G99063


Basic Information

Item Value
gene id G99063
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 89326958 ~ 89329993 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU109756
GGGACGCCCGACGTGGGAGGGTACATCCTGCCTACAGCCTCCCCGACATCTCCCTCACCACTGCGTACATAGGCTGTGTACCAACTGTCACacaattccctacatagagcactttttttgaccagagccttggttaacagtagtgcacttcatagggaatagggtgccatttgagacgttgGCAGAGAGTACCATCTTAGAGCTCTCTTATAGGCTAACATTGCCACTGGAGGGTAAGAGGGGAAAAATAGAAAAACAAGGGatcagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctaaactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctacaccactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactactaccttataaaacccagtcatatctaactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactaccctataaaacccagtcatgtctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactactacctataaaacccagtcatatctaactactactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatcaaactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaactcagtcatatctacactactactactaccctataaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctaaactactactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaacccagtcatatctacaccactactactaccctataaaacacagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctacaccactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctacaccactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactaccccataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatcaaactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaactcagtcatatctacactactactactaccctataaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctaaactactactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaacccagtcatatctacaccactactactaccctataaaacacagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctacaccactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctacaccactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactaccccataaaacccagtcatatctaactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaacccagtaatatctacactactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactaccctataaaacccagtcatatctacactactactaccctataaaacccagtcatatctagactactactacctataaaacccagtcatatctagactactactactaccccataaaacccagtcatatctagactactactac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU109756 True 3036 lncRNA 0.38 1 89326958 89329993

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ghitm LOC100136239 coding downstream 56587 89223150 ~ 89270371 (-)
LOC118966065 NA coding downstream 544839 88757265 ~ 88782119 (-)
LOC118966064 NA coding downstream 609881 88716318 ~ 88717077 (-)
LOC118966063 NA coding downstream 611203 88714598 ~ 88715755 (-)
LOC118936686 LOC106594327 coding downstream 1055978 88236581 ~ 88270980 (-)
fbxl15 fbx37 coding upstream 467919 89797912 ~ 89803793 (-)
LOC118966075 LOC106577395 coding upstream 570345 89900338 ~ 89902518 (-)
LOC110519290 cj104 coding upstream 582305 89912298 ~ 89920458 (-)
LOC118936688 LOC106577347 coding upstream 779303 90109296 ~ 90115842 (-)
LOC110515022 LOC106560865 coding upstream 786508 90116501 ~ 90141830 (-)
G99058 NA non-coding downstream 9903 89316290 ~ 89317055 (-)
G99057 NA non-coding downstream 10977 89312263 ~ 89315981 (-)
G99045 NA non-coding downstream 32581 89294149 ~ 89294377 (-)
G98971 NA non-coding downstream 109683 89216910 ~ 89217275 (-)
G98968 NA non-coding downstream 110919 89215390 ~ 89216039 (-)
G99069 NA non-coding upstream 7561 89337554 ~ 89337791 (-)
G99077 NA non-coding upstream 15323 89345316 ~ 89345569 (-)
G99096 NA non-coding upstream 35700 89365693 ~ 89365944 (-)
G99121 NA non-coding upstream 73331 89403324 ~ 89403563 (-)
G99134 NA non-coding upstream 99069 89429062 ~ 89429557 (-)
G99035 NA other downstream 36902 89287214 ~ 89290056 (-)
G98878 NA other downstream 250720 89075847 ~ 89076238 (-)
G98616 NA other downstream 682891 88551974 ~ 88644067 (-)
G99595 NA other upstream 627399 89957392 ~ 89957916 (-)
G99602 NA other upstream 633880 89963873 ~ 89964205 (-)
G100197 NA other upstream 1297540 90625080 ~ 90858972 (-)
LOC110516041 jakmip3 other upstream 1652742 90982735 ~ 91072716 (-)
G100582 NA other upstream 1902747 91232740 ~ 91233788 (-)

Expression


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