XLOC_022583 (SIKE1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_022583
gene name SIKE1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 39755641 ~ 39772107 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00044511
aaacacgcTTCTTCTAAGCTTCTGTTTGACGTTTGTCAGTACAGGAAGTTCTTCTAGTTAGTTGACAGCTTTCCTCAATCGATTATCGGAATAGATTTCAGTTTTGTCCTACTGAATATGTAACATATCCTAACATTTGTCTTACTGTATTATTAAGACCCATTCTCGTTGAGGACTGCGGTTGGAGTGTGTTTtcgctgaatgtgtgtgtttttggacgTGAAGCCGACAGACTCGTTGAGGACTGCAGTTTGAGTGTGTTTTCacagagtgagtgagtgagtgagtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtggaggtgAAGCTCTGGTTCTGGACTTACTGAACCCGGTGAGAATGTCATGTTCGCTGGAGAAGGTTTTGGGCGATGCGCGGACGCTTCTGGAGCGGCTCAAAGAGCACGACACCGCGGCTGAGAGCCTCATCGAGCAGTCCAGCGTCCTCGGACAGAAGATCCACAGCATGAAGGAGGTCGGAAACACTCTCCCTGACAAGTACATGGAGGAGAACACCGAGTATCAAGAGCTGTCCAGATACAAGCCTCACGTCCTGCTGAGCCAGGAGAACACCCAAATCAAAGAGCTCCAGCAGGAGAACAGAGAGCTCTGGCTCTCTCTGGAGGAGCACCAGTACGCCTTGGAGCTGATCATGGGCCGATACCGCAAGCAGATGCTGCAGATGATGATGGAGAAGAAAGAGCTGGACACCAAACCTGTGCTCAGTCTTCACCAGAATCATGCCAAGGAGGTTCAAAGCCAGTTGGGACGGATCTGTGAAATGGGTCAAGTAATGCGTCAAGCCGTACAGATGGATGACCAGCACTATTGCTCTGTGAAAGAGCGACTGGCACAGCTTGAGATTGAAAACAAGGAGCTCCGGGGTCTGCTGTCCATCAGCTCTGTGAAGCAGCACAGAGAGGAGAAAAACCCACCGGAGACGACATCTGAGACTGTGGAGAAACAGGAGTCCTAATGGAGGATAATGTTACTTTAGACAGCagtttgtgcatttgtgtgtcagCTGACCTGGTGTCCACTGACACTAATATCTCTATTGGGTTTTCTAGTTTCCTTCAGAACTGTCCTGGCGGTGGTTTTAGCTCTCTTATGTCCGATCATGCACTTTTTCTGATGTTTAATATTAgagttattaatattttagttcAGGAAAGACCCATGACCTCTTTGCTTTTAATAATAGACTCTTGAATCGTTAGGCAGATGTGTGTTATAGATCATTTCTTTCTCTGTTTATGTTTGAATTTTCCAAAGATGtaagtgtttttaattttaaaataagcttttttcgGTCTTAAATTGATTTGTAGCTTCACATTCACTAGGTTTAGAGGGATTGTGGATAGTTCAGCTGAAAATTTTAtattgatttgatgttttgataaatgttggaagccgataaccattgacttccattgtgtttGATTTCTtacaatggaagttaatggttacatgattccaacattctttaaaatatcttcttttgtgtccagcATAAAAAAGTGAGTGtaggtaaacatattttttttttgtgtgaactctcccttttAAATTGATGTTGATAATTTtatgaatgttggaaaccagtaaccactgacttccattgtgttTGATTTCTTACAAGtcgatggttaccggtttccaacattgttcaaaatatcttttttttgtgttcaacataaaaaaagaaactcgTTAAGCCACTTTagtgtgagtaaatgttcatttttgggtgaactctttctTTAAATTGATGttgatatattttgaagaatgttggaaaccgctAACCATTGAATTCCTGTATTTGATttcttacaatggaagtcaattgttacagatttacaacatgcttcaaaatatcttcgtttgtgtttaacataaagaAACTAATCAAGCCACTGGagagttattttgaagaatgttggaaaccggtaaccattgacctccattgtatttgatgttttactatgaaagtcaatagttacaggtgaCCAACGTTCCTCAAAATATTACCCATTGTGTTTGATTTCAGAATATTTCCCATTGTATTTGATTTCTTACTATGGAGGtcgatggttaccagtttccaacattcttcaaaatatctacttttgtgttaagAAACTCATTAAGACACTTTagtgtgagtaaatgttcatttttgggtgaacttccaCTTTAAATTGATGTTGATAAatcttgaagaatgttggaaagcgcTAACCATTTACTTCCGTTGTATTGGATTTCTTACaaaagaagtcaatggttaccagttttcaacattcttcaaaatgtcttcttttgtgtttaacataaaaaagtgAGTGTAAGTAAAcgtaatttttttgtgtgaactcttCCTTTTAAATTGATGTTGATAATTTTATGAATGTTGtaaaccagtaaccactgacttccattgtgttTGATTTCTTACAAGtcgatggttaccggtttccaacattattcaaaatatctttttttttgttcaacataaaaaaagaaactcgTTAAGCCACTTTagtgtgagtaaatgttaatttttgggtgaactctttctTTAAATTGATgttgagatattttgaagaatgttggaagccggtaaccattgacttccattgtgtttAATTTCTtacaatggaagttaatggttacatgattccaacattcttcaaaatgtcttcttttgtgagTAAACgtaaatttttgtgtgaactctcccttttaaattgatgttgatatttttaagaatgttggaaaccagtaaccactgacttccattgtgttTGATTTCTTACAAGTCGATGGTTaccggtttacaacattcttcaaaatatcttttttttgtgttcaacataaaaaaggAAACCCATTAAGCCACTTGAGTGTCAGTAAATAtcaatttttgtgtgaactctccctttaaattgatgttgagatattttgaagaatgttaaaaaccgtAAACCATTGATTTCCAATGTATTTAATGTCTtattatggaagtcgatggttaccggtttacaacattcttcaaaacatcctcttttgtgttcaacataaaaaaagaaactcgTTAAGCCACTTTagtgtgagtaaatgttcatttttgggtgaactctttctTTAAATTGATGttgatatattttgaagaatgttggaaaccggtaaccgtTGACCTCCattgtatttgatgttttactatagaagtcaatagttacaggtgaCCAACGTTCCTCAAAATATTTCCCATTGTATTTGATTTCAGAATATTTCCCATTGTATTTGATTTCAACGTTCCTATTGTATTTgatttcttactatggaagtcgatggttaccagtttccaacattcttcaaaatatcttctttcgtgttcaacataaaaaagaaactcattaagccactttagtgtgagtaaatgttcatttttgggtgaactccccCTTTAAATTGATGTTGATAAATCTTAAAGAATGATGGAAAGcgctaaccattgacttccgttaTATTTGATTTcttacaatagaagtcaatggttaccggttttcaacattcttcaaaatgtcttcttttgtgttcaacattaaaaaaaaaactcattaagcCACTTGagtgttttgggtgaactacccctttaaataagCAGGCGTCTGCGTTGGGAGCGTATTTTGTATATGTGAAAACAGATTAATAACAGGCTCATTAACGAACCTCAACCTCAGATATATTGGTATTGTTAATGTTATATGTATTCTGCGGTATTGCATCTTTAAAGCGTCTCGATGTGATAATCTTGTATGACTTTCACAGTGATGAGAATCCTCTGAAATTTGCCAGtctttattattactgttaattGTTGTATTTTCATCTCAGGAAAGCAATCATGTGTGTCACAGCTGTTATTTTGTATTCttcattatgtaaaataaaataggaaTTCTTTCAGTTTAAATGTGACCGATTTCGTCTTGTATTTAAGTTGCTGTCTGTTTGATGAatcattatatgactgttttgtgATGTAGAATATGCGAGTAAATTTctctttgtgttcatacaacagttctgtctggttctcgaatctgattggctgatagccgtgcgatattcccCTAATAATAGCgcttacagcctcttcacccgtgtgtattactccgcccacgtAGAGTGaccagatcaataaactcactacagtttgacaaatattgcagctgttggacaacataacgTACCTTTAACACTTTTTATGTGAGAATGTCTTTGTTTAGattacaactatgcagtttatgtataaggatagtgcctattttaattatttataatttctgaggcTTTTTCAGGATTAATttttgtgatctcccgattgcaacagagaaatactgggaaatgtctctagactgatgccATTTCACGCCGTTCAGcctaataatcttaaaatgtgagcaaaatcacctgttttgtcatcacttgagataaaatcattcaaacactatagctctaaagtgacgttggtgaattagtaatggcttctgctgttctgacgtcagctgcagatgtgaataaatggcggaagaaagtagttactcttacaaaagcattttgaaacTCTCTGGGCTCTaatttgacggtccatgcacagagcgcaaaacgcagggcgcaaacgctttcagggcgtgtcagaacgcatttttgctaatttaaggacgggaaaatccgttttgcgccg
>TCONS_00044512
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Function

symbol description
sike1 Orthologous to human SIKE1 (suppressor of IKBKE 1).

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-090312-146 Orthologous to human SIKE1 (suppressor of IKBKE 1).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000102199

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00044511 False 4769 mRNA 0.37 6 39755641 39772107
TCONS_00044512 True 3951 mRNA 0.36 6 39756415 39772067

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_022582 micos10 coding downstream 4407 39744369 ~ 39751234 (-)
XLOC_022581 htr6 coding downstream 17586 39730965 ~ 39738055 (-)
XLOC_022580 vwa1 coding downstream 88983 39632397 ~ 39666658 (-)
XLOC_022579 NA coding downstream 220747 39527970 ~ 39534894 (-)
XLOC_022578 NA coding downstream 300519 39415030 ~ 39455122 (-)
XLOC_022584 IYD coding upstream 2824 39774931 ~ 39784368 (-)
XLOC_022585 ppp1r14c coding upstream 35750 39807857 ~ 39849155 (-)
XLOC_022586 NA coding upstream 168133 39940240 ~ 39942116 (-)
XLOC_022587 CU657980.2 coding upstream 172545 39944652 ~ 39945578 (-)
XLOC_022588 CU657980.1 coding upstream 179446 39951553 ~ 39952406 (-)
XLOC_022577 NA non-coding downstream 743279 39011955 ~ 39012362 (-)
XLOC_022576 NA non-coding downstream 805731 38947827 ~ 38949910 (-)
XLOC_022575 NA non-coding downstream 890786 38859575 ~ 38864855 (-)
XLOC_022593 NA non-coding upstream 606546 40378653 ~ 40407945 (-)
XLOC_022594 NA non-coding upstream 687845 40459952 ~ 40506113 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000001_00433013_00435064 NA coding CI01000001 null 433013 ~ 435539 (+)