mtfp1 (LOC106566934)


Basic Information

Item Value
gene id mtfp1
gene name LOC106566934
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048569.1
NCBI id CM023223.2
chromosome length 100798064
location 29304337 ~ 29312328 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021602393.2
CCCTCGGTGTGGCGCATTGCAAGACTTGACTCGCAGCTTCTAGTTGGGACTCTATCTACATGGGGTTAAAGACGAAGCATGGATCAAATTCAAGAAAAAACAAGCAAGGAGGTCGATATTTATCGTGACACATGGGTCCGCTTCTTAGGCTATGCCAACGAGGTGGGAGAGGCCTTCCGTGCCCTGGTGCCAGTGAGTGCTGTATGGGCCACATATGCAGTTGCCACCGTGTATGTTTCCGCTGATGCTGTGGACAAGGGGAAGAAGGCTGCCGTGGAGCATGGTGACAACCCAGGGAAGACAACCAAGGTGGCTGTAGCAGTGGTGGATACGTTTGTATGGCAGGCCCTGGCCTCGGTCGCTATCCCAGGCTTCACCATCAACCGTGTGTGTGCCGCCTCTCTTTACCTCCTGGGCAGAACCACGCGCCTGCCTCTCTCCGTACGCAAGTGGACCACCACGGCCATCGGCCTCTCCACCATCCCCTTCATCATCCACCCCATCGACAGGGGAGTGGACTTCCTGCTGGACTCCAGCCTGCGTAAGGTCTACGGTCAATCTGCAGGAGAGAGGCATGACTAATAAGCACCACGACCACCCTGCAACCTGGTCCTAGTGTCCCTGGCCCGGACAGGTTAGCTCCACCAGGAAATTGACCCCACCCACCCTCTGTCCCAGACAGCACTTCCTCCCAAGCCATCTGAAAACTCTGCTGATCACTCTACTGTAACATCACTGTGAAGCACAAAGCCAATACAGCAGGGTTACTCCACTCCAGTTCTCCAGGGCCACTGTACTGTCTGCCACTTGTCTATGCCCCTCTGTTTATTCCCATCTTTTCATTTTAAACTCCAAGTTAGGGGGACCTATGTTTCTTTGGCCAGTCAATGACTTAGAATCAGGGAGAAAAGGGATCCAATAGACAGTGTTGCCCTCCAGCACTGGAGTTGAATACCTGTGGCTGCTACTGGCCTGCAGAGCCCACCTGTTCATTTTCAGACCTCCACTTGGCATGTATCCAGGTAACTCTTGATGTTAGCCATATTTGGGAATATTCGGGTCACTGTCCTTAGACCTGGCATTAAGGCCCTATTTTCATTACATGTTAACATCTacctttgtttttgtttatttctgCCTCAAAAATAATGTCTTGTACGGTTGTCTGTCACTTTGAATAGATATTTACAGAGTATATTGTGATGCACTTCAATGTTCAGTCTTGAGATTAACCTGAGTGCTTCTTGTCATTTATTACAGAGGTGAACTGAATAGATGTAAGAATTCTTGAGGTTTTGGTTGGCTCTAAAGATTCAGTTACTTTGGTAGCATCTAAGGCATAGAAAGTACTGTAATAGTTGTGTAACATGCCCTATGCAGAATGCATATGAAGGGAATATGCATAAAATACTGTAATTATTGCCAAATATTTAGGCTACTCTGGAAGAGAACCCATCAGTATACAAAGCTGTGCTGCAATATGCAAGGAATCTGAGTCATCTTATTCAAAAATGGGAAATGCTATTGGAATATGTAAATCAGGGCGCTCCAattctgttcctggagagctactgttgTGTATGTTTTTGCTCCAActctaatctagcacacctgattctaataattagctggttgataagctgaatcaacTGGGGTTGGTTTTAAAAcaggttggagagccctgatgtaaaTTAATGTGATATACTTAATTGGGAAATGTTGCCAATTGTTCATACACCAGAACAAATATTTAGCAATACTTTTCATTTAACTTCTCAGTTATAAGTCAACTTCTGTATATTTAATATATTGATTACTTAAAAATGTTTTGTCACCAAAATGCAACATTTTTGTGATATGTTtgaatttttttttctaattattTCCCCACTTAGTCACATAATCAATTTCATATTTCGATATCAATATATTTTCATGCTGGAAACAAGGGAATGTTTAACTGTTGTTAATTTCATAATATGTTTGTTTTAGACTTAAAATTCAAATATGTTTTCAAACCTGCTACTGATGTACATGTACATTTTCTTTTAGTTGTCAGAGAAATTGAAAAAAATGTTCTTTGACAAAATGATAGTAATTTATCATCGAAAGTGAAAGTAATACTGCAATGGGCAGCTATTTAGCTATCCCCTACTCTGAaactgtttaaaaatatatactgtagaaaAACAATATCCTgtattgtatacattttttttttcctgtGCAAACAATTGAACATATTCAACATGTTTTTAAGTTTATCAGTGAGAATACGTTTCTTCATATGTATTCATTTGACACTTGTTTAAATGAAACAGCAACCCCTCATATGCAGCCAAAACACTGTCGCAAATACCCGTAATGTACTTGAACCTTCATAAATCCATACCACAGTACAACATTCCTCATGCTGTGGTGTCAGAAAAAAAGGAGTAACTATGGATGTGTTATGACACACTCATTGGCAACAAGTAGCACAGAACTGTCTCAGTAGCGTTCCTCTGGGGAATATGATTGACAACTCTCACAAAGAGATATTGTTGTGGAATTGTGTTCGTGGTTTGACAATAAGGTCTAACAAGTTGTACAAATTGATGTATTGATTTTAAACAACATTGCACATATTTTTCTCAATGCAGCCAGTCACAGCTTTTATTCCCTGTAGATTGTACGGCCACAACATACATTTACCAATAAAATGCCCACAGTGCCACTGTCAAAGCCAATCACATCAATGACCTCAACGAGCCAAGATTCTAGTTTAAGAAATTTGTCGTGATTGAGTAAGTGATCCACAGCTGACAGCAATTATTTTGATTAGGTGCATTAGCTCATAAAAAGTCCAGGTGGTCTGAGTGCTGGCATATTGTCAGAAAGATGTTGTTTATCCACAGTGTGCTGTTCTTGATGCTTGTGGCCACAGCTGTGGCCCAAACAGGTATGCTAACATATTTGATAACTTGCTAAATGTTTGTGTAAGGTCTGCCTTGAAAATGTTTAAAGTTTGGATTCATTTTAATTTTGCTAATATGGAAACCAATTAAAAGTTGGACAACATTC
>XR_002473468.2
CCCTCGGTGTGGCGCATTGCAAGACTTGACTCGCAGCTTCTAGTTGGGACTCTATCTACATGGGGTTAAAGACGAAGCATGGATCAAATTCAAGAAAAAACAAGCAAGGAGGTCGATATTTATCGTGACACATGGGTCCGCTTCTTAGGCTATGCCAACGAGGTGGGAGAGGCCTTCCGTGCCCTGGTGCCAGTGAGTGCTGTATGGGCCACATATGCAGTTGCCACCGTGTATGTTTCCGCTGATGCTGTGGACAAGGGGAAGAAGGCTGCCGTGGAGCATGGTGACAACCCAGGGAAGACAACCAAGGTGGCTGTAGCAGTGGTGGATACGTTTGTATGGCAGGCCCTGGCCTCGGTCGCTATCCCAGGCTTCACCATCAACCGTGTGTGTGCCGCCTCTCTTTACCTCCTGGGCAGAACCACGCGCCTGCCTCTCTCCGTACGCAAGTGGACCACCACGGCCATCGGCCTCTCCACCATCCCCTTCATCATCCACCCCATCGACAGGGGAGTGGACTTCCTGCTGGACTCCAGCCTGCGTAAGGTCTACGGTCAATCTGCAGGAGAGAGGCATGACTAATAAGCACCACGACCACCCTGCAACCTGGTCCTAGTGTCCCTGGCCCGGACAGGTTAGCTCCACCAGGAAATTGACCCCACCCACCCTCTGTCCCAGACAGCACTTCCTCCCAAGCCATCTGAAAACTCTGCTGATCACTCTACTGTAACATCACTGTGAAGCACAAAGCCAATACAGCAGGGTTACTCCACTCCAGTTCTCCAGGGCCACTGTACTGTCTGCCACTTGTCTATGCCCCTCTGTTTATTCCCATCTTTTCATTTTAAACTCCAAGTTAGGGGGACCTATGTTTCTTTGGCCAGTCAATGACTTAGAATCAGGGAGAAAAGGGATCCAATAGACAGTGTTGCCCTCCAGCACTGGAGTTGAATACCTGTGGCTGCTACTGGCCTGCAGAGCCCACCTGTTCATTTTCAGACCTCCACTTGGCATGTATCCAGGTAACTCTTGATGTTAGCCATATTTGGGAATATTCGGGTCACTGTCCTTAGACCTGGCATTAAGGCCCTATTTTCATTACATGTTAACATCTacctttgtttttgtttatttctgCCTCAAAAATAATGTCTTGTACGGTTGTCTGTCACTTTGAATAGATATTTACAGAGTATATTGTGATGCACTTCAATGTTCAGTCTTGAGATTAACCTGAGTGCTTCTTGTCATTTATTACAGAGGTGAACTGAATAGATGTAAGAATTCTTGAGGTTTTGGTTGGCTCTAAAGATTCAGTTACTTTGGTAGCATCTAAGGCATAGAAAGTACTGTAATAGTTGTGTAACATGCCCTATGCAGAATGCATATGAAGGGAATATGCATAAAATACTGTAATTATTGCCAAATATTTAGGCTACTCTGGAAGAGAACCCATCAGTATACAAAGCTGTGCTGCAATATGCAAGGAATCTGAGTCATCTTATTCAAAAATGGGAAATGCTATTGGAATATGTAAATCAGGGCGCTCCAattctgttcctggagagctactgttgTGTATGTTTTTGCTCCAActctaatctagcacacctgattctaataattagctggttgataagctgaatcaacTGGGGTTGGTTTTAAAAcaggttggagagccctgatgtaaaTTAATGTGATATACTTAATTGGGAAATGTTGCCAATTGTTCATACACCAGAACAAATATTTAGCAATACTTTTCATTTAACTTCTCAGTTATAAGTCAACTTCTGTATATTTAATATATTGATTACTTAAAAATGTTTTGTCACCAAAATGCAACATTTTTGTGATATGTTtgaatttttttttctaattattTCCCCACTTAGTCACATAATCAATTTCATATTTCGATATCAATATATTTTCATGCTGGAAACAAGGGAATGTTTAACTGTTGTTAATTTCATAATATGTTTGTTTTAGACTTAAAATTCAAATATGTTTTCAAACCTGCTACTGATGTACATGTACATTTTCTTTTAGTTGTCAGAGAAATTGAAAAAAATGTTCTTTGACAAAATGATAGTAATTTATCATCGAAAGTGAAAGTAATACTGCAATGGGCAGCTATTTAGCTATCCCCTACTCTGAaactgtttaaaaatatatactgtagaaaAACAATATCCTgtattgtatacattttttttttcctgtGCAAACAATTGAACATATTCAACATGTTTTTAAGTTTATCAGTGAGAATACGTTTCTTCATATGTATTCATTTGACACTTGTTTAAATGAAACAGCAACCCCTCATATGCAGCCAAAACACTGTCGCAAATACCCGTAATGTACTTGAACCTTCATAAATCCATACCACAGTACAACATTCCTCATGCTGTGGTGTCAGAAAAAAAGGAGTAACTATGGATGTGTTATGACACACTCATTGGCAACAAGTAGCACAGAACTGTCTCAGTAGCGTTCCTCTGGGGAATATGATTGACAACTCTCACAAAGAGATATTGTTGTGGAATTGTGTTCGTGGTTTGACAATAAGGTCTAACAAGTTGTACAAATTGATGTATTGATTTTAAACAACATTGCACATATTTTTCTCAATGCAGCCAGTCACAGCTTTTATTCCCTGTAGATTGTACGGCCACAACATACATTTACCAATAAAATGCCCACAGTGCCACTGTCAAAGCCAATCACATCAATGACCTCAACGAGCCAAGATTCTAGTTTAAGAAATTTGTCGTGATTGAGTAAGTGATCCACAGCTGACAGCAATTATTTTGATTAGGTGCATTAGCTCATAAAAAGTCCAGGTGGTCTGAGTGCTGGCATATTGTCAGAAAGATGTTGTTTATCCACAGTGTGCTGTTCTTGATGCTTGTGGCCACAGCTGTGGCCCAAACAGGAGTTCCACGAATAAGATACAGGGTAGACCAGTGGACCATCTCTGTGGAGACTCCACAGAGTTATGACTCAGATGAGCTTCAGCCCTATGACTCAGATGAGCTTCAGCCCTATGACTCAGATGAGCTTCAGCCCTATGACTCAGATGAGCTTCAGACTTATGCCTCAGATGAGCTTCAGCCCTATGAGTCGGATGAGATCCAACCCATTGGATCAGACAAGTCTCTTGGTGCCGATGAACAAGGTGCGCTGATTGAGTCTCCAGTCTGGGTTCTGTTTCTGGTGGTCCCTATGGTGTTATTGACTGCTATGGGAGCTCTGGCTGTGGGTTActacctgtgtgtgtggaggggaggCAGACTAGGCTACCGGCCCCGCAGAGACCTCTTGACAAACGTTTAACCAATTTGCTTTCTGTTTGGTTTGAAAATAAATGTTAGTTCCCTGA

