XLOC_021842 (si:ch211-225h24.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_021842
gene name si:ch211-225h24.2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 35402697 ~ 35498518 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00043302
TGCGCCTAGGGAAAGACACTGAAGTCTCAATGTGATTTTGTTTCTCCTGATAATTCAGACTCAGGCAGCGCGGACTGGTCTGCAGACGGAGGGCCCTGTCGTACCCAGATTTGCCATGCTGTTGGGCCTTCTGGGTATTGGGATGTCAGGATACAGCTCTCGACAGCTGACCCTACACTACAAACCATCGCCACATCTCCTGCGGTGAAACACAAAGAGAAAACGCACCCATTTTGACTAAAGGATAAAGACTCGGAGGGAACAGAGGAAGTTCTGAGCCCCACGAcaaagGATTCAAAGTTAAAGAAGGTGAAATCGAAGCGAGAAAAGGGAGACAAAAAGTTGTTTCCGTCTCAGGACGATGAACACATCTTGCTGACAGGAGTCACTGTTTCTCACAGAAGAGGaTCTGCTAAGAAAAACTGGGAGGACGATAAGATCAAGACTCACCCAGAGAAAGACAAAGCGCACTGCCTGTGGGACAGCATCAGCACCACCATGAAGCAGATCACACCCACCAGGAAGATGGACAGGATGGAGGGCTGGGAGCCGCCACAGCTAACGGACGGGCAGATGGAGGAGGACAAAACTGAGCTGGAGAAGAAGAGGAGCGACTCGTCT
>TCONS_00044864
GGAGAGTTCAGATCCGTCTggagtgtgtgtgcttgtgtgtgtgtgtgcgtgtttgtgtgtggaagGGACGGTTTGGTTCTCTGGCCAGAGGGACTGATCTGGTTGAAAAGAGGCTCTGCTGAGATGTTCTTCCGCATTCCTCTCCTGACACCCGGATACATTCGATACCTGCAGACTCAGGCAGCGCGGACTGGTCTGCAGACGGAGGGCCCTGTCGTACCCAGATTTGCCATGCTGTTGGGCCTTCTGGGTATTGGGATGTCAGGATACAGCTCTCGACAGCTGACCCTACACTACAAACCATCGCCACATCTCCTGCGGTGAAACACAAAGAGAAAACGCACCCATTTTGACTAAAGtttgtgttTGGCACTGTGGTTTGCCAGCCCCAGTGTCATGCAGAACGTAGACAGAGACAGAGTTTAACCAGCTGAAATGCCCATGAAAGACTCTGACCTGTTAGAAACTCTCTCCTATACTCTAAAaaggatttttgctgcttgttcaaacaacgTATTTAATATGAGCTGAATTGACAcgattcttgagttttttgaaggacaacttaatgtttttatgttcaacctatatttgtaaaaacaattaagtcaacttaacatgaaggaattgtgtggaagccagcattttttactgtgtaggcATCTGATGTAAATGATCtcttaaggcaagacactgcaggtgaacagggtaaaagtttatataaaatgtaattatttacttTCCCAACTCACATtaagaactgcaaaaaaatgtgctatgtgttttttataatgttttgctTACATATGCAAATGAGCTTCATTAAGAATGCACTGCTTTGCAGTCCAAACATACTAGTGTTTTTATACagagattttcattcattcattaattttccttcagctttgtccctttattcatcaggggtagccacagcggaatgaaccgccaacttatccagcaaatgttttacacagcaaaaaacctttcagctgcaacgcagtactgggaaacacccatacgcattcattcatactcatacactatggtcaatttagtttattcaattcacctacagcgcatgtctttggactgtaatcacccggaggaaacccacaccaacatggttagaacatgcaaactccatactaaaatgccaacagacctagccgggacttgaactagcaaccttctggctgtgagacgacagtgctaaccacagagccactgaGCTAGAGATTTTGTGAATCTTTTTGTCTCATCATAATTCAGAAAATCATGTGAACAGCCAGACAAGAAATATTTACTGCTCAAAAAGGAATACATGGAGTCACATtgtattgtttcatttatttatttattattaaatgttttaaaataagcttctcctgctcacccaagtggcatttatttaatcaaaaataaagtaaaaattgtaaaatagtgaaatgttattgcacaataaaataaCTGCTAAAAAGTGGTTTATaatttcatttagtcatttatttcattgattttaatgatgaattttcaactTCATTACATCAGTCTTCAGAGTCatatgattcttcagaaattactctaatcctaattattattattataattattattattaataatagtaatagtaatgaaaTCAattatgactggagtaataaattCATctgcatacaataagaaagcagttatttaaaattttaataaatatttaaatattgccgccttgatgaacagttTCACACTATTTTGTAGAATGAAACATATGTATTTAGGCATATTATGTatccctctttaaaaaaaaacagatacatATAcagatatatgtatacatatataactAAAACTCTAACGTTTGGTGGATATACAATTGGAAGATTTTATACctttctaaatattttataagCTCTGCTTAATAAAGAGAAG
>TCONS_00044865
GGAGAGTTCAGATCCGTCTggagtgtgtgtgcttgtgtgtgtgtgtgcgtgtttgtgtgtggaagGGACGGTTTGGTTCTCTGGCCAGAGGGACTGATCTGGTTGAAAAGAGGCTCTGCTGAGATGTTCTTCCGCATTCCTCTCCTGACACCCGGATACATTCGATACCTGCAGACTCAGGCAGCGCGGACTGGTCTGCAGACGGAGGGCCCTGTCGTACCCAGATTTGCCATGCTGTTGGGCCTTCTGGGTATTGGGATGTCAGGATACAGCTCTCGACAGCTGACCCTACACTACAAACCATCGCCACATCTCCTGCGGTGAAACACAAAGAGAAAACGCACCCATTTTGACTAAAGTGAACGTCTCACAGACAGCGAAATGTCAGTGTTTTTGAGAATGGGCTTCAGTGCTGAGTCATGTAAAGATGTCATGACGTCTCAGACAGACATTCAGAAGAGGAGCTTATGTTCTTAAATCAGTCTAATCTCTAATCCATTTACTGTTGGCTGATAATGTAAGGTCAAAGACTGTTATTTAGAGAACAACAAACGCCAGCCACATCACTTGGAGACGCCGAGCTGTCCTGATTGAGAACATTTTGAGGGACTCTGCACTTTGATGACAgaa
>TCONS_00043303
TggagtgtgtgtgcttgtgtgtgtgtgtgcgtgtttgtgtgtggaagGGACGGTTTGGTTCTCTGGCCAGAGGGACTGATCTGGTTGAAAAGAGGCTCTGCTGAGATGTTCTTCCGCATTCCTCTCCTGACACCCGGATACATTCGATACCTGCAGACTCAGGCAGCGCGGACTGGTCTGCAGACGGAGGGCCCTGTCGTACCCAGATTTGCCATGCTGTTGGGCCTTCTGGGTATTGGGATGTCAGGATACAGCTCTCGACAGCTGACCCTACACTACAAACCATCGCCACATCTCCTGCGGTGAAACACAAAGAGAAAACGCACCCATTTTGACTAAAGGTGCaacatttcttcaacacattccAACAACATCAGTATTACCAGGCAACCACATCATGCTGAAGTTTGTGGTCTTGCTTTGGTTGCGAGGATGGCCGATCTTCAACCAAGCCTTTCCAAACGTATTCTCTGGCAACAATTTGATTTAAGTTTTAGAATCTAGGTAAAATGGGTCTTTCTACGTGCTATCTCAATGTACAAATA
>TCONS_00043304
CGGCAATCTGAGCCGTGATGGGAGGAGCGGCGGTCCAGGTGCTGCAGCCGAGCGTGCGCGCAGACAGAAGCTCATCAgcggagaagaagaagaaacagagGAAAGACTACCATCTGTGGGGCATCGCGATCACAGCCGGGTTATTGTTTTGATTTATCTCGATATCTCCTCACTAAGAGTCTACCCATCTCATGGGCTTGGAAAAAACGTTACTCCGCTTCAtctgagagggagagagagaaagagagagaataacGCGAAGAATGTTCAAGAAGAGTAAGAGTAAAGTTCTAGTGGATGAAGCGTCGGAGGAGGACGAGGTGTCGTGGCATAATGAGCACGCGGGGAAGGATAAAGACTCGGAGGGAACAGAGGAAGTTCTGAGCCCCACGAcaaagGATTCAAAGTTAAAGAAGGTGAAATCGAAGCGAGAAAAGGGAGACAAAAAGTTGTTTCCGTCTCAGGACGATGAACACATCTTGCTGACAGGAGTCACTGTTTCTCACAGAAGAGGaTCTGCTAAGAAAAACTGGGAGGACGATAAGATCAAGACTCACCCAGAGAAAGACAAAGCGCACTGCCTGTGGGACAGCATCAGCACCACCATGAAGCAGATCACACCCACCAGGAAGATGGACAGGATGGAGGGCTGGGAGCCGCCACAGCTAACGGACGGGCAGATGGAGGAGGACAAAACTGAGCTGGAGAAGAAGAGGAGCGACTCGTCTCCGCTGTCCTCACCCCTGTCACTCTCTCTGCCTCATTCTCTGGGTCTGCCATCCTGGGTGGGTTTGGGTTTGGAAGAGGACTCGTCCCGCTACGCCAGCCTGACCGAGTCTCAGACGGGTGGCCCTGCGCAGTGGGCGGCGAGGGCACGAGATAAATTTGCCGCTGTCCGCCGTAGAAGTCCAGCCAACCTATCAGAGAGCACATGGGAGGGGCTTAAGTGATTTACATATTCAGGATGACCACGCCTCCTTTGCATACCAATAATTGGACCGATGAGTAGGACCCTCAGACCAAGAGTGCCTGCTTTTAATGCCTGTCAATGAATCATGTTCACTTTTCCTTTTGATGCAAgtgacttttcagcttttgaatgaagctttttttttttggagaattcCCTGGATTTTAGTGATTGACTGATCACATAACGTTTCAGAGATCATTTTTAAAGTAGGGCTGGGCCAATATACAATTTTATATCGAATCACATTAAAAttgatgtcaataacaataagggtcagtgtatcttttggtcattgtatttttattttggaaacagatattaaagaaaatggttacgcagtggtgcagtaaaGTAAACCttctctcacagcaagaaggtcgctggtctgaacctcagctcagttggcgtttctgtgtggagtttgcatgttctccctgcattccccacagtccaaagacatgtggtacaggtaaattgggtaggctaaattgtccgtagtgtaagagtgtgtgtgagtgtgtgtgtgtttcccagagatgggttgcagctggaagggcattcgctgcgtaaaaacaagctggataagttggccgttcatgaatatttaaaaaaaaaataaaaaatgagtcGTTTTTTTATTTCcggttaaaaattaaaaaacaaaaattaaattcaatgagtttttttatttttgtttttgaatttaaaacaaaatttgaaTTTTACCACGAAAATCAAAAATtgcctgttgtttttttttcatggagaaaaactaaattaaacaatgatttgattttcattttttatttcgaataacaaaaataaaatcaacagaaaacaaaacgaacagacatgtttttttatattccCAAACCAGATAGGCAAACTCATTTACGATGACGCAATGCTAACCTGCTAGCCTTCTACGGGctattatttttttccagttaATAGTGTAAAAGGTATTTTCTTGTTATAACaggattttaaaagttttaaaattgttaaaaccATAATGCTTCCACTTCCCGAAGTTTGACCACGAATCATTTCAAGTGAGGGAGGCATTAATACCGATGTTTGTTTCGCAGATTTCAATGAGTcagattttacaataaaaattaacaattaattttatcTAAAAGGAGGCATGCTGCACAAACATCCTGATAACCATCCCTTGTCTTTTAAAAATGGACTATCACTAAGCTTGCAGATGAGCTGTGTGCGTGTGTCATCACCCTGATACAGTGGGTCTATCCATAATTTCATATAGCCATGTGCAAATATAGCAGAAGATttttaatacataaattaaaaattattaaaaaaacgcccactgctaatatatatatatatgtatatatgagcaattccagcgttatggatgtgacatttgcagtaaaaactcaaaacataatttcacacagaaagtatatgttgacattatatcgaaacttctgtttatattttccaaaatagctcaccacagagttatgggagcagaaaaatatcaatatgtaaacatgttttatattttaaattaggaaaataaacatgcgttatggatgtgacaaaaaaagtttgcgAATTTGCAGTCGACAACAGATTATTTAGAAATTCTGacagttaaactgcacaacccaaaagacacaatgctcatcaaacaggtatgagtcggctcactatagaattaaaatgattgattttattttatttgacatttttgcatttatgaagaaaaagtgtcgttatggatgtgacacatttccgttatggatgtgacagctgtgaaattgccacttgtgtgattttggcaaattaaatataatagtttgaaatactgacagatacattcacgagtatttttacagtactgtaaaatacttgctaacacaaaaaatgtagaaacggtttgtCTATTTTGctgaaaactaaataattttttatggcaaggttgacatttgcttggaattgcccatatatatatatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataactataacatGGAGAGATAAGCAATGATTCCGAATGAATGTCCAATGTCACGGTCACTCCTGAAGTGGACGTAATTTTaacaataaactttatttttagaaAACTGTTCAGCAATGCAAATAATGCATACATCGTCAATTATGTTGTTCCATATAACCGGCTTCAATGAGGAAAATATGCATTAGCCAAAtcctgttatcacaagaaaataccttTTATAACATGAagtggaaaataaaaaaaaaagtctaaagagGGCTAGCAGGTCAGCATTGCGTCACCGTAAATGAGTTGGTCTATTTGGTTTCGGAATATAAGCAGACAAGTCTTaaatcgtttttttattttttattattttgttattcaaaataaaaaattaacatcaaataatttatttagtttttccatTTTTTACCATGAGAAAGAAAAACAAGCCATTTTTtgatgttcatttttaaaattaaaaaacgaaaatcaaaaaatgcattgaatttcacttttcattttttattttaatgttttttttttatttaataatgtttttcaatatctgtttctaaaatgaaaatccaatgaccaaaagatacactgacctaaaagtgtgttgacacattagctcggcatataccccattaatcggccaaaaatgttatgccatttaatggatcctctgatttttgtggcttcagtcattgttggggtactcttttaaatttaGAACCATTAACAACTTATAATCAAAATATACatcgttattgttcaatatggaaatattaagagagattgcatttttgccatatcgcccagccctattttaGAGGGTTAGTTCACGCAGAAATGTAAATTACCACATCCTCAATTCTCCCTCATACTTACTCCCacgtttatattgaagttgatatttagccacaccatgttggtgttttgtaacataaTTGTTACGAATTGGGTCGGtagcccaacactcaacccccaacctggaggaccaggacatagacacatacactacagataatttagcttacccaattcacctatagaacaTTTCTTTGGTTctatggggaaaaccggagcacaagGATAAaatccacacgaacatggggagaacatgcaaactccacacagaaatgccaactgagccagcctcacaccttcttgctgtgaggcgacagcgctacccccTGTGCCATCGTGTCACCTTTGTCTATGTAACTCTAAATCATAACCCCAACCTAACCAATGGAGTGGCCCTTAATTTCCCTCATCAGTGttgaacactgaaaaaataaCAGGGAAGTCTATGAgtcccagcattcttcaaaatatcttcttttgtgttcatcgaACGAAAGAAAATCAAATATTGAAAATGGagaataagtaaatgatgacagaaaagcCAAAAAACTGATTGTTTTGCTTTAAAGAACTCAATAGGCTATATAAGAAGCCATATTAATTTTGTTTCAACTGAATATGTATTTTTGTCTCAAAACTTCTATTTAAGGAATCCCCAATAACCATCTTTagctaaaaatgttatttaatgttctactgatgAAAGTAAGTCATCGTGGATGGcctgagggagagtaaattagCCACAAATTACATGGTTCccttaaattaatattttgtcgTAATTCACCCGCCTCACTTACCGTTACTTCCAaatctgtttgttttcttctgtGGTACTAACGTTACTTAAAGTAGCCTAGTTTAGCACATTGTCTCGAGTATTAGCTGGCGTTATTGTTCATACAATGAAATAGTAGCTACTAATAAGGACAGAAATATCGCGAATATAGTCTAAAATGACTTGTAAGTTATATTATAAGTGTTCTTAAGTTATGTTTTCGTCAGTGAACAAGTTAGCGTTCACTTTCATTGCATAGCACTAATGGCTGTCAGGACGTTTTGCTACACTTCTATTTTCCACAGTTGATACCCAGACAGGTTTGAAATGTCCTAAGTGattaaaagatgacagaatttaaacATTTACCTAAATTATCCCTTCAAATTTGCGTTTTAAGCCAGTGTCGAGTGGGTCTAGCAAAACTGCAATACTCATCATCACCTACAGATGGCGCATCGCGTCTCAATCTCCCCAAAGACTCCTGAAGAAGAGATCTATGATTATAAATAAACTAGTATAAAGTGTTTATTTCTCTCAGATTCAGTCGTGCTTAATTTATTCTGGTGTATAATAGAGTTGAATGTAAAACAAATGTAGAAACACCTTCAGCCGATCAGAAAAGATCGCTACTGCCTGCTGATAAACAATCATAAATGTACTGTAATTACTCTATGCAATGATTTCTCGCTATAATCCCAAACTATTTGCTATATATTGGTCATGCAGACATTGTATTCAGTGCCATTTTCTGATCACGAGGAAGAGAACTTGCTTTTTAAGACATAGCCTACTGGGAATCATTTTACCCtgaatgtgtttgtatgtgctCACTGATTCTTGCCTTTGGAGATTTAGATTtggaagaagaaaaataaaacctttttcttGTGTGAAGTGGGTTGGAGGTCCACAAATGTGACAAGGATTTAGTAATAACTGCTGTTTGAAACATATTTAAAGCCTTCCAAAGACCTCAGAAGCTGTGCCGTTTAAGCGCataaagttttaattaaatttttcttTGCAGTGCCTCAATTTAAGTCATTTTATAGTGTGATCATGATGAAATATTTGCCAAATATTCTCTTCCAGCACTCTTAAAAGGGTAAAAAAAGGACAACCATCACTTAAGTCTAAAATGGAAAGTCAGAtatgcattttatatataaacctCTGGCCTTTTAAGATCTTTGATTTGCTATAGAGTATGTGTGAGTGGCCTTATTGCTGATTAAAGGAGATTATTTATAAGGTTGATCAGATTATAAGTGGGTTTGCTTGCTTATAGTAGCTTTATAGAATTAGTCCAGAAATGTTTAACAGTGACAGATAATTATCGATTCAGCTTTTTCTCTGGGGCCTTTGCAAGATCcttatttggtttgtttttatctTGACACTACTGAATGATTTGTTTCTGTATTGTTACGATTGAAATGCTGTAATTCCAGGACTTCAGATGAGTGAATCTGAATAAAACTTACACTATAGCCC
>TCONS_00043305
TCTACCCATCTCATGGGCTTGGAAAAAACGTTACTCCGCTTCAtctgagagggagagagagaaagagagagaataacGCGAAGAATGTTCAAGAAGAGTAAGAGTAAAGTTCTAGTGGATGAAGCGTCGGAGGAGGACGAGGTGTCGTGGCATAATGAGCACGCGGGGAAGGATAAAGACTCGGAGGGAACAGAGGAAGTTCTGAGCCCCACGAcaaagGTGTTCCGGTGGAGATCAGAAGGCGAGAGGGTCCCAAGATTACTCCCAATTTCAGAATTTGAAGAGGTCTATGAAGTGCTGAGGAGAGACGGGGGTGAGGCAGCTGTCAGGATCGTTGGCCGTGCAGGGATGTCCCGAGTCCTGTCG
>TCONS_00043306
gcacttctaTATAAACTCATGTCcaaaatttgcattaaaataggtgaattgggtaagataatactTGAAAATGACATAAACATTCCCTGTAGATTAAATTCAATTATTAATAACCAATcgaaaaataacaatttaagattccCAAACCAGATAGgAAATGGTCAGatggatttagctgTTTTGCCCTTGTATatgcaaacaTTAATCATTTATGAATTTACCCATGGATTCGACAAgataaatttgaagcaagttagGCCGACCTTAGaatacatttctgaagataaacatGTCTGGAAGAAGCTGTGT
>TCONS_00044867
