G106595


Basic Information

Item Value
gene id G106595
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 3676265 ~ 3677850 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU120605
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Function

NR:

description
Secretagogin

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU120631 True 868 lncRNA 0.40 3 3676265 3677850

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
mboat1 LOC106573215 coding upstream 254166 3350582 ~ 3487129 (+)
LOC118937337 NA coding upstream 696072 2978786 ~ 2980193 (+)
LOC118937340 NA coding upstream 697741 2978236 ~ 2978524 (+)
LOC118944030 NA coding upstream 1255644 2418186 ~ 2420621 (+)
LOC118944029 NA coding upstream 1498269 2166121 ~ 2177996 (+)
colec10 LOC106591867 coding downstream 372933 4050783 ~ 4065607 (+)
mal2 mal2 coding downstream 388142 4065992 ~ 4085680 (+)
LOC110507036 LOC106594376 coding downstream 435272 4113122 ~ 4119742 (+)
deptor deptor coding downstream 559030 4236880 ~ 4302536 (+)
col14a1a col14a1 coding downstream 650133 4327983 ~ 4572381 (+)
G106590 NA non-coding upstream 12905 3662817 ~ 3663360 (+)
G106579 NA non-coding upstream 27854 3645487 ~ 3648411 (+)
G106578 NA non-coding upstream 31161 3643415 ~ 3645104 (+)
G106574 NA non-coding upstream 36087 3639038 ~ 3640178 (+)
G106573 NA non-coding upstream 37280 3636815 ~ 3638985 (+)
G106597 NA non-coding downstream 4047 3681897 ~ 3682180 (+)
G106602 NA non-coding downstream 16881 3694731 ~ 3812426 (+)
G106611 NA non-coding downstream 26653 3704503 ~ 3704936 (+)
G106616 NA non-coding downstream 37361 3715211 ~ 3715836 (+)
G106617 NA non-coding downstream 39152 3717002 ~ 3721341 (+)
G106253 cdkal other upstream 285232 3006312 ~ 3391033 (+)
G106240 NA other upstream 636790 2974823 ~ 3039475 (+)
G106122 NA other upstream 957740 2717961 ~ 2718525 (+)
G106019 NA other upstream 1148293 2520716 ~ 2527972 (+)
G106775 NA other downstream 349225 4027075 ~ 4027594 (+)
G106814 NA other downstream 459963 4137813 ~ 4138496 (+)
G107922 NA other downstream 1066318 4744168 ~ 4745586 (+)
G107955 LOC106592862 other downstream 1130889 4808739 ~ 4811575 (+)
G108048 NA other downstream 1180061 4857911 ~ 4858274 (+)

Expression


Co-expression Network