LOC118937323


Basic Information

Item Value
gene id LOC118937323
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 1424316 ~ 1426453 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XR_005034581.1
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>XR_005034582.1
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>TU118142
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>TU118143
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>TU118144
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>TU118145
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>TU118146
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>TU118147
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>TU118148
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_005034581.1 False 1919 mRNA 0.44 2 1424316 1426277
XR_005034582.1 False 1873 mRNA 0.44 3 1424316 1426277
TU118142 False 686 lncRNA 0.42 2 1424419 1425242
TU118143 False 548 lncRNA 0.41 2 1424419 1425242
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TU118145 False 850 lncRNA 0.38 2 1424419 1426453
TU118146 False 800 lncRNA 0.38 4 1424419 1426453
TU118147 False 1034 lncRNA 0.40 2 1424419 1426453
TU118148 True 984 lncRNA 0.43 4 1424419 1426453

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
tgfbr2b LOC106606173 coding upstream 33380 1309202 ~ 1390936 (+)
rbms3 rbms3 coding upstream 192781 1023461 ~ 1231535 (+)
LOC110515032 LOC106606177 coding upstream 199412 1222130 ~ 1224904 (+)
LOC118936923 NA coding upstream 454788 968616 ~ 969528 (+)
LOC110506977 LOC106595099 coding upstream 515740 905576 ~ 908576 (+)
stt3b stt3b coding downstream 30059 1456336 ~ 1564305 (+)
LOC118937324 NA coding downstream 144033 1570310 ~ 1573421 (+)
LOC118937327 NA coding downstream 161905 1585657 ~ 1588650 (+)
LOC118937328 NA coding downstream 162543 1588820 ~ 1589368 (+)
LOC118937325 NA coding downstream 178863 1605140 ~ 1606773 (+)
G104948 NA non-coding upstream 15542 1407391 ~ 1408774 (+)
G104945 NA non-coding upstream 21437 1401439 ~ 1402879 (+)
G104944 NA non-coding upstream 25692 1398241 ~ 1398624 (+)
G104942 NA non-coding upstream 26765 1392633 ~ 1397551 (+)
G104937 NA non-coding upstream 39997 1383918 ~ 1384319 (+)
G104955 NA non-coding downstream 18258 1444535 ~ 1445163 (+)
G104959 NA non-coding downstream 22444 1448721 ~ 1449440 (+)
G104963 NA non-coding downstream 25911 1452188 ~ 1452833 (+)
G104979 NA non-coding downstream 32411 1458688 ~ 1459328 (+)
G104981 NA non-coding downstream 34260 1460537 ~ 1463337 (+)
G104761 NA other upstream 270567 1153061 ~ 1153749 (+)
cmc1 cc068 other upstream 551801 860459 ~ 872515 (+)
G104092 NA other upstream 723045 690046 ~ 701271 (+)
G103851 NA other upstream 1243294 174996 ~ 181022 (+)
G105036 NA other downstream 272796 1699073 ~ 1700431 (+)
G105042 NA other downstream 282692 1708969 ~ 1710557 (+)
G106019 NA other downstream 1094439 2520716 ~ 2527972 (+)
G106122 NA other downstream 1291684 2717961 ~ 2718525 (+)
G106240 NA other downstream 1548546 2974823 ~ 3039475 (+)

Expression


Co-expression Network