ctcgaatattgtttatacataaacttcacttatactTCTGAAAAACTATGAGTGCAAGTACTTAATCCAATATCTTTACTATGTCTACAATGCAGTCATGTAAGCCGTTATTCTTTATCAGTCATCATCATGGCTAGATTTCTGCTTCTTATGCTGATATCACACAgcatgtaaatgtataaacaaGCCTGTCGTGCTGAAGTGGCCTTTGTGAAATGTGAAGGGGACGTGTGTTTACCACTTGCACCCAGAATAAGGATGCCATTTGAAGAAAGTAGGAAATATGATAAAACGTAAACATTTTCTTGACCTAAAGAGTAATAAAAATGGGTTTTCACATGCCGAGGAAGTAGAAGTGGTACAATCAAAATGCTGCATCTTTAGAGGATAATATAAAAGCCATACGTTTCTAGCTGGCACTTCTTCaggtttaaattaaacacaataatCAACATAGAAAATGTTAAACTATCTTCAAAATTCTGGGCTCCGTTCAAAATGTTGCAAAATGTTCTTTGAAATGGAAAAGGTGGTGGTCGAACATCTTGTTCTGATGACACAAGAGTTGCAACTTTATGGCAGCTGAGCAGGCCATTCTTgtgatcttttaaaaaaaaaacagagcctGATGAAATCGGtataaatatgtgtttaatacTGAAAAATATGCGCATTGTTACAGTATCTGCTCAAGTTGTCCAAAATTTAAGAGAAGCAACTTTACTTGAACCCATTATGTCTCTTTAATACCACAAGTTGCTTCCATAGCAAAACATTGGTTGCAGCTAGAGGAGATACAGCTGCGGCTAGAAGTTACAATGagaattattttgattatttattaaaaatattatctattaaatgtattttattaacgtctacctctaccccaaccctaaacccaccaAAGCCATCACAGTTGTGACAGCAATTATACCAAGTATTcaaattatttatgaaattagccatttaactgtattttaacgtctaccccaaccttAAAACGAACCGCCACAGTAATGTAATAACAGCAATTATTGTTGTATAGTGTcaacaaaattaggctatatTGATtggagcagtggttctcaaacttttttcaccaagtaccacctcagaaaacaattgtctttccaagtaccaccataataaaaagtattaaaatacagaAGCAGTACCACcataataaaaagtattaaaatacagtagcagtaggcctaattaagcagccaAAGCTCTACACAGTTTAAAAACAAGGCAGATTTATTcctaatattttgaaaatgtattattgtcagccactttaaacattagaaatagtttgaacattaacattgCATTGAGCCTACAAGTAAAAAATAAGTCACgtttgaattaaaatgtgcttttaaaagttaattaaaatagacactgttcttaaaaagtaaaaagaaaactgctgtagcCTATTTATCAAAACCTGGAAAAGTTCTGTGACCTCATTAATATAGGCTATTTCAAATTCATATATAAactctttttgataaattttttaattattattttttaattattcagtgATCACTCCGCATATGACTAGTGggaccactagtggtacacatgccacagtttgagaaacactggattggagtatccacagctgtatccaaTCTAGACTTCACCCAAAAACACAGTTTTGAACTTGAACGTCCGCCTAGATGTGAAGTACAAAAATTTGTAAAGTAAGTAAAGCAAAATGGGCGATGCagtgcgcagtaggtagtgctgtcgcctcacagcaaaaaggtctctggttcgagcctcggctgggtcagttggcatttctatgttaagtttgcatgttctccctgcatacgCATGGGTTTCCctcgggtgctccgctttcccagacagtccaaagacgtggtacaggtgaattggctaaattgtccgtagtgtatgtgtgtgaatgggtgtgtatggatgtttcccagaaatgggttgcagctggaagggcatccgctgcatgaaacgtgctaaataagttggcggttcattctgctgtagcgaccccggattaattaagggactaagccgagaagaaaatgaataaatgaaagcaaAATGTTAACCAGAGATCTTATTTTACAtgctcacaaacaacaacaacaacaaacagtaTAGACCTACTAAAATTGACCCAGTAGTATGCCCTAGAACAGTCCAGAAGAGTGGGTTTAGTGCCTaattttctgattggctaataatGTGCCGGTGTCTCCAACAACTCTTTCTTGAAACTGTAGAGATGCTTTTGATAATAGTAGTCAAAACAAAGTAATTTGTTACAGGACATAATTTAATCCAGATCTCGAAGAGTCTTTCCAGACTCTGCTGCATTTCTGCAGCTGTAAAGCCACTTGATAATCCGAGCGTTGCGCTCGATCACTGACGACCCTTGTCGGACAGTCTCCTGCAATTCCTCCTCTTGCAAACCGTCGCTGCAGCTCGAGAACCCGTCATCCGACGTGGACACGCTGATGCTCCTGATATTGGAGCTGAGATCGTCCGAGCGCGCGGAGAAATTCTCTTTGCCCAGCGACTCGATGATGTCACCGTCGAGCCCGCAATATTTGAAGAACACGTCGAAGTCCGCGAAGTTTTTCGAGTAGCGCGAGCTGATGTCCGAGCTGGAGCGCGCCACTCCTGTGCGACTCTTGCGCTCCTGCTCTTTTGTTTCAAGAACTTTCCTGTGAGGAGTCGCTCTCTGAACCTCATTTGTCCCGCTTGCGGTTATGGTTACCTGTGAGGACTCTTTTCCACATTCCTTACTTGTGGCGCGATCAGATTCTCCACCTTTGTCTCTAACGATTGTTGGCTTTTTTACCATGCAAGGTAT
>TCONS_00044868
TCCGCATATGACTAGTGggaccactagtggtacacatgccacagtttgagaaacactggattggagtatccacagctgtatccaaTCTAGACTTCACCCAAAAACACAGTTTTGAACTTGAACGTCCGCCTAGATGTGAAGTACAAAAATTTGTAAAGTAAGTAAAGCAAAATGGGCGATGCagtgcgcagtaggtagtgctgtcgcctcacagcaaaaaggtctctggttcgagcctcggctgggtcagttggcatttctatgttaagtttgcatgttctccctgcatacgCATGGGTTTCCctcgggtgctccgctttcccagacagtccaaagacgtggtacaggtgaattggctaaattgtccgtagtgtatgtgtgtgaatgggtgtgtatggatgtttcccagaaatgggttgcagctggaagggcatccgctgcatgaaacgtgctaaataagttggcggttcattctgctgtagcgaccccggattaattaagggactaagccgagaagaaaatgaataaatgaaagcaaAATGTTAACCAGAGATCTTATTTTACAtgctcacaaacaacaacaacaacaaacagtaTAGACCTACTAAAATTGACCCAGTAGTATGCCCTAGAACAGTCCAGAAGAGTGGGTTTAGTGCCTaattttctgattggctaataatGTGCCGGTGTCTCCAACAACTCTTTCTTGAAACTGTAGAGATGCTTTTGATAATAGTAGTCAAAACAAAGTAATTTGTTACAGGACATAATTTAATCCAGATCTCGAAGAGTCTTTCCAGACTCTGCTGCATTTCTGCAGCTGTAAAGCCACTTGATAATCCGAGCGTTGCGCTCGATCACTGACGACCCTTGTCGGACAGTCTCCTGCAATTCCTCCTCTTGCAAACCGTCGCTGCAGCTCGAGAACCCGTCATCCGACGTGGACACGCTGATGCTCCTGATATTGGAGCTGAGATCGTCCGAGCGCGCGGAGAAATTCTCTTTGCCCAGCGACTCGATGATGTCACCGTCGAGCCCGCAATATTTGAAGAACACGTCGAAGTCCGCGAAGTTTTTCGAGTAGCGCGAGCTGATGTCCGAGCTGGAGCGCGCCACTCCTGTGCGACTCTTGCGCTCCTGCTCTTTTGTTTCAAGAACTTTCCTGTGAGGAGTCGCTCTCTGAACCTCATTTGTCCCGCTTGCGGTTATGGTTACCTGTGAGGACTCTTTTCCACATTCCTTACTTGTGGCGCGATCAGATTCTCCACCTTTGTCTCTAACGgtgaactaacacTTCAATGCTAAACATCAA

Function

symbol description
si:ch211-225h24.2 Predicted to be involved in spermatogenesis. Predicted to be active in cytosol and nucleus. Orthologous to human TDRP (testis development related protein).

GO:

id name namespace
GO:0007283 spermatogenesis biological_process
GO:0005829 cytosol cellular_component
