XLOC_022547 (CU571398.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_022547
gene name CU571398.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 36711024 ~ 36754685 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00044470
ATATTGGGCGGGGTTATCAGTGTTTTAGtttttcttcttctcataAATATAGTAGATATTATAGCCAGTGAATAtcattatttcaaaatgttatatttttatacagtgagACTTcaaataattttcttatttaaaggtGGACTCTTTTGTAGTTGCATCGTGTACAGACAAGGACAGACAGaaaaacaaatggaatcatcatggcaaagatattttcaagacacttctatacagcttaaaaaaaag
>TCONS_00045081
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>TCONS_00045082
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000114281

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00044470 False 246 mRNA 0.30 9 36711024 36753195
TCONS_00045081 False 2903 lncRNA 0.33 3 36750938 36754685
TCONS_00045082 True 573 lncRNA 0.47 1 36753702 36754274

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_022545 zbtb39 coding downstream 40655 36660750 ~ 36670369 (-)
XLOC_022544 NA coding downstream 102241 36605744 ~ 36608783 (-)
XLOC_022542 spryd3 coding downstream 118588 36497518 ~ 36592436 (-)
XLOC_022543 FO704757.2 coding downstream 200905 36509997 ~ 36510119 (-)
XLOC_022541 zgc:174906 coding downstream 261913 36443022 ~ 36449111 (-)
XLOC_022549 hipk1a coding upstream 61801 36816486 ~ 36857966 (-)
XLOC_022550 CR926464.2 coding upstream 73787 36828472 ~ 36828588 (-)
XLOC_022551 NA coding upstream 113360 36868045 ~ 36869244 (-)
XLOC_022552 ube2j2 coding upstream 115669 36870354 ~ 36884290 (-)
XLOC_022553 acap3a coding upstream 134228 36888913 ~ 36934944 (-)
XLOC_022538 BX571773.1 non-coding downstream 388900 36322010 ~ 36322124 (-)
XLOC_022535 NA non-coding downstream 432428 36110214 ~ 36278596 (-)
XLOC_022534 BX005254.4 non-coding downstream 615656 36092346 ~ 36095368 (-)
XLOC_022554 CABZ01054876.1 non-coding upstream 205106 36959791 ~ 36959912 (-)
XLOC_022555 NA non-coding upstream 242519 36997204 ~ 37000484 (-)
XLOC_022558 CR762407.1 non-coding upstream 522388 37277073 ~ 37280713 (-)

Expression


Co-expression Network