Function

NR:

description
mitochondrial fission process protein 1-like

GO: NA

KEGG:

id description
K17981 MTFP1, MTP18; mitochondrial fission process protein 1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021602393.2 False 3063 mRNA 0.41 4 29304337 29311723
XR_002473468.2 True 3388 mRNA 0.42 6 29304337 29312328

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110523578 LOC106566868 coding upstream 41696 29254638 ~ 29262641 (+)
LOC110523576 LOC106563296 coding upstream 116369 29174319 ~ 29187968 (+)
LOC110523574 LOC106566787 coding upstream 137827 29140833 ~ 29166510 (+)
tmem141 tmem141 coding upstream 168854 29133844 ~ 29135483 (+)
LOC110523572 zmynd19 coding upstream 183110 29116491 ~ 29121227 (+)
LOC110523581 LOC106566935 coding downstream 28950 29341278 ~ 29446180 (+)
LOC110523583 LOC106566936 coding downstream 400600 29712928 ~ 30103090 (+)
tbx5a LOC106566939 coding downstream 429535 29741800 ~ 29763439 (+)
LOC110523590 rab14 coding downstream 547281 29859609 ~ 29902923 (+)
LOC110524747 LOC106567126 coding downstream 792965 30105293 ~ 30112442 (+)
G386918 NA non-coding upstream 8948 29295178 ~ 29295389 (+)
G386846 NA non-coding upstream 26680 29276801 ~ 29277657 (+)
G386815 NA non-coding upstream 106974 29197131 ~ 29197363 (+)
G386814 NA non-coding upstream 107239 29196887 ~ 29197098 (+)
G386959 NA non-coding downstream 52384 29364712 ~ 29364984 (+)
G386962 NA non-coding downstream 55229 29367557 ~ 29367678 (+)
G386964 NA non-coding downstream 64752 29377080 ~ 29377290 (+)
G386965 NA non-coding downstream 65366 29377694 ~ 29377939 (+)
G386973 NA non-coding downstream 74942 29387270 ~ 29387475 (+)
spag8 LOC106566715 other upstream 373406 28926263 ~ 28931410 (+)
G385805 NA other upstream 886782 28416605 ~ 28417555 (+)
G385171 LOC106566130 other upstream 1399606 27904467 ~ 27904731 (+)
G385053 NA other upstream 1597259 27706714 ~ 27707078 (+)
LOC110522888 LOC106566402 other upstream 1620944 27675352 ~ 27719165 (+)
G387516 NA other downstream 584658 29896986 ~ 29898134 (+)
G388019 NA other downstream 974623 30286951 ~ 30287824 (+)
G390184 NA other downstream 2648027 31960355 ~ 31960745 (+)
G390393 NA other downstream 2907853 32220181 ~ 32220533 (+)

Expression


Co-expression Network