GO:0005634 nucleus cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-030131-1581 Predicted to be involved in spermatogenesis. Predicted to be active in cytosol and nucleus. Orthologous to human TDRP (testis development related protein).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000104936 ENSDARG00000116857

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00043302 False 621 processed_transcript 0.51 5 35402697 35461009
TCONS_00044864 False 1929 lncRNA 0.36 3 35403886 35415537
TCONS_00044865 False 630 lncRNA 0.49 3 35403886 35416434
TCONS_00043303 False 545 lncRNA 0.48 2 35403904 35409639
TCONS_00043304 False 6160 lncRNA 0.36 4 35426398 35466441
TCONS_00043305 False 366 processed_transcript 0.52 3 35426577 35469859
TCONS_00043306 False 309 mRNA 0.31 25 35451050 35498276
TCONS_00044867 False 2878 lncRNA 0.39 2 35487954 35498518
TCONS_00044868 True 1315 lncRNA 0.47 2 35489518 35498165

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_021841 CU459147.1 coding upstream 194311 35195740 ~ 35208386 (+)
XLOC_021840 CHST13 coding upstream 377580 34990693 ~ 35025117 (+)
XLOC_021838 CR352218.1 coding upstream 415334 34849715 ~ 34987363 (+)
XLOC_021839 NA coding upstream 454198 34946447 ~ 34948499 (+)
XLOC_021837 NA coding upstream 634345 34764943 ~ 34768352 (+)
XLOC_021844 acp1 coding downstream 6306 35504824 ~ 35537727 (+)
XLOC_021845 NA coding downstream 58672 35557190 ~ 35560512 (+)
XLOC_021846 ccnt1 coding downstream 152253 35650771 ~ 35664505 (+)
XLOC_021847 pmelb coding downstream 174024 35672542 ~ 35690336 (+)
XLOC_021848 NA coding downstream 195754 35694272 ~ 35702721 (+)
XLOC_021833 AL954678.1 non-coding upstream 1399824 34002757 ~ 34002873 (+)
XLOC_021851 NA non-coding downstream 224920 35723438 ~ 35727522 (+)
XLOC_021852 NA non-coding downstream 230737 35729255 ~ 35730062 (+)
XLOC_021854 BX465853.1 non-coding downstream 292290 35790808 ~ 35798279 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000001_02657735_02658754 NA coding CI01000001 null 2657447 ~ 2660601 (+)
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) G207997 NA non-coding NC_048566.1 CM023220.2 95601605 ~ 95601872 (-)
tiger barb (Puntius tetrazona) G159048 LOC107714930,LOC107664105,LOC107593987 non-coding NC_056721.1 CM032090.1 18642262 ~ 18644688 (-)