G2068


Basic Information

Item Value
gene id G2068
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 2786818 ~ 2798145 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2698
gggctacacagtctgaacctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtcacctaactactagctcatgtagggctacacactctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacagtctgaccctgctgtctactaactactagatcatgtagggctacacagtctgaccccgaccctgctgtctactaactactagttcacgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgaagggctacacagtctgaccctgctgcctACTAACTATTTGCTCATGTAGGGCTAAACAGTCTGAcactgctgtctactaactaatAGCttatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgccCCTGCTGtcaactaactactagctcatgaaGGGCTACACAGaatgaccctgctgtctactaactcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacagtctgaccctgcagtctactaactactagctcatgtaggacTACACAGTCTTGACcccgaccctgctgtctactaactactagcccatgtagggctacacagtctgaccttgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgccaactaactactagctcatgaagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtaggtcTACACAGTCTGCCCCTGCTGTCacctaactactagctcatgaagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgactccGACcatgctgtctactaactactagctcatgtaggactacacagtctgaccctgctgtttactaactactagctcatgtaggactacacagtctgaccctgctgcctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttaATGTAGGGCTatacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggcaacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttaatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgcagtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttaatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgactctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgcagtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacagagtctgaccctgctgtttactaactactagctcatgtaggactacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacaatctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaattactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgcccctgctgtctactaactactacttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctaaccctgctgtctactaactactacttaatgtagggctacacagtctgaccgaaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgaagggctacacagtctgaacCTGCTGTCacctaactactagctcatgtagggctacacagtctgccCCTGCTGTCacctaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccccgactctgctgtctactaactactacttcatgtagggctacacagtctgaacctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgacccgaactctgctgtctactaactactagctcatgtaggactacacagtctgaccccgaccttgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactaactcatgaagggctacacagtctgat
>TU2699
gggctacacagtctgaacctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtcacctaactactagctcatgtagggctacacactctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacagtctgaccctgctgtctactaactactagatcatgtagggctacacagtctgaccccgaccctgctgtctactaactactagttcacgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgaagggctacacagtctgaccctgctgcctACTAACTATTTGCTCATGTAGGGCTAAACAGTCTGAcactgctgtctactaactaatAGCttatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgccCCTGCTGtcaactaactactagctcatgaaGGGCTACACAGaatgaccctgctgtctactaactcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacagtctgaccctgcagtctactaactactagctcatgtaggacTACACAGTCTTGACcccgaccctgctgtctactaactactagcccatgtagggctacacagtctgaccttgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgccaactaactactagctcatgaagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtaggtcTACACAGTCTGCCCCTGCTGTCacctaactactagctcatgaagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgactccGACcatgctgtctactaactactagttaatgtagggctacacagtctgacccctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtttactaactactagctcatgtaggactacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttaatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgcagtctactaactactagctcatgtagggctacacagtttgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaattactagttcatgtagggctacacagtctgaacctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgcctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgacccgaactctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttaatgtagggctacacagtctgaccctgcagtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgaagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttaATGTAGGGCtgcacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatttagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactaactcatgaagggctacacagtctgatcctgctgtctactaactactagttcatgtagagctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctacgaACTACAAGTtaatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctgCACAGTCTGATcttgctgtctactaactactagctcattaAGGGCTACACaatctgaccctgctgtctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcattaAGGGCTACACaatctgaccctgctgtctacacagtctgaccccgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacagagtctgaccctgctgtttactaactactagctcatgtaggactacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgcagtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaattACTAGTtaatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgcctactaactactagctcatgtcgggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtaggactacacagtctgaccccgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagttaatgtagggctacacagtctgaccctgcagtctactaactactagctcatgtagggctacagagtctgatcctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtagggctacacagtctgaccctgctgcctactaactactagctcatggagggctacacagtctgaccctgctgtctactaactactagctcatgtaggactacacagtctgaccccgaccctgctgtctactaactacttgctcatgtagggctacacagtctgac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2698 False 2733 lncRNA 0.49 6 2786818 2796573
TU2699 True 3343 lncRNA 0.45 4 2786818 2798145

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531937 LOC106574099 coding upstream 206510 2538334 ~ 2580308 (+)
zbtb11 LOC106560622 coding upstream 528493 2212135 ~ 2258325 (+)
dpt LOC106574207 coding upstream 593923 2176672 ~ 2192895 (+)
nme7 at233 coding upstream 688134 1984326 ~ 2101039 (+)
tmem131 LOC102783117 coding upstream 819242 1859377 ~ 1967576 (+)
LOC118966170 NA coding downstream 601281 3399426 ~ 3400148 (+)
bcl6aa LOC106574104 coding downstream 804518 3602663 ~ 3624582 (+)
LOC118965227 NA coding downstream 1024991 3822517 ~ 3826226 (+)
trnap-cgg NA coding downstream 1049478 3847623 ~ 3847694 (+)
trnap-ugg NA coding downstream 1049743 3847888 ~ 3847959 (+)
G2084 NA non-coding upstream 2634 2782767 ~ 2784184 (+)
G2018 NA non-coding upstream 130203 2648027 ~ 2656615 (+)
G2004 LOC106574222 non-coding upstream 168256 2616569 ~ 2618562 (+)
G1961 NA non-coding upstream 249064 2537525 ~ 2537754 (+)
G1959 NA non-coding upstream 249774 2536747 ~ 2537044 (+)
G2223 NA non-coding downstream 18145 2816290 ~ 2816626 (+)
G2224 NA non-coding downstream 26075 2824220 ~ 2824983 (+)
G2225 NA non-coding downstream 26974 2825119 ~ 2825476 (+)
G2253 NA non-coding downstream 154106 2952251 ~ 2952667 (+)
G2260 NA non-coding downstream 159531 2957676 ~ 2957882 (+)
G2016 NA other upstream 141649 2644335 ~ 2645169 (+)
G998 LOC106576565 other upstream 523253 2258883 ~ 2305334 (+)
G961 NA other upstream 707215 2078898 ~ 2079603 (+)
G583 NA other upstream 1776611 1003783 ~ 1010207 (+)
G166 NA other upstream 2466844 318047 ~ 319974 (+)
G2343 NA other downstream 416552 3214697 ~ 3216234 (+)
G2464 NA other downstream 705124 3503269 ~ 3503581 (+)
G3176 NA other downstream 1377178 4175323 ~ 4178073 (+)
G3234 NA other downstream 1600759 4398904 ~ 4399444 (+)
G3351 NA other downstream 1641821 4439966 ~ 4441908 (+)

Expression


Co-expression Network