LOC110530125 (LOC106568953)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110530125
gene name LOC106568953
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 54058122 ~ 54105410 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_021612959.2
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Function


NR:

description
CREB-regulated transcription coactivator 1-like isoform X4

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021612959.2 True 13561 mRNA 0.44 13 54058122 54105410

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110530126 LOC106569003 coding upstream 21658 54127068 ~ 54131739 (-)
LOC110530134 LOC106568945 coding upstream 268823 54374233 ~ 54377574 (-)
LOC110530139 LOC100194659 coding upstream 337720 54443130 ~ 54445222 (-)
LOC110530140 LOC106568942 coding upstream 340809 54446219 ~ 54465716 (-)
LOC110530141 LOC106568941 coding upstream 372515 54477925 ~ 54485773 (-)
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G722805 LOC106568951 non-coding upstream 75032 54180442 ~ 54185532 (-)
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G722814 NA non-coding upstream 83982 54189392 ~ 54243058 (-)
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G722602 NA other downstream 202057 53803443 ~ 53856065 (-)
G722459 NA other downstream 558392 53495804 ~ 53499730 (-)
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G721275 NA other downstream 1296671 52761039 ~ 52761451 (-)
G722761 NA other upstream 18969 54124379 ~ 54139341 (-)
G722854 NA other upstream 145704 54251114 ~ 54251546 (-)
G722864 LOC106581475 other upstream 176275 54281685 ~ 54281978 (-)
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G723966 NA other upstream 1291214 55396624 ~ 55396885 (-)

Expression



Co-expression Network