XLOC_022225 (si:dkeyp-100a5.4)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_022225
gene name si:dkeyp-100a5.4
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 16479489 ~ 16485848 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00043873
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>TCONS_00043874
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>TCONS_00044977
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>TCONS_00044721
CACTTTTTTTCCTGAAGGGGCCAAGGCGGGGAGATTGAACGTGATGCACTCATTTGAATGCTGCATCCAGCTCTGCATTTTCGACCCGCCCCTGCTCTGAAGCTGACTGGCTCCGACCGATCGTGACGTCGCTCCACTTGCGCAAACCTAACCAAAGAGCTTCTTTGACCTAACCAACGATTGCAACGAACACTAGCCAATCAGAGGCAGGTCTTCGCGGAATGCGCGTAGGAAAAGTAAACAAGCTTCTCTTTCGTGGCAGCTGCATGGGTCGCAGTCCTCGTGGACTGTCTCCGACTCGACTTATCAGAGTTTAAAACGTAAAGGTGGGGGTGAAAGTAGATGTAGTAGAAGCATTCAAATGTTTCATAACTAAATTGCAGGAGATTTGCAGATGACACGAGAGGACCAGCTAGTACGACCACAGCCGATAGTCCAGTGAAAGACCAGGGTTTAGCTAGCAGGTTGATGTTGTTCAACTTTGTTTCTGCTCTAACGTTAAACACAAAGACCAATTATGTTGGCATTGCATTTATTGCTCCCAAATTTTAAACTAATACTTTTAGTATAGAAGTGGAACATGACAAATCCAAATACTAATAGAGTTAGTGATATGGCATGAAGacagaataaataattaattaattttaattaaattaacaaattctTGACTTGTTGACTCAGTTATAATATCTCACAATGTACTTAGTAGTAGTAGGCTTGTGGACTGCATTGCGAAGAAATTTTTCTGTTTCTGATTTCACAAACAGTTTATAATAAATCGCCATATAATATGATCTGACACATTGTAAATAACCTTACACAATTATTTATTCTAAATCACtgtacatttgtttatatttcatgCATTGTTGGTTTGTTAATTCACATGAACCTTTACTTAActgacaaaaatattttcaatggTTTTACTGACCAGTGTAATTATGTATTGTAAATATAAAGAAATTTAGAATTTGCAGGTCATTAAAATCTATTACATAAATTCATGTTTTTCTTATATTCTACAAATATACAGGACATTGAAGGAGATGGCATCCAGAGAGACCTGCAGAATTCCACCATGGGCGTATATGTCATCAACAAGGAGGGTGGAGAAATTGGAGCACATGATGACATTTATGTTGAAGGAGAAATCATTCTGGACAACATTGGATCTGTAGCCCAAGCATCTGCAATGATGCTGGGAGTCATCTATGTAGTGAACTTGGCCTACCCCAAAGAGCTGAAATACTCTTATGAATTCATTCAAAATGTGCTCTTGAAAATGGATGGAGAAAGACTTTCCCCCAAAGTCCTTGGACTAAAGAACAAAATCATTGCTGGACTGTAGGATTTCTTCAGCCGCTCATGTAAACGCTGCTAAGCTGCATTTTTAAATCTGGTTTGGGAGGCGATAGAAAACATATAGTATGATGTAAAATGCAGCCCTAGAAAATgtttcaaactgaaaacaaagtGAGTGGTGGACTGTAATACATAGCCACTGGTGTGAACATTTAAAGTTGTCATTGGATTTAGTGGAATATTCACCTGAAATAAAAATTGCAATCCTGTAAATAGGCCAGGTTTCTATCCACACTCAGCACAAaaagtatccatccatccattaacgCCATATGAATTTTAGAAGTTAAGCGCTTTGAGATAAACAGTTGATGATGTCTGCACCATTAAGGCATTGCATAAGAAGAGGACACAATGAGATGACGTCATTAAAAGAGCTCCAGTCAAAGTTCAAACAATGGGGAACCATGTGTAAAACATGAAATTATGACAATTCTTGTTAGTTTCATGTGAGAATGTTACAGCCTCCTCATTGCTTCACACAGATGTGATGTTTTCATTtgacactatttttattttttttagagtaGCTTAAGCTTCAGTGGACATTTAAGTCacgtttcattttatttagtaagTCTGTTTCCATATTTATACACCAACTTTTTCACCTCAGCCAAACATAAAATCTATTTTGTTATataacaatcttttttttaattagtatttttttaatgtaactacaGTTTTTTGTAATTTCAGCATCAGGTCCTCAGTGTGCACTGTGTTGCAGCTGTGGACAGTTCTTGTACTATAGCATTTTTTGTTCTGTATAGTACTGGTGTATTTTGTTACTTGTATATGTTTTGTTGTGTGTTAAAAGGCTTCCCTCCAAagttctcctgtgtgtgtatgtatacagccACTATTGTGAATATTTAAAGCTGCACTAATGATGTTTTGGAATATTGACTCAATGTAAGTTTGCAGTTAAATATAATCTCATGCAAGTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000096904

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00043873 False 393 mRNA 0.37 2 16479489 16484383
TCONS_00043874 False 1853 mRNA 0.37 2 16482869 16485190
TCONS_00044977 False 2544 lncRNA 0.36 1 16483072 16485615
TCONS_00044721 True 2321 lncRNA 0.37 2 16483072 16485848

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_022224 BX511184.1 coding downstream 527513 15946154 ~ 15951976 (-)
XLOC_022223 mrgbp coding downstream 563098 15899693 ~ 15916391 (-)
XLOC_022222 eef1a2 coding downstream 600610 15850938 ~ 15878879 (-)
XLOC_022221 NA coding downstream 715171 15696527 ~ 15764318 (-)
XLOC_022220 NA coding downstream 782440 15690531 ~ 15697049 (-)
XLOC_022226 NA coding upstream 31134 16516982 ~ 16518846 (-)
XLOC_022227 CR318668.1 coding upstream 75385 16561233 ~ 16562161 (-)
XLOC_022228 NA coding upstream 158276 16644124 ~ 16648039 (-)
XLOC_022229 sdcbp2 coding upstream 162773 16648621 ~ 16682186 (-)
XLOC_022230 fkbp1ab coding upstream 202572 16688420 ~ 16692312 (-)
XLOC_022219 NA non-coding downstream 915892 15432413 ~ 15563597 (-)
XLOC_022217 BX537335.1 non-coding downstream 1371527 15107848 ~ 15107962 (-)
XLOC_022231 NA non-coding upstream 207730 16693578 ~ 16709238 (-)
XLOC_022233 AL732515.1 non-coding upstream 258934 16744782 ~ 16746423 (-)

Expression


Co-expression Network