G121533 (LOC106583873)


Basic Information

Item Value
gene id G121533
gene name LOC106583873
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 21288616 ~ 21346687 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU140354
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Function

NR:

description
uncharacterized protein LOC110531741

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU140354 True 12059 TUCP 0.46 2 21288616 21346687

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110509793 LOC106576373 coding downstream 214411 21064067 ~ 21074205 (-)
LOC110537483 LOC106605857 coding downstream 599761 20673776 ~ 20688855 (-)
LOC110537475 LOC106605848 coding downstream 615338 20668568 ~ 20673278 (-)
LOC110537468 LOC106605860 coding downstream 623397 20662992 ~ 20665219 (-)
LOC110537462 LOC106576526 coding downstream 627629 20651234 ~ 20660987 (-)
LOC110534425 LOC106605569 coding upstream 29739 21376426 ~ 21379023 (-)
LOC110537611 NA coding upstream 206831 21553518 ~ 21555867 (-)
LOC118938339 LOC106605559 coding upstream 231462 21578149 ~ 21586856 (-)
LOC110534443 LOC106605563 coding upstream 240291 21586978 ~ 21594470 (-)
LOC118944069 LOC106605559 coding upstream 248549 21595236 ~ 21596535 (-)
G121506 NA non-coding downstream 52834 21235495 ~ 21235782 (-)
G121503 NA non-coding downstream 54411 21233975 ~ 21234205 (-)
G121498 NA non-coding downstream 60812 21227582 ~ 21227804 (-)
G121496 NA non-coding downstream 64817 21223493 ~ 21223799 (-)
G121493 NA non-coding downstream 69140 21219265 ~ 21219476 (-)
G121550 NA non-coding upstream 4440 21351127 ~ 21351431 (-)
G121559 NA non-coding upstream 14165 21360852 ~ 21361200 (-)
G121571 NA non-coding upstream 35049 21381736 ~ 21382042 (-)
G121575 NA non-coding upstream 36321 21383008 ~ 21435193 (-)
G121584 NA non-coding upstream 61818 21408505 ~ 21423391 (-)
G121421 LOC106576258 other downstream 229767 21056598 ~ 21058849 (-)
G121208 NA other downstream 660916 20626557 ~ 20627700 (-)
G121188 NA other downstream 788029 20498896 ~ 20500587 (-)
LOC110509624 ret1 other downstream 822827 20462682 ~ 20465854 (-)
G121046 NA other downstream 1076249 20211068 ~ 20212367 (-)
G121738 NA other upstream 116006 21462693 ~ 21463030 (-)
G121756 NA other upstream 143580 21490267 ~ 21547037 (-)
G122733 LOC106592382 other upstream 449820 21796507 ~ 21812432 (-)
G122761 LOC106578847 other upstream 504746 21851433 ~ 21856413 (-)
G122829 LOC106605673 other upstream 679612 22026299 ~ 22027717 (-)

Expression


Co-expression Network