LOC118937359


Basic Information

Item Value
gene id LOC118937359
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 4634503 ~ 4636138 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036935562.1
TATTCATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTACACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACCCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTCATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACCCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACAGACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTCATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTCATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACCCTACCATGGACTATACATACAGGACCCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTCATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAtacatacaccactaccataggttaatctttatttt
>XM_036935569.1
TATTCATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTACACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACCCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACAGACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTCATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTCATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACCCTACCATGGACTATACATACAGGACCCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTCATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAtacatacaccactaccataggttaatctttatttt
>XM_036935571.1
CTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTCATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACCCTACCATGGACTATACATACAGGACCCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTTATTCATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGAACCTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAGAGTAGGTGTCTTCATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTATACATACAGGACACTACCATGGACTAtacatacaccactaccataggttaatctttatttt

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106594117

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036935562.1 False 1383 mRNA 0.42 3 4634503 4636138
XM_036935569.1 False 1316 mRNA 0.42 4 4634503 4636138
XM_036935571.1 True 996 mRNA 0.42 2 4634972 4636138

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
col14a1a col14a1 coding upstream 62122 4327983 ~ 4572381 (+)
deptor deptor coding upstream 331967 4236880 ~ 4302536 (+)
LOC110507036 LOC106594376 coding upstream 514761 4113122 ~ 4119742 (+)
mal2 mal2 coding upstream 548823 4065992 ~ 4085680 (+)
colec10 LOC106591867 coding upstream 568896 4050783 ~ 4065607 (+)
LOC118937361 NA coding downstream 99519 4735246 ~ 4737284 (+)
LOC110506140 LOC106606110 coding downstream 511963 5148101 ~ 5176987 (+)
tbc1d31 tbc1d31 coding downstream 559793 5195931 ~ 5227041 (+)
LOC110520809 LOC106598492 coding downstream 591919 5228057 ~ 5235894 (+)
mrpl32 LOC106595598 coding downstream 638018 5274156 ~ 5275584 (+)
G107703 NA non-coding upstream 18441 4615538 ~ 4616062 (+)
G107697 NA non-coding upstream 34990 4596186 ~ 4599513 (+)
G107693 NA non-coding upstream 52826 4581316 ~ 4581677 (+)
G107682 NA non-coding upstream 93225 4539636 ~ 4541278 (+)
G107680 NA non-coding upstream 107429 4526567 ~ 4527074 (+)
G107709 NA non-coding downstream 2338 4638476 ~ 4640436 (+)
G107714 NA non-coding downstream 10642 4646780 ~ 4647797 (+)
G107896 LOC106595750 non-coding downstream 26386 4662524 ~ 4668610 (+)
G107898 NA non-coding downstream 70061 4706199 ~ 4707474 (+)
G107911 NA non-coding downstream 73951 4710089 ~ 4710939 (+)
G106814 NA other upstream 496007 4137813 ~ 4138496 (+)
G106775 NA other upstream 606909 4027075 ~ 4027594 (+)
G106575 NA other upstream 834151 3639434 ~ 3800352 (+)
G106595 NA other upstream 956653 3676265 ~ 3677850 (+)
mboat1 LOC106573215 other upstream 1147374 3350582 ~ 3487129 (+)
G107922 NA other downstream 108030 4744168 ~ 4745586 (+)
G107955 LOC106592862 other downstream 172601 4808739 ~ 4811575 (+)
G108048 NA other downstream 221773 4857911 ~ 4858274 (+)
G108280 NA other downstream 500218 5136356 ~ 5136992 (+)
G108354 LOC106573122 other downstream 660041 5296179 ~ 5299933 (+)

Expression


Co-expression Network