upstream 4090103 10140230 ~ 10162948 (+)
G13380 NA other downstream 375244 14679350 ~ 14679578 (+)
G13381 NA other downstream 375592 14679698 ~ 14680027 (+)
G13391 NA other downstream 396070 14700176 ~ 14700730 (+)
G13434 NA other downstream 507665 14811771 ~ 14812624 (+)
G13639 NA other downstream 657448 14961554 ~ 14962003 (+)

Expression


Co-expression Network