XLOC_022566


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_022566
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 37721384 ~ 37724683 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00045084
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>TCONS_00045085
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>TCONS_00045086
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>TCONS_00045087
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>TCONS_00045088
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00045084 False 1219 lncRNA 0.33 2 37721384 37724565
TCONS_00045085 False 1180 lncRNA 0.32 2 37722419 37724523
TCONS_00045086 False 1863 lncRNA 0.32 2 37722419 37724556
TCONS_00045087 False 1787 lncRNA 0.32 2 37722419 37724564
TCONS_00045088 True 1340 lncRNA 0.33 2 37722419 37724683

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_022565 tor1l3 coding downstream 146354 37566097 ~ 37575030 (-)
XLOC_022564 tor1l2 coding downstream 174688 37539068 ~ 37546696 (-)
XLOC_022563 tor1l1 coding downstream 185257 37530718 ~ 37536127 (-)
XLOC_022562 NA coding downstream 196330 37523537 ~ 37525054 (-)
XLOC_022561 dnajc16 coding downstream 206891 37493532 ~ 37514493 (-)
XLOC_022567 cd40 coding upstream 98877 37823560 ~ 37835794 (-)
XLOC_022568 CU682811.2 coding upstream 372137 38096820 ~ 38099972 (-)
XLOC_022569 CU682811.1 coding upstream 402769 38127452 ~ 38127569 (-)
XLOC_022570 pfdn4 coding upstream 426710 38151393 ~ 38160024 (-)
XLOC_022571 FO904868.2 coding upstream 604837 38329520 ~ 38330746 (-)
XLOC_022558 CR762407.1 non-coding downstream 440671 37277073 ~ 37280713 (-)
XLOC_022555 NA non-coding downstream 720900 36997204 ~ 37000484 (-)
XLOC_022554 CABZ01054876.1 non-coding downstream 761472 36959791 ~ 36959912 (-)
XLOC_022551 NA non-coding downstream 852140 36868045 ~ 36869244 (-)
XLOC_022573 NA non-coding upstream 748451 38473134 ~ 38647152 (-)
XLOC_022574 NA non-coding upstream 1079190 38803873 ~ 38807512 (-)
XLOC_022575 NA non-coding upstream 1134892 38859575 ~ 38864855 (-)

Expression


Co-expression Network